Primer immün yetmezliklerde sinyal molekülleri için referans değerlerin belirlenmesi
Establishing reference ranges for molecular signaling pathways in primary immunodeficiencies
- Tez No: 955525
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEVİL OSKAY HALAÇLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Allerji ve İmmünoloji, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Molecular Medicine, Allergy and Immunology, Child Health and Diseases
- Anahtar Kelimeler: Doğuştan İmmün Yetmezlik Kusurları, Fosfo-akım Sitometri, Hücre İçi Sinyal Yolakları, İmmün Fonksiyonel Analiz BAP Hızlı Destek Projesi / Proje ID:21708, Akım sitometrisi, Alerji ve immünoloji, Birincil immün yetmezlik hastalıkları, Hücre içi sinyal peptidleri ve proteinleri, Hücresel yolaklar, Moleküler genetik, İmmünogenetik, Immune Functional Analysis, Inborn Errors of Immunity, Intracellular Signaling Pathways, Phospho-flow Cytometry BAP Rapid Support Project / Project ID: 21708, Flow cytometry, Allergy and immunology, Primary immunodeficiency diseases, Intercellular signaling peptides and proteins, Cellular pathways, Molecular genetic, Immunogenetics
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Pediatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: İmmünoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yılmaz, K., Primer İmmün Yetmezliklerde Sinyal Molekülleri İçin Referans Değerlerin Belirlenmesi, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü İmmünoloji Programı Yüksek Lisans Tezi, Ankara, 2025. Bu tez çalışmasında STAT1, STAT3 ve PI3K sinyal yolakları ilişkili Doğuştan İmmün Yetmezlik Kusurlarının fosfo-akım sitometrik tanı açısından sağlıklı kontrol bireylerde yaşa göre referans değerlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışma için belirlenen bireylerin T ve B lenfositler ile periferik kan mononükleer hücrelerinde (PKMH) uyarımsız ve uyarımlı koşullar altında sinyal ilişkili moleküllerin ifade düzeyleri ile uyarım cevapları değerlendirilmiştir. STAT1 fosforilasyonu için B lenfositlerde bazal seviyede“0-2 Yaş”,“11-17 Yaş”grupları (sırasıyla p=0,005, p=0,004) ve T lenfositlerde IFN-γ uyarım varlığında ise“3-6 Yaş”ve“11-17 Yaş”grupları,“18 Yaş ve Üzeri”grubu ile anlamlı farklılıklar gösterdi (sırasıyla p=0,004, p=0,000). Bazal STAT3 ifadesi“18 Yaş ve Üzeri”erişkin grubuna kıyasla“0-2 Yaş”,“3-6 Yaş”ve“11-17 Yaş”grubunun B lenfositlerinde anlamlı yüksek (sırasıyla p=0,005, p=0,000, p=0,000) ve“3-6 Yaş”grubunun PKMH'lerinde yüksek bulundu (p=0,000). IL-6 ile uyarım varlığında“3-6 Yaş”ve“11-17 Yaş”grubunun PKMH (sırasıyla p=0,000, p=0,003) ve B lenfositlerinde (sırasıyla p=0,003, p=0,001) STAT3 proteinin ifadesinin“18 Yaş ve Üzeri”grubundan anlamlı olarak yüksek olduğu görüldü. IL-6 ile uyarılan T lenfositlerde STAT3 ifadesinde (p=0,017) ve B lenfositlerde STAT3 ifadesine bağlı uyarım cevaplarının hastalar ve sağlıklı kontroller arasında fark gösterdiği bulundu (p=0,014). PI3K sinyal yolağı analizleri kapsamında PKMH'lerde bazal pAKT ifadesinin“3-6 Yaş”grubunda“0-2 Yaş”grubuna kıyasla yüksek olduğu görüldü (p=,004). CD40 ile uyarlan PKMH'lerin p-mTOR ifadesinin“0-10 yaş”grubunun“11-17 yaş”grubuna kıyasla anlamlı derecede yüksek olduğu görüldü (p=0,019.) . PKMH'lerdeki bazal p-mTOR ifadesi sağlıklı ve hasta bireyler arasında fark gösterdi (p=0,017). Sağlıklı ve hasta bireylerin, B lenfositlerindeki bazal pAKT seviyesi (p=0,024), PMA-Ion ve IL-4 ile uyarılan PKMH hücrelerindeki p-mTOR ifadesi (p=0,028) ile B lenfositlerdeki p-AKT ifadesi (p=0,027) anlamlı düzeyde farklılık gösterdi.
Özet (Çeviri)
Yılmaz, K., Establishing Reference Ranges for Signaling Molecules in Primary Immunodeficiencies, Hacettepe University Graduate School of Health Sciences, Immunology Program, Master's Thesis, Ankara, 2025. This thesis aimed to determine age-specific reference values in healthy control individuals for the phospho-flow cytometric diagnosis of Inborn Errors of Immunity (IEI) associated with STAT1, STAT3, and PI3K signaling pathways. Expression levels and stimulation responses of signaling-related molecules were evaluated under both unstimulated and stimulated conditions in T and B lymphocytes and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from selected individuals. For STAT1 phosphorylation, significant differences were observed in basal levels in B lymphocytes between the“0–2 years”and“11–17 years”groups (p=0.005 and p=0.004, respectively), and in T lymphocytes under IFN-γ stimulation between the“3–6 years”and“11–17 years”groups compared to the“18 years and older”group (p=0.004 and p=0.000, respectively). Basal STAT3 expression in B lymphocytes was significantly higher in the“0–2 years,”“3–6 years,”and“11–17 years”groups compared to the“18 years and older”group (p=0.005, p=0.000, and p=0.000, respectively), and was also significantly higher in the PBMCs of the“3–6 years”group (p=0.000). Upon IL-6 stimulation, STAT3 expression was significantly higher in both PBMCs (p=0.000 and p=0.003) and B lymphocytes (p=0.003 and p=0.001) in the“3–6 years”and“11–17 years”groups compared to the adult group. In IL-6-stimulated T lymphocytes, STAT3 expression differed significantly between patients and healthy controls (p=0.017). Likewise, stimulation responses based on STAT3 expression in B lymphocytes also differed significantly between patients and healthy individuals (p=0.014). In the PI3K signaling pathway analyses, basal expression of phosphorylated AKT (p-AKT) in PBMCs was significantly higher in the“3–6 years”group compared to the“0–2 years”group (p=0.004). In CD40-stimulated PBMCs, phosphorylated mTOR (p-mTOR) expression was significantly higher in the“0–10 years”group compared to the“11–17 years”group (p=0.019). Basal p-mTOR expression in PBMCs also differed significantly between healthy and patient groups (p=0.017). Significant differences were also observed in basal p-AKT levels in B lymphocytes (p=0.024), p-mTOR expression in PBMCs stimulated with PMA-Ionomycin and IL-4 (p=0.028), and p-AKT expression in B lymphocytes (p=0.027) between healthy individuals and patients.
Benzer Tezler
- Spesifik T hücre reseptör yolağı yetmezliklerinde immün repertuvar profillerinin belirlenmesi
Determination of immüne repertoire profile in specific T-cell receptor deficiencies
RAHMİ KUTAY ERDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Allerji ve İmmünolojiHacettepe ÜniversitesiPediatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BARAN ERMAN
- Functional analysis of a novel mutation in the cd70 gene leading to primary immunodeficiency disease
Cd70 genindeki primer immün yetersizlik hastalığına sebep olan yeni bir mutasyonun fonksiyonel analizi
SEDEN BEDİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
GenetikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ TOLGA SÜTLÜ
- Nötrofil aktivasyon bozukluğunda etkilenen immünolojik yolakların akım sitometrik uyarım testleri ile araştırılması
Investigation of immunological pathways affected in neutrophil activation disorders by current cytometric stimulation tests
SEVİL ŞİMŞEK
Doktora
Türkçe
2023
Allerji ve İmmünolojiErciyes Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ KÖKER
- Targeting transcription factor binding sites of the interleukin 7 receptor gene using CRISPR/Cas9 genome editing
CRISPR/Cas9 genom mühendisliği ile interlökin 7 reseptör genini kontrol eden transkripsiyon faktörü bağlanma bölgelerinin hedeflenmesi
RONAY ÇETİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyolojiSabancı ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
- Mikobakteriyel enfeksiyona mendeliyen yatkınlığın genetik etiyolojisi ve ilgili gen varyantlarının immünopatogenezdeki rollerinin belirlenmesi
Genetic etiology of mendelian susceptibility to mycobacterial disease and the immunopathogenic roles of the associated gene variants
ASLI KARACAN KONRAT