Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen GSBL üreten Escherichia coli izolatlarında yüksek riskli ST131 llonu, CTX-M-1 ve CTX-M-15genlerinin gerçek zamanlı PCR ile araştırılması

Investigation of high-risk ST131 clone, CTX-M-1 and CTX-M-15 genes in ESBL-producing Escherichia coli isolates from clinical samples by real time PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 935725
  2. Yazar: MURAT AVCI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR ETİZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: β-laktamaz, CTX-M-1, CTX-M-15, E. coli ST131, Gerçek zamanlı PCR, β-Lactamase, CTX-M-1, CTX-M-15, E.coli ST131, Real-time PCR
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Son yıllarda yapılan araştırmalar antimikrobiyal direnç açısından genişlemiş spektrumlu β-laktamaz ürettiği bildirilen Escherichia coli Sekans Tip 131 (ST131) klonal grup izolatlarının yaygınlığını ortaya koymaktadır. Bu çalışmanın amacı, çeşitli klinik materyallerden izole edilen genişlemiş spektrumlu β-laktamaz üreten Escherichia coli izolatlarında ST131 klonu ile CTX-M-1 ve CTX-M-15 genlerine ait oranları Gerçek Zamanlı PCR ile belirlemektir. Çalışmaya Adıyaman Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi mikrobiyoloji laboratuvarında çeşitli klinik materyallerden izole edilen Escherichia coli suşları dahil edilmiştir. Türlerin tanımlanması, konvasyonel ve otomatize yöntemler kullanılarak yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri ve genişlemiş spektrumlu β-laktamaz üretimi otomatize yöntemler ile belirlenmiştir. Çukurova Üniversitesi Balcalı Hastanesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi, Merkez Laboratuvarında ise genişlemiş spektrumlu β-laktamaz üreten Escherichia coli izolatlarının DNA izolasyonu ve Gerçek Zamanlı PCR işlemleri gerçekleştirilmiştir. Genişlemiş spektrumlu β-laktamaz (+) 72 Escherichia coli izolatının Gerçek Zamanlı PCR analizi sonucunda; 44 (%61,1) izolatın ST131 klonu olduğu, 28 (%38,9) izolatın ST131 klonu olmadığı; %84,72 CTX-M-1 ve %77,78 CTX-M-15 genlerinin taşındığı tespit edildi. Antibiyogram testi yapılmış hasta sayısına oranla; ST131(+) olan izolatların dirençli oldukları antibiyotiklerden ilk ikisinin sırasıyla; %67,4 Seftazidim ve %66,7 Sefuroksim oldukları, duyarlı oldukları antibiyotiklerden ilk ikisinin sırasıyla; %66 Amikasin ve %65,2 Nitrofurantion oldukları belirlendi. ST131 (-) olan izolatların, dirençli oldukları antibiyotiklerden ilk ikisinin %41,1 Sefiksim ve %38,6 Sefazolin oldukları, duyarlı oldukları antibiyotiklerden ilk ikisinin sırasıyla; %34 Amikasin, %33,3 Kolistin oldukları ve bir hastada çalışılması sebebiyle Tigesikline %100 duyarlılığın var olduğu tespit edildi. Antibiyogram testi yapılmış olan tüm genişlemiş spektrumlu β-laktamaz (+) Escherichia coli izolatlarında, Amoksisilin/Klavulonat direncinin %68,1 (49/72) ve Gentamisin direncinin %20,8 (15/72) olduğu belirlendi.

Özet (Çeviri)

Recent studies have revealed the prevalence of Escherichia coli Sequence Type 131 (ST131) clonal group isolates, which are reported to produce extended-spectrum β-lactamase in terms of antimicrobial resistance. The aim of this study was to determine the ratios of ST131 clone and CTX-M-1 and CTX-M-15 genes in extended spectrum β-lactamase producing Escherichia coli isolates isolated from various clinical materials by Real Time PCR. Escherichia coli strains isolated from various clinical materials in the microbiology laboratory of Adıyaman University Training and Research Hospital were included in the study. Identification of species was performed using conventional and automated methods. Antibiotic susceptibility tests and extended spectrum β-lactamase production were determined by automated methods. DNA isolation and Real Time PCR of extended spectrum β-lactamase producing Escherichia coli isolates were performed in the Central Laboratory of Çukurova University Balcalı Hospital Health Application and Research Center. As a result of Real Time PCR analysis of 72 extended spectrum β-lactamase (+) Escherichia coli isolates; 44 (61.1%) isolates were ST131 clone, 28 (38.9%) isolates were not ST131 clone; 84.72% carried CTX-M-1 and 77.78% carried CTX-M-15 genes. In proportion to the number of patients with antibiogram test; the first two antibiotics to which ST131(+) isolates were resistant were 67.4% Ceftazidime and 66.7% Cefuroxime, and the first two antibiotics to which they were susceptible were 66% Amikacin and 65.2% Nitrofurantion. Among the ST131 (-) isolates, the first two antibiotics to which they were resistant were 41.1% Cefixime and 38.6% Cefazolin, the first two antibiotics to which they were susceptible were 34% Amikacin and 33.3% Colistin, respectively, and there was 100% sensitivity to Tigecycline due to the study in one patient. In all extended-spectrum β-lactamase (+) Escherichia coli isolates for which antibiogram tests were performed, Amoxicillin/Clavulanate resistance was 68.1% (49/72) and Gentamicin resistance was 20.8% (15/72).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    767750

    Klinik örneklerden izole edilen escherichia coli izolatlarının moleküler epidemiyolojik karakterizasyonuve yüksek riskli ST131 klonunun araştırılması

    Molecular epidemiological characterization of escherichia coli isolates isolated from clinical samples and investigation of HİGH-risk ST131 clone

    ELİF AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN ÇELEBİ

  2. Tez No

    346659

    Çoklu dirençli Escherıchıa colı izolatlarında CTX-M, SHV ve TEM tiplerindeki beta-laktamaz direnç genlerinin moleküler yöntemlerle saptanması

    Molecular detection of CTX-M, SHV and TEM types of betalactamase resistance genes in multiple resistant Escherichia coli isolates

    MÜNEVVER GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL BAL

  3. Tez No

    656983

    Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella SPP. izolatlarının ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin'e fenotipik duyarlılığının belirlenmesi ve direnç genlerinin in house PCR yöntemiyle araştırılması

    Determination of phenotypic susceptibility to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temocillin in which producing extended spectrum beta-lactamase isolates of eschericha coli and klebsiella spp. and investigation of resistance genes by in house pcr method

    ARZU TANRIVERDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiAdıyaman Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLNUR TARHAN

  4. Tez No

    627314

    Farklı kaynaklardan izole edilen CTX-M-15 üreten escherichia coli izolatlarının plazmid replikon tipleri varlığı yönünden incelenmesi

    Investigation of the presence of plasmid replicone types among CTX-M-15 producing escherichia coli isolates from different sources

    ÇAĞLA AZİZOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEMİL KÜREKCİ

    DR. ÖZLEM ÜNALDI

  5. Tez No

    392704

    Üriner sistem enfeksiyonlarında etken olan gram negatif bakterilerin direnç paternleri

    Resistance pattern in gram negative bacteria causing urinary system infections

    AYŞİM BENGÜ KÜÇÜKAKKAŞLAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CUMHUR ÇÖKMÜŞ

Geri Dön