Geri Dön

Adana ve Mersin illerinde domates ve biber yetiştirilen alanlarda tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV)'un saptanması ve karakterizasyonu

Detection and characterization of tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) in tomato and pepper grown areas in Adana and Mersin region

PDF İndir

  1. Tez No: 880019
  2. Yazar: YOUSSEF HAG MOSA
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Domates, Biber, ToBRFV, RT-PCR, Dizi Analizi, Tomato, Pepper, ToBRFV, RT-PCR, Sequence Analysis
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 70

Özet

Bu çalışma, 2022-2024 aralığında Adana ve Mersin illerinde yetiştirilen domates ve biber üretim alanlarında Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV)'nin saptanması ve karakterizasyonu amacıyla yürütülmüştür. Domates ve biber alanlarında simptomatolojik olarak ToBRFV ile bulaşık olduğundan şüphelenilen 45 farklı sera ve açık alanda 115 adet domates ve 51 adet biber bitkisinden olmak üzere toplamda 166 bitkiden sürgün, yaprak ve meyve örnekleri alınmıştır. RT-PCR çalışmaları, ToBRFV'ye spesifik ToBRFV-F ve ToBRFV-R primer çifti kullanılarak yapılmış ve ToBRFV ile bulaşık örneklerden 560 bp büyüklüğünde bandlar elde edilmiştir. PCR testleri sonucunda domates bitkilerinden alınan 40 örnekte (%34,8) ToBRFV saptanırken, biber bitkilerinden alınan örneklerin tamamı ToBRFV bakımından negatif bulunmuştur. TR6 ve TR2 kodlayan izolatlarla yapılan mekanik aşılama çalışmaları sonucunda ToBRFV domates ve biber bitkilerine aktarılmış, domates ve biber bitkilerinin yapraklarında mozaik, sararma, deformasyon gibi belirtiler gözlemlenmiştir. DNA dizileme çalışmalarında, TRy4, TRc9, TR4, TRc11,TR2 ve TR6 kodlu 6 farklı izolat kullanılmış ve dizi analizleri sonucunda, bu izolatlar dünyanın farklı ülkelerinden rapor edilen ToBRFV izolatları ile %99 oranında benzerlik göstermiştir. Bu çalışmada elde edilen izolatlar filogenetik ağaç üzerinde; TRy4, TRc9 izolatları aynı grupta yer alırken, TR4, TRc11, TR2 ve TR6 izolatı farklı bir gruba dahil olmuştur.

Özet (Çeviri)

The study was conducted between 2022 and 2024 in tomato and pepper production areas in the provinces of Adana and Mersin to detect and characterize the Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV). Samples of shoots, fruits, and young leaves were collected from 115 tomato and 51 pepper plants in 45 different fields where plants were suspected to be infected with ToBRFV based on symptoms. RT-PCR tests were performed using the ToBRFV-specific primer pair ToBRFV-F and ToBRFV-R on 166 samples (115 tomato and 51 pepper As a result of PCR tests, ToBRFV was detected at a rate of 34.8% in 40 samples taken from tomato plants, while ToBRFV was found negative in all samples taken from pepper plants. Through mechanical inoculation studies with isolates encoding TR6 and TR2, ToBRFV was transferred to tomato and pepper plants, and symptoms such as mosaic, yellowing, and deformation were observed on the leaves of tomato and pepper plants.. For DNA sequencing, six different isolates (TRy4, TRc9, TR4, TRc11, TR2, and TR6) obtained from survey areas were used. Phylogenetic analysis showed that isolates TRy4 and TRc6 were in the same group, while the other isolates formed a different group when compared to ToBRFV isolates reported from various countries.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    307764

    Adana ve Mersin illerinde domates kloroz virüsü (Tomato chlorosis crinivirus, tocv)'nün saptanması ve moleküler karakterizasyonu

    Detection and molecular characterisation of tomato chlorosis virus (Tomato chlorosis crinivirus, tocv) in Adana and Mersin

    DENİZ PEHLİVAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAADETTİN BALOĞLU

  2. Tez No

    183546

    Hıyar mozaik virüsü (CMV)'nün kavun (CMV-K), domates (CMV-D), biber (CMV-B) izolatlarının biyolojik, serolojik, moleküler yöntemlerle karakterizasyonu ve satellit-RNA'lerin virüs üzerindeki etkisi

    Characterization of melon (CMV-K), tomato (CMV-D), pepper (CMV-B) isolates of cucumber mosaic virus (CMV) by biological, serological, molecular methods and effect of satellite-RNAs on virus

    BEHÇET KEMAL ÇAĞLAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ASİL YILMAZ

  3. Tez No

    193133

    Sigara bırakma tedavisinde kullanılan yöntemlerin başarısını etkileyen faktörler

    Factors that influence the success of smoking cessation methods

    ALEV KARARLI BİNGÜL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Göğüs HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. CAN ÖZTÜRK

  4. Tez No

    183550

    Adana ve Mersin illerinde domates lekeli solgunluk virüsü (tomato spotted wilt virus, TSWV)'nin değişik yöntemlerle saptanması

    Detection of tomato spotted wilt virus (TSWV) in adana and Mersin provinces using different methods

    BİLGE KÜÇÜK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBROĞLU

  5. Tez No

    614948

    Adana ve Mersin illeri domates alanlarında hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, cmv)'nün karakterizasyonu

    Characterization of cucumber mosaic virus (CMV) in tomato areas of Adana and Mersin provinces

    FATİME DAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU

Geri Dön