Geri Dön

Bakterilerin yağ-su ara yüzü ile etkileşimlerinin incelenmesi

Investigation of the interactions of bacteria with the oil-water interface

PDF İndir

  1. Tez No: 846759
  2. Yazar: TUĞÇE YAĞMUR ORHAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CANER VURAL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Biyoloji, Biyoteknoloji, Microbiology, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyodegradasyon, biyosürfaktan, yağ/su ara yüzü, biyofilm, kemotaksi, n-dekan, Biyobozunurluk, Biyofilmler, Biyosürfaktanlar, Biyoteknoloji, Kemotaksis, Mikrobiyoloji, Biodegradation, biosurfactant, oil/water interface, biofilm, chemotaxis, n-decane, Biodegradability, Biofilms, Biosurfactants, Biotechnology, Microbiology
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, çevresel örneklerden n-dekana en iyi ve hızlı adsorbe olma yeteneği olan bakteriler izole edilerek, çeşitli fizikokimyasal ve moleküler biyolojik parametreler ile bakteri n-dekan/su ara yüzü etkileşimleri incelenmiştir. Bu amaçla, n-dekan/su ara yüzünde tutunan 12 bakteriyel izolat (Pseudomonas putida OW1, Rhodococcus qingshengii OW2, Prescotella equi OW3, Brevibacillus parabrevis OW4, Paenibacillus lautus OW5, Paenibacillus lautus OW6, Moraxella osloensis OW7, Stutzerimonas stutzeri OW8, Stutzerimonas stutzeri OW9, Stutzerimonas stutzeri OW10, Rhodococcus ruber OW11, Rhodococcus erythropolis OW12) tanılanmıştır. Bu izolatların hidrokarbon parçalama (YPO), hidrokarbona bakteriyel adsorpsiyon testi (HBA), biyosürfaktan tarama analizleri (emülsifikasyon indeksi testi, yağ yayma testi, CTAB agar petri testi), kemotaksi testi, degradasyon ve biyosürfaktan gen analizleri ve n-dekan/su ara yüzünde oluşan biyofilmin reolojik özelliklerinin belirlenmesi amacıyla bazı analizler (FESEM, Pendant drop vb.) gerçekleştirilmiştir. YPO analizine göre tüm izolatların n-dekanı parçalayabildiği tespit edilmiştir. En yüksek %97, en düşük %79 oranında parçalama olduğu tespit edilmiştir. HBA testine göre OW7 ve OW11 suşları dışında diğer suşların hidrofobik olduğu belirlenmiştir. İzolatların hepsinin, farklı kapasitelerde biyosürfaktan ürettikleri gözlemlenmiştir. Yarı-katı ortamda haraketli olan ve hidrokarbona kemotaksi yapan izolatlar tespit edilmiştir. Pseudomonas türlerinin n-dekan/su ara yüzüne hızla adsorbe olduğu ve stabil ve elastik biyofilmler oluşturduğu tespit edilmiştir. OW1 suşu hariç tüm izolatlarda alkan degradasyonundan sorumlu alkB ailesine ait genlerin varlığı tespit edilmiştir. Rhodococcus türlerinde ve OW7 suşunda trehaloz lipid üretiminden sorumlu genlerinin varlığı saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, bacteria with the best and fastest adsorption ability to n-decane were isolated from environmental samples and various physical-chemical and molecular biological parameters and bacterial n-decane/water interface interactions were investigated. For this purpose, 12 bacterial isolates were identified as Pseudomonas putida OW1, Rhodococcus qingshengii OW2, Prescotella equi OW3, Brevibacillus parabrevis OW4, Paenibacillus lautus OW5, Paenibacillus lautus OW6, Moraxella osloensis OW7, Stutzerimonas stutzeri OW8, Stutzerimonas stutzeri OW9, Stutzerimonas stutzeri OW10, Rhodococcus ruber OW11, Rhodococcus erythropolis OW12, which adhered at the n-decane/water interface. Hydrocarbon degradation, bacterial adhesion to hydrocarbon test (BATH), biosurfactant screening analyses (emulsification index test, oil displacement test, CTAB agar plate test), chemotaxis experiment, analyses of degradation and biosurfactant genes, FESEM and Pendant drop visualizations were performed to determine the rheological properties of the biofilm formed at the n-decane/water interface. Hydrocarbon degradation analyses showed that all isolates have ability to degrade n-decane. The highest rate of degradation was 97% and the lowest rate was 79%. It was observed the, OW7 and OW11 isolates are not hydrophobic whereas the other isolates are hydrophobic. Besides, all isolates produced biosurfactant at diverse levels. It was detected that the Pseudomonas genus rapidly adsorbed to the n-decane/water interface and formed stable and elastic biofilms with mobility and chemotaxis experiments. Also, presence of alkB genes which responsible for alkane degradation was detected in all isolates except strain OW1. The presence of genes responsible for trehalolipid production was proved in members of Rhodococcus genus and strain OW7.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    995033

    Effect of extreme conditions on enzyme profiles:cytochrome P450 systems as a case study

    Ekstrem koşulların enzim profilleri üzerindekietkisi: sitokrom P450 sistemleri

    HANDE MUMCU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2026

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER

  2. Tez No

    677353

    Sarı kantaron yağı ve A vitamini katkılı polimer nanolif yara örtüsü malzemelerinin üretimi ve karakterizasyonu

    Production and characterization of wound dressing materials containing hypericum perforatum oil and vitamin A

    FUNDA NUR KAŞIKÇI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELEK MÜMİNE EROL TAYGUN

  3. Tez No

    398063

    Geochemical characterization and prediction of acid mine drainage generation potential of Kure volcanogenic massive sulfide deposits

    Küre volkanojenik masif sülfid yataklarının jeokimyasal karakterizasyonu ve asit maden drenajı üretme potansiyelinin kestirmi

    CANSU DEMİREL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURGÜL ÇELİK BALCI

  4. Tez No

    756016

    Investigation of active microparticle motion at structured oil-aqueous interfaces and microcargo release via interfacial shear

    Yapılandırılmış yağ-su arayüzeylerinde aktif mikroparçacık hareketlerinin incelenmesi ve arayüzey kesme yoluyla mikrokargo salımı

    RAMAZAN UMUT DİNÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Kimya MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRE BÜKÜŞOĞLU

  5. Tez No

    949414

    Targeting and activation of antigen specific CD8+ T cells with peptide-major histocompatibility complex I tetramers

    Peptit-majör histokompatibilite kompleks I tetramerleri ile antijen spesifik CD8+ T hücrelerin hedeflenmesi ve aktivasyonu

    ŞAFAK CEREN USLU ŞIVGIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyoteknolojiHacettepe Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANDE CANPINAR

Geri Dön