Geri Dön

Screening for genetically modified tomatoes and tomato seeds and identification of CRY1AC and SAM-K specific modifications using gene and construct specific PCR

Domates ve domates tohumlarında genetik modifikasyonun tespiti ve CRY1AC ve SAMK genlerinin gen ve konstrakt spesifik PZR yöntemleri ile saptanması

PDF İndir

  1. Tez No: 201942
  2. Yazar: ESRA UÇKUN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN, PROF. DR. MÜKERREM KAYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Gıda Mühendisliği, Ziraat, Biotechnology, Food Engineering, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: böcek dirençli domates, es zamanlı PZR, GDO tespiti, genetigi modifiye organizmalar, PZR, Genetically modified organisms, GMO detection, insect resistant tomato, PCR, real time PCR, construct-specific PCR
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 168

Özet

Bu tez çalısması Türkiye'nin çesitli illerinden alınan domates ve domates tohum örneklerinde genetigi modifiye gıdaların tespitinde en güvenilir metod olan PZR kullanılarak genetik modifikasyonun tespiti için gerçeklestirilmistir. Toplanan örneklerin DNAları CTAB ekstraksiyon protokolü ve ekstraksiyon kitleri kullanılarak saglanmıstır. Domateslerin nitel taraması için 35S, NOS ve NPTII bölgeleri hedef alınarak 8 farklı primer seti kullanılmıstır. Real time PZR, konvansiyonel PZR ile 35S ve NOS pozitif bulunan örnekleri kontrol etmek amacıyla kullanılmıstır. vii Bu çalısmada, taranan 35 tohum örneginin 14ünde ve 40 domates örneginin 14ünde genetik modifikasyonun varlıgını isaret eden 35S promotör, NOS terminatör, kanamisin direnç geninin en az biri tespit edilmistir. Tarama sonrasında, gen spesifik çalısmalar F tipi olgunlasması geciklestirilmis GM domateste bulunan poligalakturonaz geni , 35 1 N GM domates türünde bulunan sam-k ve böcek dirençli 5345-1 GM domates türünde bulunan cry1Ac genleri hedef alınarak yapılmıstır. PG ve sam-k genlerine özgü primerler hiçbir örnekte yükseltgenmezken, toplam 18 örnekte cry1Ac geni ve 1 örnekte sam-k geni saptanmıs ve sekanslanarak dogrulanmıstır. Ayrıca, 5345-1 ve 35 1 N türü konstraktlara özgü primerler dizayn edilmistir. PZR sonuçları konstraktın varlıgına isaret etmektedir. Konstraktın varlıgından emin olmak amacıyla PZR ürünleri dizi analizine gönderilmistir.

Özet (Çeviri)

This study was carried out to analyze tomato samples and tomato seeds, purchased from different food markets of Turkey randomly, for the presence of genetic modification by using PCR method as it allows more specific detection. The DNAs of collected samples were isolated according to CTAB DNA extraction protocol and also with extraction kits. Screening tests of tomatoes were done by targeting 35S promoter, NOS terminator and NptII kanamycin resistance gene with eight different primer sets. Real time PCR is used to confirm 35S and NOS positives results obtained from conventional PCR. In this study, it was observed that 14 out of 35 seed samples, and 14 out of 40 fresh tomato samples which were screened had at least one transgenic element of 35S v promoter, NOS terminator and NPTII kanamycin resistance gene indicating the possible presence of genetic modifications. After screening, gene specific studies were carried out for PG, sam-k indicating F type ripening delayed tomato and the 35 1 N lines respectively and cry1Ac genes inserted in 5345-1 insect resistant tomato line. PG and sam-k specific primers were not amplified in any of the samples investigated whereas 18 out of 75 samples were cry1Ac positive and 1 out of 75 samples was sam-k positive. Positives were confirmed by sequence analysis. Additionally, construct specific primers specific to 5345-1 and 35 1 N lines were designed. PCR amplicons indicate the existence of the construct sequence. In order to verify the results, PCR products were sent to sequence analysis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    201926

    Screening of genetic modification in tomato seeds and identification of genetically modified ripening delayed tomato seeds

    Domates tohumlarında genetik modifikasyon taraması ve genetiği değiştirilmiş raf ömrü uzatılmış domates tohumlarının tespiti

    SELDA TÜRKOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. G. CANDAN GÜRAKAN

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Tez No

    505188

    Domates bitkisinde biyoteknolojik çalışmalar ve GDO tanısı

    Biotechnological studies in tomato plant and GDO diagnosis

    MUKADDES DURMUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyoteknolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YILMAZ KAYA

  3. Tez No

    197582

    Development of QCM based DNA biosensors for detection of genetically modified organisms

    Genetiği değiştirilmiş organizmalar için işaretsiz saptama metodlarının geliştirilmesi

    İREM KARAMOLLAOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

  4. Tez No

    318681

    Genetiği değiştirilmiş ürünlerin çoklu real-time PCR ile belirlenmesi

    Development of multiplex real-time PCR assays for screening of genetically modified organisms (GMOs)

    MORTAZA KHODAEİAMİNJAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH KAFKAS

  5. Tez No

    352361

    P35S, TNOS and PFMV targeted multiplex PCR using a single dye

    Tek boya kullanarak P35S, TNOS ve PFMV hedefli çoklu PZR

    DENİZ GÜLBİN TAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

    DR. MUSTAFA KOLUKIRIK

Geri Dön