The role of ETS proteins in Drosophila lineage formation
ETS proteinlerinin Drosophila soy oluşumundaki rolü
- Tez No: 795778
- Danışmanlar: PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
ETS transkripsiyon faktörü ailesi en büyük transkripsiyon faktörü ailelerinden biridir ve apoptoz, sinir sistemi gelişimi, hücre çoğalması vb. gibi farklı süreçlerde rol oynar. Bu aile, evrimsel korunmuşluğu olan bölgelerinin benzerliklerine göre alt ailelere ayrılmıştır. Bu TF ailesinin bütün üyelerinin rolleri tam olarak bilinmemekle birlikte, aktivatör veya baskılayıcılar rolüne sahiptir. Drosophila larva beyni, Tip II NB, anten lobu NB, mantar gövdesi NB, optik lob NB gibi ayırt edilebilen farklı nöroblast türleri içermektedir. Gelişim sırasında, bu nöroblastlardan nöron ve glia oluşumu ve nöroblastların yenilenmesi, hem zamansal hem de mekansal olarak transkripsiyon faktörleri tarafından sıkı bir şekilde düzenlenmektedir. ETS genlerinden biri olan Pnt, Tip II NB için belirteç olarak kullanılır ve embriyoda glia oluşumunda rol almaktadır. Pnt'nin antagonisti olan Aop, hücre kaderinin belirlenmesinde rol oynamaktadır. Pnt ve Aop arasındaki ilişkide olduğu gibi ETS transkripsiyon faktörlerinin aileler arası ilişkisine göre, ETS genleri soy oluşumunda rol oynayabilir. Bu tez, nöroglial soy oluşumunda ETS transkripsiyon faktörleri tarafından düzenlenen genlere odaklanmıştır. Bu analizlerde, yayınlanmış Drosophila larva verilerinden elde edilen Tip II NB, antennal lob NB veya mantar gövdesi NB örnekleri ile nöron veya glia örnekleri karşılaştırılarak değerlendirilmiştir. Sinir sistemi ile ilgili genler, hem nöron hem de glia karşılaştırmasında bulunan genler arasından seçilerek ETS transkripsiyon faktörleri için promotör analizi yapılarak belirlendi. Daha sonra, sinir sistemi gelişimi sırasında seçilen genlerin düzenlenmesinde ETS TF'lerin potansiyel rolünü aydınlatmak için gen düzenleyici ağlar oluşturulmuştur. Bu sonuçlar, ETS TF'lerin nörorejeneratif tedavilerde anlaşılmasına ve potansiyel kullanımına katkıda bulunabilir.
Özet (Çeviri)
ETS transcription factor family is one of the largest families and plays role in different processes such as apoptosis, nervous system development, cell proliferation etc. This family is divided into subfamilies according to similarities of conserved domains. Drosophila larval brain contains different types of neuroblasts (NB) which can be distinguished from each other such as Type II NB, antennal lobe NB, mushroom body NB, optic lobe NB. During development, neuron and glia formation are tightly regulated by TFs both temporally and spatially. Pnt, is used as a marker for Type II NB and also plays a role in glia formation. The antagonist of Pnt, Aop plays role in cell fate determination. According to the interfamilial relationship of ETS TFs like in Pnt and Aop, ETS genes may play a role in lineage formation. This thesis focused on genes regulated by the ETS TFs in neuroglial lineage formation. Neuron and glia formation was evaluated by comparing either neuron or glia samples with Type II NB, antennal lobe NB or mushroom body NB samples that were obtained from published Drosophila larva transcriptome data. Nervous system related genes were selected from genes that were found both in differentiated neuron and glia in comparison to NBs and promoter analysis was performed for ETS TFs. Thereafter, gene regulatory networks were created to illuminate the potential role of ETS TFs in the regulation of selected genes during nervous system development. These results may contribute to the understanding and potential use of ETS TFs in neuroregenerative treatments.
Benzer Tezler
- The interaction of ETS and GCM transcription factors in glial vs neuronal differentiation
Glial ve nöronal farklılaşmada ETS ve GCM transkripsiyon faktörlerinin etkileşimi
EKİN SÖNMEZ
Doktora
İngilizce
2023
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL KURNAZ
DR. ANGELA GIANGRANDE
- Identification of interferon regulatory factor 4 (IRF4)-interacting proteins in melanoma cell lines
Interferon regulatory factor 4 (IRF4)'ün melanoma hücre hatlarındaki etkileşim partnerlerinin belirlenmesi
EKİN ECE ERKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. NEŞET CEVDET TOLGA EMRE
- The role of Pea3 and Elk1 in neuronal circuits and metastasis
Nöronal devre oluşumu ve metastazda Pea3 ve Elk1'in rolü
MUSTAFA DOĞUKAN METİNER
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- Expression analysis of transcription factors Elk-1 and Pea3
Elk-1 ve Pea3 transkripsiyon faktörlerinin ekspresyon analizleri
ELİF KON
- The study of colorimetric pH probe and optical detection of heme attachment to cyt C by using genetically encoded indicators in living cells
Kolorimetrik pH ölçer çalışması ve genetikle kodlanan floresan indikatörlerle sitokrom C konformasyonlarının belirlenmesi
MEHMET YUNUS GENCEROĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL BAYRAKTAR