Uzun yaşayanlarda mitokondriyal DNA sekans analizi
Mitochondrial DNA sequencing analysis in long-lived individuals
- Tez No: 282081
- Danışmanlar: PROF. DR. HİKMET HAKAN AYDIN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 210
Özet
Yaşlanma, üzerinde birçok faktörün etkisinin olduğu, fizyolojik fonksiyonlarda ilerleyici azalmayla seyreden, yaşın artmasıyla sağ kalım süresi ve çoğalma yeteneğinde azalma ve nihayetinde ölümle sonuçlanan bir süreçtir. Yaşlanma mekanizmalarından en çok kabul görenlerden biri de mitokondrial mutasyonlardır. Mitokondrinin bir serbest radikal kaynağı olması ve bu radikallerin olumsuz etkilerine sık maruz kalması, maternal kalıtımı olan, rekombinasyon görülmeyen ve yetersiz onarım mekanizmaları olan mitokondriyal genomda mutasyon görülme ihtimalini arttırmaktadır. Kalıtılan ve somatik mutasyonlar sonucunda oluşan mitokondriyal DNA sekans varyasyonları, respiratuar zincir ve serbest radikal oluşumunda farklılıklar oluşturarak yaşam süresini etkileyebilir.Çalışmamıza 90 yaş üzerinde (n= 25) ve kronik hastalığı olmayan orta yaşlı (n=25) şahıslar sırasıyla +90 ve kontrol grupları olarak dahil edildi. Mitokondriyal DNA dizi analizleri her iki grupta Affymetrix mikroarray sistemi ile gerçekleştirildi. Bu sekans bilgilerinden rCRF sekans dizilimi referans alınarak polimorfik varyantlar saptandı ve olguların mitokondriyal DNA'larının bağlı bulundukları haplogrup kümeleri tespit edildi. Yaşlı ve kontrol grubu arasındaki polimorfik varyant ve haplogrup farklılıkları saptanarak istatiksel farklılıkları ortaya konuldu. Sonuçlara göre daha önce benzer 3 ayrı çalışmada belirlenen bir uzun yaşam bölgesi olan C150T polimorfizmi, +90 grubunda kontrol grubundan anlamlı yüksek bulundu. T16304C polimorfizmi kontrol grubunda +90 grubundan yüksek fekanslarda bulundu. Bu polimorfik varyantın uzun yaşam üzerine olumsuz etkileri olabilecek bir varyant olabileceği düşünülmektedir.Olguların haplogruplarına bakıldığında, Türk populasyonunda haplogrup H, HV, R ve N haplogruplarının sık olarak görüldüğü tespit edildi. Kontrol ve +90 grubu arasında haplogruplar açısından anlamlı bir farklılık bulunamadı. Çalışmamız aynı zamanda Türk populasyonunda bu konuda yapılan ilk çalışmadır. Türk populasyonuna ait mitokondriyal DNA sekans verileri ve haplogrup verilerinin belirlenmiş olması ileride yapılacak çalışmalara da kaynak oluşturacaktır.
Özet (Çeviri)
Aging is a multiple factor related process, associated with progressive decrease in physiological functions, lower survival and decreased ability for reproduction as the age increases, and ultimately resulting in death. One of the widely recognized mechanisms for aging is mitochondrial mutations. Maternally inherited mitochondrial genome, lacking genome recombination and having inadequate repair mechanisms, is more vulnerable to mutations as the mitochondria itself is a source for free radicals. Mitochondrial DNA variations, resulted from either inherited mutations or somatic mutations, may affect life expectancy by altering respiratory chain and free radical formation.Individuals older than 90 (n=25) and middle-aged individuals having no chronic disease (n=25), were included to our study as +90 group and control group respectively. Mitochondrial DNA sequence analysis for both groups was carried out with Affymetrix microarray system. From this sequence data polymorphic variants were detected by using rCRF sequence as a reference and haplogroup clusters to which individuals belong were indentified accordingly. Polymorphic variant and haplogroup cluster differences between +90 group and control group were revealed and statistically evaluated. Frequency of C150T polymorphism, which was previously identified as a longevity region by 3 similar studies, was found to be higher in +90 group compared to control group. T16304C polymorphism was found to be at a higher frequency in control group compared to +90 group. It is considered that this variant may have a negative effect on longevity.Data obtained from haplogroups suggest that H, HV, R and N are more common haplogroups in Turkish population. No significant difference was detected between +90 group and control group regarding to the haplogroup status. This study is the first of its kind conducted in Turkish population. Mitochondrial sequence data and haplogroup data of Turkish population will be a source for future studies.
Benzer Tezler
- Sepsis ve septik şokta güçlü iyon açığı, güçlü iyon farkı ve anyon açığının mortalite ve prognoz açısından incelenmesi
Investigation of strong ion deficit, strong ion difference and anion deficit in sepsis and septic shock in terms of mortality and prognosis
MUSTAFA TOSUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
İlk ve Acil YardımSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YAHYA KEMAL GÜNAYDIN
- Bir devlet üniversitesinde öğrencilerin toplumsal cinsiyet algısı, bunun şiddet eğilimiyle ve kişilik yapısıyla ilişkisi
Relation between the gender perception, tendency of violence and personality structures of those studying at a public university
ALİ UÇARMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Halk SağlığıMarmara ÜniversitesiHalk Sağlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEYHAN HIDIROĞLU
- Blastocystis türlerinde pirosekans yöntemiyle alttür belirlenmesi
Determination of Blastocystis subtypes with pyrosequencing
TUĞÇE NİL YANTIRA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FUNDA DOĞRUMAN AL
- Üreme çağındaki kadınlarda dismenore sıklığı ve şiddeti
Dysmenorrhea frequency and intensity of women duri̇ng reproduction period
AYÇA UZUN ÖĞER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Aile Hekimliğiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KURTULUŞ ÖNGEL
- Altmışbeş yaş üstü bireylere verilen sıvı tüketim eğitiminin hidrasyon durumuna etkisi
The effect of flui̇d consumpti̇on educati̇on on hydrati̇on status of i̇ndi̇vi̇duals over si̇xty fi̇ve years old
MELTEM BAYKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Beslenme ve DiyetetikMarmara ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞULE AKTAÇ