Gen ifadesinin şebeke modeli
Network of gene experssion
- Tez No: 142764
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE ERZAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
GEN İFADESİNİN ŞEBEKE MODELİ ÖZET Biyolojik sistemlerde protein üretimi, yani gen ifadesi, birebir olmamakta ve genlerin birbirleriyle olan etkileşimleri sonucu ortaya çıkmaktadır. Bu etkileşimler için, seçilim baskısı olmaksızın mutasyon geçiren basit bir modelde, Monte Carlo simülasyonlarıyla, gen etkileşimlerinin ölçekten bağımsız bir şebeke oluşturduğu ve bir gen tarafından baskılanan gen sayısı (z0) dağılımının (z0) ° (ro=0.47±0.01) gibi bir kuvvet yasasına tabi olduğu ve bu şebekenin bir küçük dünya modeline uygun olarak kümelenme katsayısının C « 0.5 olduğu bulundu. Gen etkileşimi şebekesinin bir kinetik Ising modeli biçiminde betimlenmesi durumunda, sistemin tepkimelerinin zaman içinde ölçekten bağımsız bir sönümlenme zamanı dağılımına sahip olabileceği görüldü. Bu kendiliğinden kritik sistemin dinamik davranışını inceleyebilmek için, dinamik renormalizasyon grubu dönüşümleri rastgele Y- komşuluklu spin sistemlerine genelleştirildi.
Özet (Çeviri)
NETWORK OF GENE EXPRESSION SUMMARY We have studied the regulatory network of gene expression during protein synthesis in biological systems. We have intoduced a simple random bit-string model to represent a chromosome sequence and have only considered the inhibition interactions between the genes. As the result of our Monte Carlo simulations, we have found that this simple model gives rise to a network of gene expression which is of the small-world type, with a clustering coefficient C « 0.5, and is scale-invariant with the distribution of out-going connectivities obeying n(zout) ~ (zout) T. The exponent x is found to be x=0.47±0.01. This result shows that the system is complex and can respond on any scale to the sitimuli coming from the environment. This also shows that the system has a self-organized critical behavior. In order to test ideas regarding the distribution of relaxation times on such a network, we have generalized the dynamical renormalization-group calculations to networks with an arbitrary number of nearest neighbors. This will enable us to compute the dynamical exponent on networks with random connections.
Benzer Tezler
- Coronavirüs replikasyonunda TRPC gen ailesinin ifadesinin ve rolünün araştırılması
Expression of TRPC genes family on replication of coronavirus
YOSIF A. ABDUL AL-RAHMAN
- Dek gen ifadesinin multıple miyelom hücrelerine etkisinin araştırılması
Investigating effects of dek gene expression on multiple myeloma cells
ZİHNİ ONUR ÇALIŞKANER
- Kas dokusu tamirinde çözünebilir faktörlerin gen ifadesinin incelenmesi
Gene expression analysis of soluble factors on the course of regenerating muscle tissue
CANSU ÖZDEMİR
- Gebelik hipertansiyonunda endotel koruyucu gen ifadesinin (Gen ürünü proteinlerin ) incelenmesi
Endotelial protective gene expression (Gene product proteins ) investigation related with gestational hypertension
RENGİNAR UZUNOĞLU
- Akut miyeloid lösemi(AML) ve kronik miyeloid lösemi(KML) hastalarında foxo3a gen ifadesinin araştırılması
The ınvestigation of foxo3a gene expression ın acute myeloid leukemia(AML) and chronic myeloid leukemia(KML)
DEMET AKDENİZ
