The vital role of the ATG9A gene in the survival of malignant pleural mesothelioma cells
Malign plevral mezotelyoma hücrelerininsağkalımında ATG9A geninin hayati rolü
- Tez No: 830513
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞERİF ŞENTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 149
Özet
Malign Plevral Mezotelyoma (MPM), göğüs duvarı ve akciğerin plevral yüzeyini kaplayan mezotelyal hücrelerden meydana gelen bir kanserdir. Nadir olmasına rağmen, MPM' in küresel etkisi, hastalıkla ilişkili özel terapötik hedefler ve yeni risk faktörlerinin acil olarak belirlenmesi gerekliliğini vurgular. Ancak, MPM'in kanser oluşumunda potansiyel terapötik sonuçları olan genler ve yolakların karakterizasyonu sınırlı kalmıştır. Bu boşluğu doldurmak için laboratuvarımız, birkaç MPM hücre hattında genom çapında CRISPR/Cas9 taraması temelinde moleküler çalışmalar yürütmüştür. Bu yaklaşım ile MPM kanser oluşumunda kritik bir rol oynayan birkaç aday gen belirledik. Kanser hücresi sağkalımı ile ilişkilendirilen bu genlerden biri, otofaji ilişkili 9A (ATG9A) genidir. ATG9A'nın MPM'deki rolünü açıklığa kavuşturmak için CRISPR/Cas9 teknolojisini kullanarak MPM hücrelerinde ATG9A genini susturduk. Çalışmalarımız, ATG9A geninin tükenmesinin hücresel çoğalma üzerinde dramatik bir azalmaya neden olduğunu göstermektedir. Önemli bir şekilde, gözlemlenen fenotipler ATG9A aşırı ifadesi ile kurtarılmıştır. Ayrıca, bu fenotipik değişiklikler reaktif oksijen türleri (ROS) tarafından tetiklenen DNA hasarı tarafından indüklenen hücresel yaşlanma ve apoptoz ile birlikte gelmektedir. ATG9A tükenen hücrelerin tüm genome transkriptomik analizi, hücresel yaşlanma ve apoptoz yolları ile ilişkili gen kümelerini ortaya çıkardı. Son olarak, araştırmamız, ATG9A'nın kanonik ve lipid taşıma, mitofaji gibi non-kanonik işlevlerinin, MPM hücrelerinin sağkalımında önemli bir rol oynadığını vurgulamaktadır. Bu yeni bulgular, MPM patogenezi hakkında daha iyi bir anlayış sağlamakta ve bu zorlu hastalık için ATG9A' yı hedefleyen potansiyel terapötik stratejilere değerli bilgiler sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Malignant pleural mesothelioma (MPM) is a cancer that originates in the mesothelial cells lining the pleural surface of the chest wall and lung. Despite its rarity, the global impact of MPM underscores the urgent need to identify specific therapeutic targets and novel risk factors associated with disease. However, the characterization of genes and pathways involved in MPM carcinogenesis with potential therapeutic implications has been limited. To address this gap, our laboratory has conducted molecular studies based on genome-wide CRISPR/Cas9 screening on MPM cell lines. Through this approach, we identified several candidate genes that potentially play a vital role in MPM carcinogenesis. One of these associated with cancer cell survival is the autophagy related 9A (ATG9A) gene. To elucidate the role of ATG9A in MPM, we employed CRISPR/Cas9 technology to knockout the ATG9A gene in MPM cells. Our studies demonstrate that depletion of ATG9A gene elicits a dramatic reduction in cellular proliferation. Importantly, the observed phenotypes were rescued by ATG9A overexpression. Moreover, these phenotypic changes were accompanied by senescence and apoptosis, likely triggered by DNA damage mediated by reactive oxygen species (ROS). Transcriptomic analysis of ATG9A depleted cells revealed gene clusters associated with cellular senescence and apoptosis pathways. Finally, our research underscores the essential role of both the canonical and non-canonical functions of ATG9A, such as lipid transport and mitophagy, in the MPM survival. These novel findings contribute to a better understanding of MPM pathogenesis and provide valuable insights into potential therapeutic strategies targeting ATG9A.
Benzer Tezler
- The role of leader, organizational structure and culture on the success of agricultural development cooperatives: The grounded theory study
Kooperatif liderlerinin, organizasyon yapısının ve organizasyon kültürünün tarımsal kalkınma kooperatifleri üzerindeki rolü: Gömülü kuram çalışması
CEYDA AKINÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Kamu Yönetimiİstanbul Bilgi ÜniversitesiÖrgüt Psikolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İDİL IŞIK
- Role of small businesses on poverty alleviation in developing countries
Gelişmekte olan ülkelerde küçük işletmelerin yoksulluğun azaltılmasındaki rolü
TAWFIQ IBRAHIM QARUSH
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileriİstanbul Okan Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. UĞUR YOZGAT
- The role of national liberation movements, the inheritance of imperial states and nationalist thought in the growth of democracies in India and Turkey
Başlık çevirisi yok
TOYGAR SİNAN BAYKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
EkonomiUniversity of London - London School of Economics and Political Science - The role of education and cultural policies in the construction of European identity
Avrupa kimliği inşaasında eğitim ve kültür politikaların rolü
AYÇA BOZKIR BENER
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Eğitim ve ÖğretimMarmara ÜniversitesiAvrupa Birliği Siyaseti ve Uluslararası İlişkiler Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NEDİME ASLI ŞİRİN ÖNER
- Çevresel örgütsel vatandaşlık davranışında yeşil insan kaynakları yönetimi uygulamalarının rolü
The role of green human resources management practices in organizational environmental citizenship behavior
ABDELNASIR MOHAMED ALI ELHARARI
