Kolon poliplerinde ve kolon adenokanserlerinde uzun kodlamayan RNA'ların ekspresyon düzeylerinin karşılaştırılması
Comparison of expression levels of long non-coding RNAs in colon polyps and colon adenocarcinomas
- Tez No: 873997
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ESRA GÜZEL TANOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Adenomatöz polip, biyobelirteç, hiperplastik polip, kolon kanseri, uzun kodlamayan RNA, Adenomatous polyp, biomarker, colon cancer, hyperplastic polyp, long non-coding RNA
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
- Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Amaç: Bu çalışmada, kolorektal kanser (KRK) ile ilişkili olarak karsinom (CA), adenomatöz polip (A) ve hiperplastik poliplerinde (HP) uzun kodlamayan RNA'lardan (lncRNA) CCAT1, CCAT2, HOTAIR, HOTTIP, GAS5, LNCp21, H19 ve MALAT1'in ekspresyon seviyelerinin gruplar arasında karşılaştırılması ve anlamlı değişime uğrayan lncRNA'ların biyokimyasal değerler ile olan ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmada, hiperplastik polip, adenomatöz polip ve adenokarsinom dokularında lncRNA ekspresyon seviyeleri analiz edilmiştir. Hastaların tam kan değerleri, C-reaktif protein (CRP), WBC, nötrofil, lenfosit, hemoglobin (HGB), platelet (PLT), MPV, CA 19-9, CEA ve yaş-cinsiyet verileri ile lncRNA ekspresyon seviyeleri arasındaki korelasyonlar incelenmiştir. Bulgular: HOTTIP, MALAT1, LNCP21, HOTAIR ve H19'un ekspresyon seviyelerinin karsinom dokularında anlamlı derecede yüksek olduğu bulunmuştur. Bu lncRNA'ların yüksek ekspresyon seviyeleri, yüksek CRP ve CA 19-9 seviyeleri gibi inflamatuvar biyomarkırlar ile pozitif korelasyon göstermiştir. GAS5'in ise karsinom dokularında düşük ekspresyona sahip olduğu ve düşük HGB seviyeleri ile negatif korelasyon gösterdiği tespit edilmiştir. CCAT1 ve CCAT2, yüksek platelet ve MPV seviyeleri ile pozitif korelasyon göstermiştir. Sonuç: Çalışmamız, lncRNA'ların KRK'nin erken teşhisinde ve prognozunda aday biyobelirteç olarak kullanılabileceğini göstermektedir. Özellikle HOTTIP, MALAT1, LNCP21, HOTAIR ve H19'un yüksek ekspresyon seviyeleri, bu lncRNA'ların KRK'nin tanı ve tedavisinde önemli rol oynayabileceğini ortaya koymaktadır. Biyokimya kan değerleri ile olan anlamlı korelasyonlar, lncRNA'ların klinik uygulamalarda kullanılabilirliğini desteklemektedir. Bu lncRNA'ların klinik uygulamalarda kullanılması, KRK'nin erken teşhisi ve tedavi stratejilerinin geliştirilmesi için kritik öneme sahiptir.
Özet (Çeviri)
Aim: In this study, it was aimed to investigate the expression levels of long non-coding RNAs CCAT1, CCAT2, HOTAIR, HOTTIP, GAS5, LNCp21, H19 and MALAT1 in colorectal cancer, adenomatous polyp and hyperplastic polyp colon tissues and the correlation of significantly changed lncRNAs with biochemical values. Materials and Methods: In this study, the expression levels of lncRNAs were analyzed in tissues from hyperplastic polyps, adenomatous polyps, and adenocarcinomas. Correlations between lncRNA expression levels and patients' complete blood counts (C-reactive protein (CRP), WBC, neutrophil, lymphocyte, hemoglobin (HGB), platelet, MPV, CA 19-9, CEA) as well as age and gender data were examined. Results: It was found that the expression levels of HOTTIP, MALAT1, LNCP21, HOTAIR, and H19 were significantly higher in carcinoma tissues compared to adenoma and hyperplasia tissues. These high expression levels of lncRNAs showed a positive correlation with inflammatory markers such as high CRP and CA 19-9 levels. GAS5 was found to have low expression in carcinoma tissues and showed a negative correlation with low HGB levels. CCAT1 and CCAT2 showed a positive correlation with high platelet and MPV levels. Conclusion: This study shows that lncRNAs can serve as biomarkers for early cancer diagnosis and prognosis. The high expression levels of HOTTIP, MALAT1, LNCP21, HOTAIR, and H19, in particular, suggest that these lncRNAs may be important in the identification and management of colorectal cancer. The potential clinical utility of lncRNAs is supported by the substantial correlations observed with biochemical blood parameters. Subsequent studies ought to investigate more into the distinct roles of long noncoding RNAs and their connections to biochemical blood values. These lncRNAs' clinical applicability is crucial for the early detection of colorectal cancer (CRC) and the development of personalized treatment strategies.
Benzer Tezler
- Meme kanserli hastalarda integrin linked kinaz (İLK) ekspresyonu ve lenf nodu metastazı ile ilişkisi
Integrin linked kinase (ILK) expression in breast cancer patients and relation to lymph node metastasis
YUSUF ÖZER
- Kolon kanseri ve polip dokusunda glukagon like peptid-2 (GLP-2) reseptör ekspresyonunun değerlendirilmesi
Evaluation of GLP-2 receptor expression in colon cancer and polyp tissue
GÖKSEL BENGİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
GastroenterolojiDokuz Eylül Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MESUT AKARSU
- Kolon poliplerinde adenom-karsinom sekansında SOX-2 ve β-katenin ekspresyonunun yeri ve tanıya katkısının araştırılması
Investigation of SOX-2 and b-catenin expression for diagnosis in adenoma-carcinoma sequence of colon polyps
NESLİHAN ETİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
PatolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İCLAL GÜRSES
- Kolon polipleri ve uzun kodlanmayan RNA (LNCRNA) polimorfizmleri
Investigation of colon polyps and long non-coding RNA (LNCRNA) polymorphisms
SENEM YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
GastroenterolojiManisa Celal Bayar Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELMAS KASAP
DOÇ. DR. SEDA ÖRENAY BOYACIOĞLU
- Kolorektal kanserler,adenomlar ve poliplerde gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile yüksek riskli insan papillomavirüs tiplerinin araştırılması
İnvestigation of high-risk human papillomavirus types by real-time polymerase chain reaction in colorectal cancers,adenomas,polyps
MELİKE ÇAĞLAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYFER BAKIR