Meme kanseri (MCF-7) hücre hattında LC/MS temelli metabolomik ve lipidomik çalışmalar
Metabolomics and lipidomics studies based on LC/MS in breast cancer (MCF-7) cell line
- Tez No: 874538
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA ÇELEBİER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Kimya, Pharmacy and Pharmacology, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Analitik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 126
Özet
Bu tez çalışmasında beş farklı ilaç taşıyıcı nanopartikülün paklitaksel yüklü ve yalın hallerinin MCF-7 kanser hücre hatları üzerindeki etkileri sıvı kromatografisi-kütle spektrometresi (LC/MS) temelli metabolomik, lipidomik ve kısa zincirli yağ asitleri yöntemleri kullanılarak incelenmiştir. Çalışmaların ilk basamağında iki farklı hücre liziz yönteminin karşılaştırılması amacıyla MCF-7 insan meme kanseri hücre hattı örneklerinden elde edilen lizatlar metabolom düzeyinde incelenmiştir. Çalışmanın ikinci basamağında metabolomik veri işleme yöntemlerinin karşılaştırılması amacıyla homojen bir biyolojik materyal olarak insan kan plazmasından yararlanılmış ve model bir hastalık (ektopik gebelik) seçilerek hastalarından toplanan plazma örneklerinde gerçekleştirilen metabolomik çalışmadan elde edilen deneysel veriler iki farklı veri işleme modeli kullanılarak değerlendirilmiş ve sonuçlar tartışılmıştır. İlk iki basamaktan elde edilen bilgiler ışığında çalışmanın üçüncü basamağında paklitaksel yüklü ve paklitaksel yüklenmemiş beş farklı nanopartikülün MCF-7 kanser hücre hatları üzerine tatbiki gerçekleştirilmiş ve elde edilen lizatlar arasındaki farklılıklar LC/MS temelli omik yaklaşımlar ile incelenmiştir. Elde edilen bulgular, farklı nanopartiküllerin paklitaksel yüklü ve yüklü olmayan hallerinin farklı biyokimyasal süreçleri aktive ettiği ve de ilaç taşıyıcı nanosistemler için etkin maddenin biyokimyasal aktivitesinin taşıyıcı sistemden bağımsız olarak değerlendirilmemesi gerektiğini göstermiştir. Bu çalışmada geliştirilen LC/MS temelli metabolomik ve lipidomik yaklaşımlar ileride gerçekleştirilecek olan biyolojik materyal analizlerine kolaylıkla aktarılabilecektir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, the effects of five different drug carrier nanoparticles, both loaded and unloaded with paclitaxel, on MCF-7 cancer cell lines were investigated using liquid chromatography-mass spectrometry (LC/MS)-based metabolomics, lipidomics, and short-chain fatty acids comparison methods. In the first stage of the study, lysates obtained from MCF-7 human breast cancer cell line samples were examined at the metabolome level to compare two different cell lysis methods. In the second stage of the study, metabolomic data processing methods were compared using human blood plasma as a homogeneous biological material, and experimental data obtained from a metabolomic study conducted on plasma samples collected from patients with a model disease (ectopic pregnancy) were evaluated using two different data processing models, and the results were discussed. Based on the information obtained from the first two stages, in the third stage of the study, the application of five different nanoparticles, both loaded and unloaded with paclitaxel, on MCF-7 cancer cell lines was carried out, and the differences between the obtained lysates were examined using LC/MS-based omics approaches. The findings showed that different nanoparticles, both loaded and unloaded with paclitaxel, activated different biochemical processes and that the biochemical activity of the active ingredient should not be evaluated independently of the carrier system in drug carrier nanosystems. The LC/MS-based metabolomic and lipidomic approaches developed in this study can be easily transferred to future biological material analyses.
Benzer Tezler
- Selenyum nano parçacıklarının yeşil sentezi ve anti kanser aktivitesinin incelenmesi
Green synthesis of selenium nano particles and investigation of their anti cancer activity
AHMET KÜMÜRCÜ
- Gıdalarda kullanılmak üzere aroma verici peptit sentezi
Flavour peptide synthesis for using in foods
SEDA AVERBEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVİL YÜCEL
- Investigation of the in vitro and in vivo effects of telomere-targeted new drug candidate compounds on different cancer cell lines
Telomer hedefli yeni ilaç adayı bileşiklerinin farklı kanser hücre hatlarında in vitro ve in vivo etkilerinin incelenmesi
MERVE YILMAZ
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZELİHA GÜNNUR DİKMEN
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERGEI M. GRYAZNOV
- Meme kanserinin moleküler alt tiplerinde hedefleyici peptitin ortak reseptörünün araştırılması
Investigation of the common receptor of a targeting peptide in molecular subtypes of breast cancer
ZEYNEP KILINÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BARBAROS NALBANTOĞLU
DR. ÖĞR. ÜYESİ GAMZE YEŞİLAY
- İki endemik sideritis türü üzerinde fitokimyasal ve biyoaktivite çalışmaları
Phytochemical and bioactivity studies on two endemic sideritis species
RÜMEYSA YÜCER
Doktora
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiFarmakognozi ve Doğal Ürünler Kimyası Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAÇTI TOPÇU