Gibbs örneklemesi ile buzağılama güçlüğü ve ölü doğum eşikli özelliklerine ilişkin genetik parametrelerin tahminlenmesi
Estimation of genetic parameters of calving ease and stillbirth as threshold traits by using gibbs sampling
- Tez No: 197419
- Danışmanlar: PROF. DR. YAVUZ AKBAŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, İstatistik, Agriculture, Statistics
- Anahtar Kelimeler: Eşikli özellikler, Gibbs Örneklemesi, buzağılama güçlüğü, ölüdoğum, tek özelliğin analizi, iki özelliğin analizi, Threshold traits, Gibbs Sampling, calving difficulty, calving ease, dystocia, stillbirth, univariate analysis, bivariate analysis
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 183
Özet
Bu çalışmada, Gibbs örneklemesi yöntemi ile eşikli özellikler olan buzağılamagüçlüğü ve ölü doğuma ait genetik parametrelerinin tahminlemesi yapılmıştır.Araştırmada, 2003-2005 yılları arasında Amerika Birleşik Devletleri'ndeki 3980adet Siyah Alaca sürüsünde bulunan 1-6 laktasyondaki 404460 adet bireye ait 4kategorili buzağılama güçlüğü ve 2 kategorili ölü doğum kayıtları kullanılmıştır.Buzağılama güçlüğü, hem dört kategorili, hem de ilk iki ve son iki kategoribirleştirilerek iki kategorili olarak analiz edilmiştir. Buzağılama güçlüğü ve ölüdoğumun tek tek ve bir arada analizleri, baba ve baba+MGS modelleri kullanılarakgerçekleştirilmiştir. Analizlerde Gibbs Örneklemesi metodu kullanılmıştır. Bu metot,özelliklere ait ön dağılımın olabilirlik fonksiyonlarıyla birleştirilmesi sonucu elde edilenson dağımlar üzerinden tahminleme yapmaktadır. Tüm özellikler için baba vebaba+MGS modelleri kullanılarak varyans komponentleri ve bunlara bağlı olarakkalıtım dereceleri tahminlenmiş, özellikler ve genetik komponentler arası genetikkorelasyonlar tahmin edilmiştir.ki ve çok kategorili buzağılama güçlüğünün baba modeli ile ayrı ayrı analizlerisonucu direkt kalıtım dereceleri, sırasıyla 0,08 ve 0,06 olarak tahminlenmiştir. Babamodelinin ölü doğuma uygulandığı durumda ise kalıtım derecesi tahmini 0,04 olarakbulunmuştur.ki ve çok kategorili buzağılama güçlüğünün baba+MGS modeli ile ayrı ayrıanalizlerinde direkt kalıtım derecesi tahminleri ise sırasıyla; 0,08 ve 0,06 olarakbulunurken, ana üzerinden bu iki özelliğin kalıtım dereceleri 0,05 ve 0,04düzeylerinde tahminlenmiştir.Baba modeli kullanılarak buzağılama güçlüğü ve ölü doğumun birlikteanalizinde direkt kalıtım derecesi tahminleri, sırasıyla 0,06 ve 0,04 olarak bulunmuş,baba+MGS modelinde ise bu değerler 0,04 ve 0,07 olarak tahminlenmiştir.Her iki özellik için de direkt ve ana etkileri arasındaki genetik korelasyonlardüşük düzeyde ve negatif bulunurken, buzağılama güçlüğü ve ölü doğum arasındakigenetik korelasyon ise 0,79 düzeyinde tahminlenmiştir.Sonuç olarak, incelenen özellikler için tahmin edilen kalıtım dereceleri,modellere göre büyük oranda değişmemesine rağmen, buzağılama güçlüğü ve ölüdoğum özelliklerinin birbirleriyle ilişkili olması nedeniyle bu iki özelliğin birlikte elealındığı iki özellikli model tavsiye edilmiştir. Diğer taraftan, anaya ait genetik etkilerinmodele katkısı da düşünülerek, bu çalışmada ele alınan modeller içinden iki özelliğinbirlikte baba+MGS modeli ile analizi tavsiye edilmiştir.
Özet (Çeviri)
This study was conducted to estimate genetic parameters of calving ease andstillbirth as threshold traits by using Gibbs sampling.In this research, calving ease scores with four categories and stillbirth scoreswith two categories obtained from 404460 animals in 1-6 lactations raised between200-2005 years in 3980 Holstein herds in United States.Calving ease, both four categories and two categories as first two and last twocategories are combined, were analyzed. Calving ease and stillbirth were analyzedas univariate and bivariate models with sire and sire+MGS models. In the analysis,Gibbs Sampling method is used. This method uses posterior density combining byprior densities and likelihood for the traits. For all traits, variance components,heritabilities and genetic correlations between traits and between geneticcomponents were estimated by using sire and sire+MGS models.Direct heritability estimates for binary and ordered calving ease by usingunivariate sire model were 0.08 and 0.06, respectively. Also, the heritability estimatefor stillbirth from univariate sire model was 0.04.Direct heritability estimates for binary and ordered calving ease from univariatesire+MGS model were 0.08 and 0.06, respectively, and maternal heritability of thesetwo traits were 0.05 and 0.04.Direct heritability estimates for calving ease and stillbirth from bivariate siremodel were 0.06 and 0.04. However, they were 0.04 and 0.07 from bivariatesire+MGS model.For each trait genetic correlations between direct and maternal effects were lowand negative, however genetic correlation between calving ease and stillbirth was0,79.In conclusion, although there were no big differences between heritability oftraits obtained from different models, bivariate model is recommended because of therelationship between calving ease and stillbirth. Because of contribution of maternalgenetic effects to the models, bivariate sire+MGS model is recommended.
Benzer Tezler
- Ceylanpınar Tarım İşletmesi siyah alaca sığır popülasyonunda süt verimi ile ilgili genetik parametrelerin bayesian ve REML yöntemleriyle tahmini
Prediction of genetic parameters related to milk yields of holstein friesian population reared in the Ceylanpınar Agricultural State Farm by bayesian and REML methods
ADNAN ÜNALAN
- Comparison of multicarrier CDMA with successive interference cancellation and interference cancellation with GIBBS sampler
Çok taşıyıcılı CDMA sisteminde, başarılı girişim silme ile GİBBS örneklemesi ile girişim silmenin karşılaştırılması
MURAT YILMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiElektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİN ANARIM
- Tavuklarda yumurta ağırlığından sorumlu major gen varlığının Bayesçi segregasyon analizi ile incelenmesi
Investigation of the major gene presence responsible for egg weight in chicken, with dealer segregation analysis
FATMA FULYA ÇETİN
- Farelerde canlı ağırlık ve yem tüketiminden sorumlu major gen varlığının segregasyon analizi ile incelenmesi
Investigation on the existence of major gene responsible for body weight and feed intake using a segregation analysis in a mice population
ISSAM MOSLEM
- Tensor decomposition models for knowledge graphs
Bilgi grafikleri için tensör ayrıştırma modelleri
SEMİH AKBAYRAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolBoğaziçi ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ TAYLAN CEMGİL
