Mechano-biology based optimal design and fabrication of multi-functional bone scaffolds
Mekanobiyoloji tabanlı optimal tasarım ve çok fonksiyonlu kemik iskelelerinin üretimi
- Tez No: 963507
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLLÜ KIZILTAŞ ŞENDUR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Mühendislik Bilimleri, Bioengineering, Engineering Sciences
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Malzeme Bilimi ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 175
Özet
Kemik iyileşmesi, birden fazla faktörün karmaşık etkileşimini içeren bir süreçtir. Biyoaktif moleküller ve hücrelerle birlikte kullanılan 3 boyutlu kompozit gözenekli doku iskeleleri, kemik dokusunun onarımı için yaygın olarak kullanılmaktadır. Kemik iyileşme sürecinin karmaşıklığı doğrudan iskele özellikleriyle ilişkilidir. Bu iskelelerin etkinliği, büyük ölçüde iyileşme sürecini etkileyen yapısal özelliklerine bağlıdır. Optimal bir kemik doku iskelesi,“uygun”mekanik, biyolojik ve kimyasal özelliklere sahip bir yapı olarak tanımlanabilir. Ancak etkili doku onarımı için ideal iskeleyi tanımlayan özel nitelikler hâlâ net değildir. Bu belirsizlik, doku rejenerasyonunda işlev-özellik ilişkilerinin daha derinlemesine incelenmesini ve aynı zamanda optimal kemik iskelesi tasarımı yapabilecek yöntemlerin geliştirilmesini kritik hâle getirmektedir. Bu tez, etkili kemik iskelelerinin tasarımıyla ilgili zorluklara yanıt vermeyi amaçlamaktadır. Bu kapsamda öncelikle, rijitlik, geçirgenlik ve duvar kayma gerilmesi gibi çoklu iskele metriklerini dikkate alan topoloji optimizasyonuna dayalı otomatik bir tasarım çerçevesi geliştirilmiş ve üretilebilir dereceli gyroid mikro yapılar oluşturulmuştur. Bu yöntemle, optimal rijitliğe, geçirgenliğe ve kontrollü WSS değerlerine sahip kemik iskeleleri tasarlanmış ve üretilmiştir. Ek olarak, optimum gözenek boyutuna sahip iskelelerin tasarımı için tam bağlı analiz modeline dayanan bir boyut optimizasyonu çerçevesi geliştirilmiştir. Bu analiz modeli, sonlu elemanlar yöntemi ile Darcy Kanunu ile katı mekaniğin tam bağlantılı şekilde birleştirilmesini, ayrıca mekanobiyoloji ve hücre difüzyonu dinamiklerinin dâhil edilmesini kapsamaktadır. Bu ikinci tasarım yaklaşımı ile, hücre difüzyonu ve doku rejenerasyonu süreçleri göz önünde bulundurularak, sınırlı duvar kayma gerilmesi sağlanırken aynı zamanda kemik oluşumunu maksimize edecek iskeleler tasarlanmıştır. Son olarak, bu tezde geliştirilen optimizasyon yaklaşımlarına dayanarak yeni iskele tasarımları üretilmiştir. Çoklu metriği karşılayan üretilebilir optimal iskele topolojilerinin ve tasarımlarının elde edilmesi, farklı tasarım gereksinimlerinin bütünleştiği kişiselleştirilmiş iskelelerin geliştirilmesine katkı sağlayacak ve kemik doku mühendisliğinde yenilikçi çözümlerle rejenerasyonu artıracaktır.
Özet (Çeviri)
Bone healing is a process with a complex interplay of several factors. 3-D composite porous tissue scaffolds in combination with bioactive molecules and cells have become popular for the repair of bone tissue. The complexity of the bone healing process can be directly linked to the scaffold characteristics. The effectiveness of these scaffolds is inherently tied to their structural characteristics, which significantly impact the healing process. An optimal bone tissue scaffold can be described as a structure possessing“suitable”mechanical, biological, and chemical properties. However, the specific attributes that define an ideal scaffold for effective tissue repair remain unclear. This gap highlights the critical need for methods capable of designing optimal bone scaffolds and for deeper exploration of property-functional relationships in tissue regeneration. This thesis aims to address these challenges associated with designing effective bone scaffolds by developing first an automated design framework using topology optimization of multi-objective scaffold metrics, including stiffness, permeability, and wall shear stress, and generating manufacturable graded gyroid microstructures. Using this framework, bone scaffolds with optimal stiffness, permeability, and controlled wall shear stress were designed and also fabricated. Additionally, a size optimization design framework based on fully coupled analysis model was developed for designing bone scaffolds with optimal pore size. Here, the FEA-based analysis model is based on coupling Darcy's Law and solid mechanics and incorporating mechano-biology and cell diffusion dynamics. Using the second design scheme, bone scaffolds were further designed to maximize bone regeneration while maintaining limited wall shear stress, taking into account cell diffusion and tissue regeneration processes. Finally, novel scaffold designs were fabricated based on the design frameworks developed in this study. Achieving manufacturable optimal scaffold topologies and designs satisfying multiple metrics will contribute to the development of personalized scaffolds that integrate the interplay of multiple design requirements, facilitating enhanced bone regeneration with innovative solutions in bone tissue engineering.
Benzer Tezler
- Tissue imaging with scanning acoustic microscopy and raman spectroscopy
Taramalı akustik mikroskop ve raman spektrometri ile doku görüntülemesi
MELİTA PARLAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Fizik ve Fizik MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- 3d optical imaging of living cells in microgravity: application to study dynamic changes of cytoskeleton
Canlı hücrelerin mikro çekim altında 3 boyutlu görüntülenmesi: hücre iskeletinin dinamik değişimlerinin çalışılmasında uygulanması
MUHAMMED FATİH TOY
Doktora
İngilizce
2013
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiEcole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CHRISTIAN DEPEURSINGE
DR. MARCEL EGLI
- Biyokompozit substratlarda kültürün mezenkimal kök hücre - kaynaklı ekstrasellüler veziküllere olan etkilerinin incelenmesi
Evaluation of the infuence of culture on biocomposite substrates on mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles
NEZİHA AYŞENUR KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiAnkara ÜniversitesiDisiplinlerarası Kök Hücre ve Yenileyici Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAŞAR MURAT ELÇİN
- Vasculature-on-chip: Characterizing shear stress effects on endothelial cells
Başlık çevirisi yok
ALIREZA TAJEDDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiMekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NUR MUSTAFAOĞLU
- Insights from a 3D culture model : Exploring the synergistic ımpact of tissue stiffness and matrix composition on tumor progression
3B kültür modelinden içgörüler: Doku sertliği ve matris bileşiminin tümör i̇lerlemesi üzerindeki sinerjistik etkisini keşfetmek
DENİZ ÖRNEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyomühendislikKoç ÜniversitesiHücresel ve Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ECE ÖZTÜRK