Geri Dön

Ölüm zamanı tahmininde iskelet kasında mRNA analizi

MRNA analysis in skeletal muscle for postmortem interval estimation

PDF İndir

  1. Tez No: 814332
  2. Yazar: ZARİF ASUCAN ŞENBAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NADİR ARICAN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Adli Tıp, Forensic Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Postmortem interval, mRNA, gen degradasyonu, otopsi, Adli, Genler, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Mikro RNA, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Postmortem değişmeler, Ölüm, Postmortem interval, mRNA, gene degradation, autopsy, Adli, Genes, Reverse transcription polimerase chain reaction, Micro RNA, Polymerase chain reaction, Postmortem changes, Death
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Adli Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Günümüzde, ölüm zamanı tahmininde kullanılan çok sayıda yöntem bulunmasına rağmen yapılan değerlendirmelerde standart sapma oldukça yüksek, dolayısıyla tahmin aralıkları oldukça geniştir. Çalışmada postmortem iskelet kası dokularında yapılacak mRNA (mesajcı RNA) ekspresyon analizinin postmortem intervali (PMI) mevcut yöntemlerden daha kısa standart sapma ile tahmin edebilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Adli Tıp Kurumu Morg İhtisas Dairesi'ne adli otopsi için gönderilen ve ölüm zamanı bilinen olgulardan alınmış psoas majör kası örneklerinde total RNA (ribonükleik asit) RT-PZR (gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu) tekniği ile HIF1A (Hipoksi ile indüklenen faktör 1 alfa), ACTB (Beta-aktin), B2M (Beta-2-mikroglobulin), PPIA (Peptidil izomeraz A) ve GAPDH (Gliseraldehid 3-Fosfat Dehidrogenaz) mRNA ekspresyon düzeyleri ölçülmüştür. Bulgular: Total RNA değerleri ile PMI arasında istatistiksel olarak anlamlı bir korelasyon tespit edilememiştir. B2M Ct (döngü eşik) değerleri ile PMI grupları arasında zayıf negatif korelasyon bulunmaktadır (r = -0,210, p = 0,045). Bununla birlikte aynı genin Ct değerleri ile PMI saat sayıları arasında da zayıf negatif korelasyon bulunmaktadır (r = -0,232, p = 0,027). Normalizasyon amacıyla HIF1A, B2M ve ACTB genleri için elde edilen Ct değerleri RefFinder yazılımı ile sıralanmış ve bu üç gen arasından ACTB'nin en kararlı gen olduğu belirlenmiştir. Sonuç: Adli otopsi şartlarında postmortem ilk 24 saat içerisinde iskelet kasından RNA izole edilebileceği, PMI tahmininde total RNA düzeyinin tek başına güvenilir bir belirteç olmadığı, B2M'nin mutlak değer analizi ile ölçülen mRNA ekspresyon seviyesinin bu amaçla faydalı olabileceği, ACTB'nin postmortem iskelet kası dokusunda referans gen olarak normalizasyon amacıyla kullanılabileceği saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

Objective: Although there are many methods used to estimate the time of death, the standard deviation in the evaluations is quite high, so the estimation intervals are quite wide. In this study, it was aimed to predict the postmortem interval (PMI) with shorter standard deviations than the existing methods by mRNA (messenger RNA) expression analysis in postmortem skeletal muscle tissues. Method: HIF1A (Hipoxy-induced factor 1 alpha), ACTB (Beta- actin), B2M (Beta-2-microglobulin), PPIA (Peptidyl isomerase A) and GAPDH (Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase) mRNA expression levels were measured by RT-PCR (real-time polymerase chain reaction) technique along with total RNA levels. For this purpose, psoas major muscle samples were collected from cases sent to the Morgue Specialization Department of the Forensic Medicine Institute for forensic autopsy and whose time of death is known. Results: There was no statistically significant correlation between total RNA (ribonucleic acid) values and PMI. There was a weak negative correlation between B2M Ct (cycle of threshold) values and PMI groups (r = -0.210, p = 0.045). With this, there is a weak negative correlation between Ct values of the same gene and PMI hour numbers (r = -0.232, p = 0.027). For normalization, Ct values obtained for HIF1A, B2M and ACTB genes were sorted with RefFinder software and it was determined that ACTB was the most stable gene among those three genes. Conclusion: It has been determined that RNA can be isolated from skeletal muscle in the first 24 hours postmortem under forensic autopsy conditions, total RNA level alone is not a reliable marker in the estimation of PMI, and mRNA expression level measured by absolute value analysis of B2M may be useful for this purpose. It has been determined that ACTB can be used as a reference gene in postmortem skeletal muscle tissue for normalization purposes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    192841

    Prostat adenokarsinomlarında psa değerlerinin gleason skor ve klinik evre ile ilişkisi

    The relation between psa and gleason score and clinical phase in prostate adenocarsinoma

    HACI HASAN ESEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    PatolojiSelçuk Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA CİHAT AVUNDUK

  2. Tez No

    930127

    İskeletten ölüm zamanı tahmininde kullanılan yöntemlerin uygulanabilirliğinin değerlendirilmesi üzerine bir araştırma

    A study on the evaluation of the applicability of methods used in estimating time of death from skeletal remains

    İLAYDA ŞAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    AntropolojiAnkara Üniversitesi

    Adli Bilimler Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. AYLA SEVİM EROL

  3. Tez No

    907247

    Kemik dokudan ölüm zamanı tahmininde luminol ve ultraviyole floresans yöntemi kullanımı

    Use of luminol and ultraviolet fluorescence methods for estimation of time of death from bone tissue

    İLAYDA ŞAM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Adli Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NADİR ARICAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE ÜNLÜTÜRK

  4. Tez No

    185109

    Kültür ortamında farklılaşan sıçan ve köpek kemik iliği stroma hücrelerinin, kemik dokusunda yara tamiri üzerine etkileri, stroma hücrelerinin implant materyalleri ile etkileşimi ve yönlendiren faktörler

    The effect of in vitro differentiated rat and dog bone marrow stromal cells on the healing of bone defect, interactions between stromal cells and implant materials and influencing factors

    FEYZAN KURT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İSMET DELİLOĞLU GÜRHAN

  5. Tez No

    229578

    Postmortem interval tahmininde kardiyak Troponin I'nın marker olarak değeri

    Cardiac Troponin I as a marker in the estimation of the postmortem interval

    MUHAMMED ZİYA KIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Adli Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. A. COŞKUN YORULMAZ

Geri Dön