Farklı koşullarda bekletilen sığır karaciğer örneklerinde β-aktin ekspresyonunun RT-qPCR ile karşılaştırılması
Inability to compare β-actin expression with RT-qPCR in bovine liver samples kept under different conditions
- Tez No: 944967
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET TUZCU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Patoloji, Pathology
- Anahtar Kelimeler: Beta-aktin, karaciğer, RT-qPCR, sığır, β-actin, liver, RT-qPCR, bovine
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Patoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 46
Özet
Gen ekspresyon analizleri, hücresel süreçlerin anlaşılması ve hastalıkların moleküler düzeyde aydınlatılması açısından büyük öneme sahiptir. Bu analizlerde sıklıkla kullanılan Kantitatif Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-qPCR), yüksek duyarlılığı sayesinde gen ekspresyon düzeylerinin güvenilir bir şekilde belirlenmesine olanak tanımaktadır. Ancak bu analizlerin başarısı, büyük ölçüde kullanılan biyolojik örneklerin bütünlüğüne bağlıdır. Özellikle ileriye dönük veya arşivleme amaçlı çalışmalarda kullanılan doku örneklerinin saklama ve fiksasyon koşulları, RNA kalitesi üzerinde doğrudan etkili olmaktadır. Bu çalışmada, farklı saklama koşullarının gen ekspresyon analizine etkisini değerlendirmek amacıyla sağlıklı bir sığırdan elde edilen akciğer dokuları, taze, dondurulmuş, otolizli, formalin ile fikse edilmiş, formalinle sabitlenmiş parafine gömülmüş (FFPE) ve alkolle fikse edilmiş gruplar şeklinde hazırlanmıştır. Elde edilen RNA örneklerinde β-aktin genine ait ekspresyon düzeyleri RT-qPCR yöntemiyle analiz edilmiştir. Çalışma bulguları, RNA kalitesi ve gen ekspresyon verimliliğinin saklama koşullarına bağlı olarak anlamlı düzeyde farklılık gösterdiğini ortaya koymuştur. Taze ve dondurulmuş örneklerde en yüksek RNA kalitesi ve amplifikasyon başarısı elde edilirken, özellikle FFPE ve otolizli dokularda düşük ekspresyon düzeyleri saptanmıştır. Sonuçlar, gen ekspresyon analizlerinde güvenilir veriler elde edilebilmesi için, örneklerin uygun saklama koşullarında korunmasının kritik bir faktör olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Gene expression analyses play a critical role in understanding cellular processes and elucidating the molecular basis of diseases. Quantitative Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR), a highly sensitive method, is widely used for measuring gene expression levels. However, the success of such analyses is largely dependent on the integrity of the biological samples used. In particular, the storage and fixation conditions of tissue samples, especially those preserved for long-term or archival purposes, directly affect RNA quality. In this study, lung tissues obtained from a healthy bovine subject were prepared under six different conditions—fresh, frozen, autolyzed, formalin-fixed, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE), and alcohol-fixed—to evaluate the impact of storage conditions on gene expression reliability. Expression levels of the β-actin gene were analyzed using the RT-qPCR technique. The findings revealed that RNA quality and amplification efficiency differed significantly depending on the preservation method. The highest RNA integrity and gene expression efficiency were observed in fresh and frozen tissues, while markedly lower expression levels were detected in FFPE and autolyzed samples. These results indicate that appropriate preservation methods are crucial for obtaining reliable gene expression data, particularly in studies involving archived tissue materials.
Benzer Tezler
- Farklı koşullarda bekletilen sığır akciğer örneklerinde β-aktin ekspresyonunun RT-qPCR ile karşılaştırılması
Comparison of β-actin expression in bovine lung samples stored in different conditions by RT-qPCR
RUMEYSA GÜNGÖR
- Periferik sinirlerde uç-yan onarımlı proksimal güdüğün davranışı (deneysel çalışma)
Başlık çevirisi yok
İRFAN AYAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2001
Ortopedi ve Travmatolojiİnönü ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. O. ARSLAN BORA
- Yaş tayininde kullanılan DNA metilasyon belirteçlerinin yapay oluşturulmuş olay yeri kan örneklerinde uygulanabilirliği
Applicability of DNA methylation markers used in age determination in artificial constructed crime scene blood samples
BÖRTE MÜGE ŞAŞMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaFen Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK
- Contribution a la recherche d'un cadre juridique pour un droit international de laconcurrence plus efficace
Daha etkin bir uluslararası rekabet için hukuki çerçeve arayışı
ALİ CENK KESKİN
Doktora
Fransızca
2009
HukukGalatasaray ÜniversitesiKamu Hukuku Ana Bilim Dalı
PROF. DR. JEAN MARC SOREL
PROF. DR. HALİL ERCÜMENT ERDEM
- Evaluation of the effect of toothpastes with different ingredients on the surface microhardness and surface properties of artificial incipient caries, in vitro
Farklı içerikteki diş macunlarının yapay başlangıç çürük lezyonlarının yüzey mikrosertliğine ve yüzey özelliklerine olan etkisinin in vitro koşullarda değerlendirilmesi
NECMİYE BULAM
Doktora
İngilizce
2021
Diş HekimliğiYeditepe ÜniversitesiÇocuk Diş Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SENEM SELVİ KUVVETLİ
DR. ÖĞR. ÜYESİ KÜBRA TONGUÇ ALTIN