0-5 yaş yabancı uyruklu çocuklarda saptanan gastroenterit olgularında rotavirüslerin moleküler tiplendirilmesi
Molecular typing of rotaviruses in gastroenteritis cases detected in foreign children aged 0-5 years
- Tez No: 849934
- Danışmanlar: PROF. DR. TEKİN KARSLIGİL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 79
Özet
Rotavirus (RV), çocukluk çağında görülen viral gastroenteritlerinin sebeplerindendir. Gelişmekte olan ülkelerde mortalite ve morbiditenin en yaygın nedenlerindendir. Bu çalışmada 0-5 yaş yabancı uyruklu çocuklarda saptanan gastroenterit olgularında rotavirüslerin moleküler tiplendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışma Mayıs 2022- Kasım 2023 arasında Gaziantep bölgesinde 0-5 yaş arası 120 yabancı uyruklu çocuklardan dışkı örnekleri toplanarak yapılmıştır. İmmünokromatografik yöntem ile Rotavirus pozitif bulunan, 74 (33 kız, 41 erkek) hastanın örnekleri moleküler yöntemle tiplendirilmiştir.Çalışma Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında gerçekleştirilmiştir. Rotavirus VP7 ve VP4 genlerini amplifiye etmek için ileri (forward) ve geri (reverse) primerler (Macrogen, Kore Cumhuriyeti) kullanılmıştır. Genotiplendirme için de miRCURY LNA™ SYBR Green PCR Kitini kullanan (Qiagen, Hilden, Almanya) Tek Adımlı RT-PCR tekniği uygulanmıştır. Rotavirus antijen pozitifliği saptanan olguların cinsiyetler arasında dağılımı istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır. Çalışmaya alınan yabancı uyruklu çocukların (24) %32.4'ünde P4,(13)%17.6'sında P6,(28) %37.8'inde P8, pozitifliği saptanmıştır. G genotipleri ise örneklerin (24) %32.4'ünde G1, (14)%18.9'unda G4,(17) %23'ünde G9 olarak bulunmuştur. Hastaların hiçbirinde G8 pozitifliği bulunmamıştır. Hem G hem de P tipleri birlikte tespit edilen miks serotiplerde ise(15) %23.8 oranında G1P[8] genotip kombinasyonu görülmüş iken, (6) %9.5 G2P[4] ve G9P[6] saptanmıştır. VP7-G genotiplerinin dağılımı açısından yaş grupları arasında anlamlı farklılık saptanmadı. Kız çocuklarının %9'unda, erkek çocukların %22'sinde P9 genotipi saptanmış olup P9 genotip pozitifliği açısından kız ve erkek çocuklar arasındaki fark anlamlı bulunmuştur (p
Özet (Çeviri)
Rotavirus (RV) is one of the causes of viral gastroenteritis in childhood. It is one of the most common causes of mortality and morbidity in developing countries. The aim of this study was to determine the molecular typing of rotaviruses in gastroenteritis cases detected in foreign children aged 0-5 years. The study was conducted between May 2022 and November 2023 by collecting stool samples from 120 foreign children aged 0-5 years in Gaziantep region. The samples of 74 (33 girls, 41 boys) patients who were found positive for rotavirus by immunochromatographic method were typed by molecular method. The study was carried out in the Microbiology Laboratory of Gaziantep University Şahinbey Research and Application Hospital. Forward and reverse primers (Macrogen, Republic of Korea) were used to amplify rotavirus VP7 and VP4 genes. One Step RT-PCR technique using miRCURY LNA™ SYBR Green PCR Kit (Qiagen, Hilden, Germany) was used for genotyping. The distribution of rotavirus antigen positivity between genders was not statistically significant. P4, P6, P8 positivity was found in 32.4% (24), P6 in 17.6% (13), P8 in 37.8% (28) of the foreign children included in the study. G genotypes were G1 in 32.4% (24), G4 in 18.9% (14), G9 in 23% (17) of the samples. G8 positivity was not found in any of the patients. In mixed serotypes in which both G and P types were detected together, (15) 23.8% G1P[8] genotype combination was observed, (6) 9.5% G2P[4] and G9P[6] were detected. No significant difference was found between age groups in terms of the distribution of VP7-G genotypes. P9 genotype was found in 9% of girls and 22% of boys and the difference between girls and boys in terms of P9 genotype positivity was found to be significant (p
Benzer Tezler
- Ebeveyn destekli ilkokula hazırlık programının yabancı uyruklu çocukların okula uyumuna etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of parental supported primary school preparation program on the school adjustment of foreign children
NİLÜFER YİĞİT
Doktora
Türkçe
2024
Eğitim ve ÖğretimOndokuz Mayıs ÜniversitesiTemel Eğitim Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF MERCAN UZUN
- Antalya'da 2009-2018 yılları arasındaki suda boğulma olgularının adli tıp açısından değerlendirilmesi
Medi̇colegal evaluati̇on of drowni̇ng cases whose autopsi̇es performed in Antalya, in ten years peri̇od between 2009-2018
ABDULLAH BENNA SARIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Adli TıpAkdeniz ÜniversitesiAdli Tıp Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR MUSTAFA KARAGÖZ
- Hastanede yatırılarak tedavi edilen çocuklarda malnütrisyonun hastanede yatış süresi üzerine etkisi
The effect of malnutrition on length of stay in hospitalized children
AYHATUN TOPAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ORKUN TOLUNAY
- Okul psikolojik danışmanlarında zenofobi: Özgecilik ve mültecilere karşı duygusal mesafe değişkenlerine göre bir inceleme
Zenophobia in school psychological counseling: Research of altruism and emotional distance towards the refugees
SONGÜL ÖZYURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Eğitim ve ÖğretimMarmara ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DURMUŞ ÜMMET
- 2010-2015 yılları arasında Adli Tıp Kurumu Ankara Grup Başkanlığı Morg İhtisas Dairesi'nde yapılan yabancı uyruklu otopsilerin etiyolojik ve demografik analizi
Etiological and demographic analysis of foreign national autopsies at the Morgue Department of Forensic Medicine Institute Ankara Group Presidency, between 2010-2015
DURMUŞ ARINÇ İKİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Adli TıpKırıkkale ÜniversitesiAdli Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SALİH MURAT EKE