Geri Dön

D-limonen'in escherichia coli üzerindeki antimikrobiyal etkinliğinin metabolomiks yaklaşımı ile belirlenmesi

Determination of the antimicrobial activity of D-limonene on eschericia coli by metabolomics approach

PDF İndir

  1. Tez No: 954783
  2. Yazar: OYA TEMİZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET FATİH CENGİZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Bu tezde doğal bir monoterpen olan D-limonenin Escherichia coli (E. coli) üzerindeki antimikrobiyal etkileri, hedefsiz (untargeted) Gaz Kromatografisi Kütle Spektrometrisi (GC-MS) tabanlı metabolomik analiz yöntemiyle araştırılmış ve bu aktif maddenin mikroorganizma üzerine potansiyel etkileri değerlendirilmiştir. Çalışmalarda D-limonen'in kuyucuk difüzyon testi ile minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değeri belirlenmiş ve ardından 4000 µL/L olarak belirlenen subinhibitör konsantrasyonda E. coli'ye uygulanarak 6, 12 ve 24 saatlik inkübasyonlara bırakılmıştır. Metabolomik analizler kapsamında E. coli 'de intraselüler ile ekstraselüler fraksiyonlardan metabolitler toplanarak türevlendirilmiş ve GC-MS analizleri gerçekleştirilmiştir. Elde edilen veriler MS-DIAL yazılımı ile değerlendirilmiştir. İstatistiksel değerlendirmeler MetaboAnalyst platformunda gerçekleştirilmiş ve anlamlı farklılık gösteren metabolitler belirlenmiştir. Elde edilen bulgulara göre; biyolojik numunelerin MS-DIAL'de yapılan Kovats (EI) Kütüphane kıyaslamasında çok sayıda metabolit sinyali (feature) elde edilmiş; ancak bu veriler, RT benzerliği, toplam eşleşme skoru ve sinyal/gürültü oranı gibi kalite kriterlerine göre filtrelenmiş ve yalnızca güvenilir şekilde tanımlanan 60 metabolit istatistiksel analizlere dahil edilmiştir. D-limonen uygulaması sonucunda özellikle L-(-)-malik asit, urasil ve 3-aminopropiyonitril gibi metabolitlerde artış, buna karşılık sitrik asit, bütandioik asit (diğer adıyla süksinat), kadaverin ve ornitin gibi metabolitlerde azalma gözlenmiştir (p

Özet (Çeviri)

In this thesis study, the antimicrobial effects of D-limonene, a natural monoterpene, on Escherichia coli (E. coli) were investigated using an untargeted Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS)-based metabolomics analysis method, and the potential effects of this active compound on microorganisms were evaluated. In the studies, the minimum inhibitory concentration (MIC) value of D-limonene was determined using a well diffusion test, and then it was applied to E. coli at a subinhibitory concentration of 4000 µL/L and incubated for 6, 12, and 24 hours. As part of the metabolomic analyses, metabolites were collected from intracellular and extracellular fractions of E. coli, derivatized, and analyzed by GC-MS. The obtained data were evaluated using the MS-DIAL software. Statistical evaluations were performed on the MetaboAnalyst platform, and metabolites showing significant differences were identified. According to the findings; a large number of metabolite signals (features) were obtained in the Kovats (EI) Library comparison of biological samples in MS-DIAL; however, these data were filtered according to quality criteria such as RT similarity, total match score and signal/noise ratio, and only 60 metabolites that were reliably identified were included in the statistical analyses. As a result of D-limonene application, increases were observed in metabolites such as L-(-)-malic acid, uracil, and 3-aminopropionitrile, while decreases were observed in metabolites such as citric acid, butanedioic acid (also known as succinate), cadaverine, and ornithine (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    436307

    Chemical compostion and some biological activities of essential oil from gum of Iraqian Pistacia khinjuk Stocks

    Irakta yetişen Pistacia khinjuk Stoks sakızından elde edilen uçuçu yağların kimyasal içeriği ve bazı biyolojik aktiviteleri

    DERIN NABAZ FISAL FISAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Ormancılık ve Orman MühendisliğiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Orman Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET HAKKI ALMA

  2. Tez No

    489702

    Essential oil analysis of some plant species and antimicrobial activities

    Bazi bitki türlerinin uçucu yağ analizleri ve antimikrobiyal aktiviteleri

    BÜŞRA UMUT OYMAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Beslenme ve DiyetetikYeditepe Üniversitesi

    YRD. DOÇ. HÜLYA DEMİR

  3. Tez No

    635261

    İzole sıçan kalbinde oluşturulan iskemi reperfüzyon hasarı üzerinde D-limonen'in etkileri

    Effects of D-limonene on ischemia-repefusion injury in isolated rat heart

    DAMLA GİZEM SABUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARİF TANJU ÖZÇELİKAY

  4. Tez No

    810313

    Turunçgil kabuğu uçucu yağlarından D-Limonen etken madde zenginleştirilmesi

    Isolation of the active ingredient D-Limonene from citrus peel

    BÜŞRA YAVUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Gıda MühendisliğiHarran Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EYYÜP KARAOĞUL

  5. Tez No

    578908

    Development of formulation containing extract of orange peel and D-limonene

    Portakal kabuğu ekstresi ve D-limonen içeren formülasyon geliştirilmesi

    ÖVGÜ ULUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Eczacılık ve FarmakolojiYeditepe Üniversitesi

    İlaç ve Kozmetik Üretim Teknolojileri Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLENGÜL DUMAN

Geri Dön