Geri Dön

Isolation, molecular characterization of food-borne drug resistant Salmonella spp. and detection of class 1 integrons

İlaç dirençliliği gösteren gıda kaynaklı Salmonella spp. suşlarının izolasyonu, moleküler karakterizasyonu ve sınıf 1 integronların araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 201722
  2. Yazar: MÜRŞİDE DİLEK AVŞAROĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FARUK BOZOĞLU, PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Genetics, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Salmonella, antimikribiyel dirençlilik, lateral gen transferi, Salmonella, antimicrobial resistance, lateral gene transfer
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 168

Özet

Bu çalısmada, Türkiye'de gıdalardan izole edilen 59 adet epidemiyolojik açıdan farklı Salmonella susu ve Almanya Ulusal Salmonella Referans Laboratuvarlarından elde edilen 49 adet Salmonella susu analiz edilmistir. Susların karakterizasyonu için serotiplendirme, faj tiplendirmesi, antibiyotiplendirme ve moleküler biyolojik karakterizasyon gibi analizler yapılmıstır. Türk izolatları en yaygını S. Enteritidis serotipi ve PT21 faj tipi olmak üzere 17 farklı serotip göstermistir. En yüksek dirençlilik Türk susları için nalidiksik asite karsı gözlenirken Alman susları için sulfonamid bilesenlerine karsı olmustur. Susların moleküler tiplendirmesi farklı plazmid ve PFGE profilleri göstermistir. Türk susları için 1-4 adet plazmid/profil ve Alman susları için ise 1-7 adet plazmid/profil elde edilmistir. PFGE profilleri 42 ayrı altgrup olusturarak 44,3% homoloji ile iki ana grupta toplanmıstır. 72 adet dirençli susta en yaygın olarak blatem-1 (%56, AMP direnç); floR (%100, CHL ve FFC direnç); aphA1 (%100, KAN ve NEO direnç); tet(A) (%53, TET direnç); aadA1 (%82, SPE ve STR direnç); sulI (%78, SUL direnç) antibiyotik direnç genleri gözlenmistir. Çalısmada 700 bç (1 sus), 1000 bç (37 sus), 1200 bç (16 sus) ve1600 bç (3 sus)'lik sınıf I integronlara ait farklılasmıs bölgeler elde edilmistir.

Özet (Çeviri)

In this study, 59 epidemiologically unrelated Salmonella strains isolated from foods in Türkiye and 49 Salmonella strains obtained from National Salmonella Reference Laboratories of Germany were analysed. For the characterization of strains, analyses such as serotyping, phage typing, antibiotyping and molecular biological characterization were done. The strains exhibited 17 different serotypes with S. Enteritidis serotype and PT21 phage type being the most prevalent in Turkish isolates. The highest antimicrobial resistance was observed against NAL for Turkish strains, whereas it was against SUL for strains from German origin. Molecular typing of all strains exhibited different plasmid profiles and PFGE patterns. There were 1-4 plasmids/profile for Turkish strains and 1-7 plasmids/profile for German strains. The PFGE patterns revealed 42 different subgroups, having two major clusters with 44,3% arbitrary homology. Among 72 resistant strains, the most prevalent resistance genotypes were observed as blatem-1 (%56, AMP resistance); floR (%100, CHL and FFC resistance); aphA1 (%100, KAN and NEO resistance); tet(A) (%53, TET resistance); aadA1 (%82, SPE and STR resistance); sulI (%78, SUL resistance). The class I integron variable region analyses exhibited 700 bp (1 strain), 1000 bp (37 strain), 1200 bp (16 strain) and 1600 bp (3 strain) integrons.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    507227

    Characterization of plasmids from multi drug resistant Salmonella infantis isolates

    Çoklu ilaç dirençli Salmonella infantislerin plazmidlerinin karakterizasyonu

    SACİDE ÖZLEM AYDIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YEŞİM SOYER

  2. Tez No

    342907

    Molecular characterization of biofilm properties of Listeria monocytogenes in the presence of o-coumaric acid and 4-hydroxybenzoic acid

    Listeria monocytogenes'in o-kumarik asit ve 4-hidroksibenzoik asit varlığında biofilm özelliğinin moleküler karakterizasyonu

    UMUT EKİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FERDA SOYER DÖNMEZ

    DOÇ. DR. İKBAL AGAH İNCE

  3. Tez No

    112206

    Atık polietilentereftalattan özel blok kopolimerler ve çevre dostu alkid reçine üretimi

    Production of special block copolymers and environmental friendly alkyd resins from PET wastes

    OĞUZ MECİT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF. DR. AHMET AKAR

  4. Tez No

    650614

    Çeşitli gıda ve çevresel örneklerde (Cronobacter spp.) Cronobacter sakazakii izolasyonu, identifikasyonu ve virulans faktörlerin moleküler yöntemle belirlenmesi

    Isolation, identification and molecular characterization of (Cronobacter spp.) Cronobacter sakazaki virulence factors from varied foods and environmental samples

    ÜLKÜ DEMİRCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Aydın Üniversitesi

    Gıda Güvenliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYDAR ÖZPINAR

  5. Tez No

    723263

    Süt ve süt ürünlerinden Staphylococcus aureus izolasyonu ve izolatların antibiyotik duyarlılıklarının incelenmesi

    Isolation of Staphylococcus aureus from milk and dairy products and investigation of antibiotic sensitivity of isolates

    GÜLŞAH ÇOBANKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEYHAN ULUSOY

Geri Dön