Geri Dön

İnsan dermal fibroblastlarına nitrojen mustard ve 2-kloroetil etil sülfür maruziyetinin metabolomik değerlendirmesi

Metabolomic evaluation of nitrogen mustard and 2-cloroethyl ethyl sulfide exposure to human dermal fibroblasts

PDF İndir

  1. Tez No: 948917
  2. Yazar: ERDİM SERTOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT KENAR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
  10. Enstitü: Gülhane Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi KBRN Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi KBRN Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 97

Özet

Amaç: İki farklı blister ajanı, nitrojen mustard (bis(2-kloroetil)metilamin, HN2) ve 2-kloroetil etil sülfür (CEES), kullanılarak geliştirilen insan dermal fibroblast hücre hattı modelinde IC50 dozlarına 24 ve 48 saat süreyle maruz kalınması ile gelişen metabolik değişiklikleri ve bu süreçlerin ürünü olarak ortaya çıkan metabolom verilerinin değerlendirilmesi ve karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Belirlenen IC50 düzeyleri üzerinden 24. ve 48. saatlerdeki kontrol, HN2 maruziyet ve CEES maruziyet grupları olmak üzere altışar örnekten oluşan toplam altı farklı grup oluşturularak GC-MS ile 125 metabolit için metabolomik analizi gerçekleştirilmiştir. Elde edilen veriler, temel bileşenler analizi ve kısmi en küçük kareler analizi (PLS-DA) yöntemleri ile değerlendirilerek grupların farklılığı gösterilmiştir. Devamında farklılaştırmaya neden olan metabolitlerin bulunması için 'variable important in project' grafiklerinden yararlanılmıştır. En son olarak yolak analizleri yapılmış ve fenotipte en çok hangi yolakların değiştiği tespit edilmiştir. Bulgular: GC-MS ile değerlendirilen 125 metabolitin 70'inin düzeylerinde istatistiksel anlamlı farklılıklar tespit edilmiştir (p0.05). Anlamlı veriler için p0.01 (-log10 ölçeğinde 2) alındığında 14 metabolitin (miristik asit, liksosilamin, D-tagatoz, gliserol, ribonolakton, fosfoserin, oleik asit, palmitoleik asit, pektin, mannitol, alloz, Ofosfoetanolamin, 5-aminopentanoik asit, putresin) artış yönünde değişim gösterirken diğer 14'ünün ise azaldığı (glukonolakton, lizin, sedoheptüloz, 2-keto-L-glukonat, eritroz, metil beta-D-glukopiranosid, ornitin, 4-hidroksikinolin, serin, l-sistein, αketoizovalerik asit, laktik asit, ribitol, pantotenik asit) tespit edilmiştir. Sonuç: Özellikle CEES 48. saat metabolom sonuçlarının belirgin olarak ayrıştığı gözlenmiştir. Kontrol grubu ile karşılaştırıldığında anlamlı metabolitlerin glikolizpentoz fosfat yolağı; pantotenik asit-CoA sentez yolakları; miristik, palmitoleic, oleic asit üzerinden PPARα sistemi gibi hücre canlılığın korunmasında büyük önem taşıyan ana metabolik yolaklarda rol oynayan önemli ara ürünler oldukları belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Aim: The aim of the study is to evaluate and compare the metabolic changes in a human dermal fibroblast cell line model developed using two different blister agents, nitrogen mustard (bis(2-chloroethyl)methylamine, HN2) and 2-chloroethyl ethyl sulfide (CEES), after exposure to IC50 doses for 24 and 48 hours. Materials and Methods: A total of six different groups consisting of six samples each were formed as control, HN2 exposure and CEES exposure groups at 24th and 48th hours based on the determined IC50 levels. Metabolomic analysis was performed for 125 metabolites by GC-MS. The data were evaluated by principal component analysis and partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) to show the differences between the groups. Subsequently, 'variable importance in projection' graphs were used to find the metabolites that cause differentiation. Finally, pathway analyses were performed and it was determined which pathways changed the most in the phenotype. Results: Statistically significant differences were detected in the levels of 70 out of 125 metabolites evaluated by GC-MS (p 0.05). When p 0.01 (-log10 2) is taken for significant data; 14 metabolites (myristic acid, lixosylamine, D-tagatose, glycerol, ribonolactone, phosphoserine, oleic acid, palmitoleic acid, pectin, mannitol, allose, Ophosphoethanolamine, 5-aminopentanoic acid, putrescine) showed an increase while the remaining 14 (gluconolactone, lysine, sedoheptulose, 2-keto-L-gluconate, erythrose, methyl beta-D-glucopyranoside, ornithine, 4-hydroxyquinoline, serine, l-cysteine, αketoisovaleric acid, lactic acid, ribitol, pantothenic acid) were significantly decreased. Conclusion: In particular, it was observed that the 48th hour metabolome results of CEES were significantly differentiated. When compared with the control group, significant metabolites were determined to be important intermediates that play crucial role in the main metabolic pathways that are of great importance in the maintenance of cell viability such as glycolysis-pentose phosphate pathway; pantothenic acid-CoA synthesis pathways; PPARα system via myristic, palmitoleic, oleic acid.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    365867

    Deneysel özofagus ve mide alkali koroziv yanıklarında Hypericum perforatum'un (Sarı kantaron) iyileştirici etkisinin araştırılması

    Investigation hypericum perforatum (St. john's wort) therapeutic effects on the experimental models of esophageal and gastric alkali corrosive burns

    ERKAN GÜVENÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    İlk ve Acil YardımEge Üniversitesi

    Dahili Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. GÜÇLÜ SELAHATTİN KIYAN

  2. Tez No

    365534

    Resveratrolün hücresel yaşlanmanın indüklenmesi ve sirtüinlerin aktivasyonunda rolünün insan dermal fibroblastlarında araştırılması

    Role of resveratrol in induction of cellular senescence and activation of sirtuins on human dermal fibroblasts

    AYTEN KILINÇLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÖZKAN EREN

    YRD. DOÇ. DR. MEHTAP KILIÇ EREN

  3. Tez No

    722285

    Nanotopografik fiber matrikslerin doku iskelesi olarak üretimi ve in-vitro etkinliklerinin incelenmesi

    Production of nanotopographic fiber matrices as tissue scaffold and investigation of their in-vitro effectiveness

    ŞEYMA POYRAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MENEMŞE GÜMÜŞDERELİOĞLU

  4. Tez No

    777202

    Bitkisel içerikli yaşlanma karşıtı nanoformülasyon geliştirilmesi

    Development of herbal nanoformulation for anti-aging application

    ÇİĞDEM ÇETİN ALUÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyomühendislikYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN KILINÇ

  5. Tez No

    929508

    Genom düzenleme araçları kullanılarak insan stromal hücrelerinde modifikasyonların oluşturulması

    Modification of human stromal cells using genome editing tools

    GÖZDE İMREN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    GenetikHacettepe Üniversitesi

    Cerrahi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZİHNİ EKİM TAŞKIRAN

Geri Dön