Geri Dön

Staphylococcus aureus izolatlarında metisilin direncinin belirlenmesinde sefoksitin disk difüzyon ve phoenix otomatize sisteminin meca/mecc pzr yöntemi ile karşılaştırılması ve pvl gen varlığının araştırılması

Comparison of cefoxitin disc diffusion, phoenix automated system and meca/mecc pcr for detection of methicillin resistance in s.aureus isolates and investigation the presence of pvl genes.

PDF İndir

  1. Tez No: 812192
  2. Yazar: NESLİHAN ARICI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BANU BAYRAKTAR
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bakanlığı
  10. Enstitü: İstanbul Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 83

Özet

Bu çalışmada, S. aureus suşlarında mecA ve mecC genlerinin belirlenmesine dayalı PZR yöntemi altın standart kabul edilerek, sefoksitin disk diffüzyon ve Phoenix (BD, ABD) otomatize sisteminin duyarlılık ve özgüllüklerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Ayrıca tüm suşlarda mecC ve PVL varlığı araştırılmıştır. Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş 179 S. aureus suşu çalışmaya dahil edildi. İzolatların tamamının S. aureus oldukları koloni morfolojisi, Gram boyama, katalaz, koagülaz testleri, Phoenix otomatize sistem kitleri ve multipleks PZR ile spa geninin gösterilmesi ile doğrulandı. Bütün suşlara sefoksitin disk diffüzyon, otomatize sistem ile sefoksitin MİK belirlenmesi ve multipleks PZR uygulandı. Metisilin direncinin belirlenmesinde mecA ve mecC PZR referans metot alınarak sefoksitin disk diffüzyon ve otomatize sistemin duyarlılık ve özgüllüğü değerlendirildi. Aynı zamanda bu izolatlarda PVL toksin geni varlığı araştırıldı. Çalışmaya alınan suşların 91'i mecA geni saptanarak MRSA olarak tanımlandı. MecC geni içeren hiçbir izolat saptanmadı. Sefoksitin disk diffüzyon yöntemi ve otomatize sistemin MRSA tespitindeki duyarlılıkları referans metoda göre sırasıyla % 100, % 100; özgüllükleri % 100, % 93.2 olarak tespit edildi. MRSA'lar içinde PVL pozitiflik oranı % 6.5, MSSA'lar içinde ise % 7.4 olarak bulundu. Çalışmamızdaki verilere dayanarak S. aureus'larda metisilinin direncinin belirlenmesinde sefoksitin disk diffüzyon yönteminin güvenilir bir metot olduğu, aynı zamanda maliyet etkinlik göz önüne alındığında rutin laboratuvar kullanımı için daha uygun olduğu düşünülmüştür. Phoenix otomatize sistemi ile MRSA bulunan izolatlarda ise yanlış pozitif sonuçtan kaçınmak için sefoksitin disk difüzyon yöntemi de beraberinde kullanılmalıdır. İmkân olduğu koşulda üremenin olduğu gün PZR ile mecA ve mecC genin varlığının gösterilmesi metisilin direncinin erken saptanması açısından önerilir.

Özet (Çeviri)

The aim of this study was to compare the specificity and sensitivity of the cefoxitin disk diffusion and Phoenix (BD, ABD) automated system with PCR for the mecA and mecC genes used as the gold standard assay. 179 S. aureus strains isolated from various clinical specimens in Sisli Hamidiye Etfal Research and Training Hospital Microbiology Laboratory were included in the study. All of isolates were verified as Staphylococcus aureus using colony morphology, Gram staining, catalase and coagulase tests, Phoenix kits and spa gene detection by multiplex PCR. Cefoxitin disc diffusion, the automated system and multiplex PCR were applied to all isolates. The specificity and sensitivity of the cefoxitin disk diffusion and Phoenix automated system were evaluated with multiplex PCR for the mecA and mecC genes used as the gold standard assay. These isolates were also tested for presence of PVL. Of the species included in the study, 91 were determined as MRSA since they were mecA positive. The sensitivity of cefoxitin disc diffusion and the automatized system in determining MRSA were 100% and 100% respectively; the specifity of cefoxitin disc diffusion and the automatized system in determining MRSA were 100% and 93.2% respectively. The rate of PVL positivity among MRSA and MSSA strains were found as 6.5% and 7.4 %, respectively. No isolates having mecC gene were detected. Based on data from our study, it was considered that cefoxitin disc diffüsion test is a reliable method in determining of methicillin resistance in S. aureus and more appropriate to perform at routine laboratories in terms of cost and efficiency. Also, the isolates identified as MRSA by the automatized Phoenix system should be detected by cefoxitin disc difüssion test to avoid from false positivity. If possible, the day when the bacterial growth observed, showing the presence of mecA and mecC genes is recommended for early detection of methicillin resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    324390

    Cumhuriyet Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Uygulama ve Araştırma Hastanesi sağlık çalışanlarında S. aureus ve MRSA taşıyıcılığının saptanması ve MRSA tanı yöntemlerinin karşılaştırılması

    Determination of MRSA and S.aureus carriage amoung health care personnel of Cumhuriyet University Health Service Practice and Research Hospital and comparision of MRSA diagnosis methods

    SERPİL KOŞUM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP SÜMER

  2. Tez No

    411944

    Deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni olan toplum ve hastane kaynaklı staphylococcus aureus izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık durumlarının ve panton valentıne leukocıdın toksini sıklığının araştırılması

    Investigation of panton valentine leukocidin toxin frequency and antimicrobial susceptibilities of community and hospital acquired staphylococcus aureus isolates related with skin and soft tissue infections

    TÜLİN DEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. NİLAY ÇÖPLÜ

  3. Tez No

    396538

    Eczanelerde çalışan eczacı ve eczane personelinde staphylococcus aureus burun taşıyıcılığının saptanması, suşların metisilin direnci ve meca geni yönünden araştırılması

    Detection of staphylococcus aureus nasal carriage among pharmacists and pharmacy staff working in privately owned pharmacies, meticillin resistance and meca gene presence of the isolated strains

    HALİL BAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SULHİYE YILDIZ

  4. Tez No

    192465

    Hastane kökenli koagülaz negatif stafilokok suşlarında oksasilin direncinin moleküler ve geleneksel yöntemlerle araştırılması

    Evaluation of oxacillin resistance by traditional and molecular methods in nosocomial strains of coagulase negative staphylococci

    HASAN PEKSEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE YÜCE

    DOÇ. DR. NUR YAPAR

  5. Tez No

    639908

    Çocuk yaş grubunda burun sürüntüsünde MRSA (metisiline dirençli staphylococcus aureus) taşıyıcılığının ve risk faktörlerinin belirlenmesi ile mrsa genotiplendirmesi

    Determination of MRSA(methicillin resistance staphylococcus aureus) nasal colonization and risk factors in 1-15 age group in children and mrsa genotyping

    AYŞE PERVANLAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMaltepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLHAN ASYA TANJU

Geri Dön