Geri Dön

Elucidation of lysosomal cathepsin a in the regulation of autophagy

Lizozomal katepsin a'nın otofajinin düzenlemesindeki rolünün araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 813099
  2. Yazar: SELMAN YANBUL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyoloji, Genetik, Biochemistry, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Lizozomal Katepsin A (CathA), birbirinden bağımsız katalitik ve koruyucu işlevlere sahip çok işlevli bir enzimdir. Lizozomal Katepsin A enzimi, asidik pH koşullarında, vazoaktif peptidler olan endotelin-1, anjiyotensin-1 ve bradikinin ve nöropeptidler olan oksitozin ve substans P'ye karşı hidrolitik aktiviteye sahiptir. Ayrıca Lizozomal CathA enzimi, α-nöraminidaz (Neu1) ve ß-Galaktosidaz (ß-Gal) enzimleri ile lizozomal multienzim kompleksi oluşturarak bu enzimlerin lizozomlarda hidrolitik bozunmadan korur. Lizozomal CathA enzimindeki mutasyonlar, Neu1 ve ß-Gal enzimlerinin sekonder eksiklikleriyle birlikte nadir görülen bir lizozomal depolanma bozukluğu olan Galaktosiyalidoza (OMIM #256540) neden olur. Katalitik olarak aktif olmayan Cathepsin A knock-in fare modeli, CathAS190A, aktif katalitik bölgede serinin alanin amino asitle değiştirildiği nokta mutasyonuna sahiptir. CathAS190A fare modelinin farklı dokularında önceki çalışmalarda kısa biyoaktif peptidlerin birikimi gösterilmiştir. Bu tez çalışmasında, CathAS190A farelerinden türetilen nöroglia ve fibroblast hücre hatlarında otofajik akışın düzenlenmesinde lizozomal CathA enziminin rolünün araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla; otofaji belirteçleri için RT-PCR, Western Blot ve İmmunositokimyasal analizler yapıldı. Tez çalışması sonuçları, katalitik olarak eksik olan CathA'nın, otofajik substratların ikincil birikimi ve otofaji işaretleyici genlerin ekspresyonundaki değişiklikler ile otofajik mekanizmada bozulmaya neden olduğunu göstermiştir. Katalitik olarak aktif olmayan CathA enzimi nedeniyle kısa biyoaktif peptitlerin birikmesi, bozulmuş otofajik akı ile ilişkili olabilir. Otofajiyi indükleyen Rapamisin ve Açlık tedavi koşulları, ikincil otofajik substratların birikiminin temizlenmesiyle katalitik olarak inaktif CathA enzimi nedeniyle bozulmuş otofajik akışı geri döndürebilir.

Özet (Çeviri)

Lysosomal Cathepsin A (CathA) is a multifunctional enzyme with independent catalytic and protective functions. It has a serine carboxypeptidase activity in acidic pH conditions for the degradation of short bioactive peptides that are vasoactive peptides including endothelin-1, angiotensin-I, bradykinin and neuropeptides including oxytocin and substance P. Lysosomal CathA enzyme also forms a lysosomal multienzyme complex (LMC) with α-neuraminidase (Neu1) and ß-Galactosidase (ß-Gal) enzymes to protect them from hydrolytic degradation in lysosomes and due to its protective function. Genetic defects in the lysosomal CathA enzyme causes a rare lysosomal storage disorder, Galactosialidosis (OMIM #256540), with secondary deficiencies of Neu1 and ß-Gal enzymes. Catalytically inactive Cathepsin A knock-in mouse model, CathAS190A has point mutation in the active catalytic site which serine was replace with alanine amino acid. Accumulation of short bioactive peptides has been reported in previous studies in different tissues of the CathAS190A mouse model. In this thesis study, investigation the role of the lysosomal CathA enzyme in the regulation of autophagic flux in neuroglia and fibroblast cell lines derived from CathAS190A mice was aimed. For this aim; RT-PCR, Western Blot and Immunocytochemical analyses were for performed for autophagy markers. Thesis study results have exhibited that catalytically deficient CathA causes the impairment in autophagic machinery with secondary accumulation of autophagic substrates and alterations in the expression of the autophagy marker genes. Accumulation of the short bioactive peptides due to the catalytically inactive CathA enzyme may be related to to impaired autophagic flux. Autophagy-inducing Rapamycin and Starvation treatment conditions may restore the impaired autophagic flux due to catalytically inactive CathA enzyme with the clearance of accumulation of secondary autophagic substrates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    872503

    Investigation of biomarkers using lipidome-based research analysis in sialidosis

    Sialidoz hastalığında lipidom analizi ile biyobelirteçlerin belirlenmesi

    İLKER GÜMÜŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE

  2. Tez No

    760718

    Kanser olgularında ve ailesel kanser yatkınlığı nedeniyle klinik ekzom dizi analizi yapılan olgularda sitokinler ve ilişkili sinyal yolaklarındaki değişiklikler

    Changes in cytokines and related signaling pathways in cases with cancer and familial cancer susceptibility by clinical exome sequencing analysis

    DERYA YAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikBaşkent Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERİDE İFFET ŞAHİN

  3. Tez No

    465028

    Melanogenez sürecinde rol oynayan uzun-kodlanmayan RNA'ların belirlenmesi

    Identification of long-noncoding RNA's involved in melanogenesis

    SİNEM AKGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİKE BELKIZ ERKAN

  4. Tez No

    768254

    Elucidation of the mechanisms that underlie centriolar satellite biogenesis and dynamics

    Sentriyolar satelit biyojenez ve dinamik davranışlarında rol alan mekanizmaların belirlenmesi

    DİLA GÜLENSOY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ELİF NUR FIRAT KARALAR

  5. Tez No

    774648

    Theoretical investigation of CO2 adsorption pathway over N-[3-(trimethoxysilyl)propyl] ethylenediamine-modified mesoporous silica sorbents

    N-[3-(üçmetoksisilil)propil]etilendiyamin ile modifiye edilmiş mezoporlu silica tutucuları üzerinde CO2 adsorpsiyon mekanizmalarının hesaplı yöntemlerle incelenmesi

    İMGE KALKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Kimya MühendisliğiYeditepe Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUĞBA DAVRAN CANDAN

Geri Dön