Mathematical modeling of MMPs in cancer
Kanserdeki MMP?lerin matematiksel modellenmesi
- Tez No: 301693
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Fizik ve Fizik Mühendisliği, Onkoloji, Biophysics, Physics and Physics Engineering, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 111
Özet
Biyolojide, matematiksel modelleme gibi yeni yaklaşımlar, tümör gibi karmaşık biyolojik sistemler hakkındaki kapsamlı veri birikimini açıklamak için ortaya çıkmıştır. Yaklaşık elli yıldır araştırılan matematiksel tümör modelleri, temel biyoloji prensiplerini klinik ve deneysel verilerle birleştirerek, tümör gelişiminin dinamiklerini ve karakteristiklerini incelemeyi ve öngörüde bulunmayı amaçlamıştır. Kanser gelişimi esnasında, genetik ve mikro-ortamsal faktörler, karşılıklı olarak birbirini moleküler ölçekte etkilerler ve bu, doku ölçeğinde hastanın hayatını tehlikeye sokan bir davranışa neden olur. Moleküler ve doku ölçeğinde gerçekleşen olaylar çoğunlukla bilinmekle beraber, bu ikisinin arasındaki ilişkiyi, lineer mantıkla keşfetmek imkânsızdır. Bu olayların birbiriyle nasıl ilintilendiğinin keşfi, tedaviler için potansiyel hedefler görmemize ve mevcut tedavilerle deney yapmamıza yardımcı olur. Bu motivasyon sayesinde, bu tezde tümör gelişiminin matematiksel bir modelini oluşturduk. Sürekli modelleme yaklaşımını kullanarak tümör gelişimini, karışım teorisi çerçevesinde modelledik. Ekstra-selüler matris parçalayıcı enzimin aktivitesine, MMP'ye ve MMP'nin inhibisyonuna odaklandık. MMP inhibitörlerinin taşınmasını incelemek amacıyla, kanla taşınan kimyasalların ve diğer maddelerin aktivitesini simüle etmemize de yardımcı olabilecek bir dinamik damar ağı oluşturduk.
Özet (Çeviri)
New approaches like mathematical modeling appeared in biology to explain the accumulation of extensive data about complex biological systems like tumors. Mathematical models of tumors which have been studied for over 50 years, aimed to explore the dynamics and characteristics of tumor progression and to make predictions by combining the elementary principles of biology to clinical and experimental data. During cancer progression, genetical and microenvironmental factors mutually affect each other in molecular scales and, this results in a behavior in tissue scale which threatens the patients? life. What happens in molecular and tissue scales, are mostly known, but the relation between these two is impossible to discover with linear thinking. The discovery of how these events are linked, helps us to see the potential targets for treatments and to experiment on current treatments. With this motivation, we build a mathematical model of tumor growth in this thesis. We used continuous modeling approach and model the tumor progression within the framework of mixture theory. We focused on the activity of matrix degrading enzyme, MMP and its inhibition. In order to study delivery of MMP inhibitors, we set up a structure for a dynamic vessel web which also can help us to simulate activities of other substances and chemicals delivered by blood.
Benzer Tezler
- A mathematical model of drug delivery by modifying the tumor microenvironment:MMP activation
Tümör mikroçevresinin değiştirilmesi yoluyla ilaç iletiminin matematiksel modellemesi: MMP aktivasyonu
DUYGU KABA
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
MatematikBoğaziçi ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURAK GÜREL
DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Karbon kaynaklarının salmonella typhimurium'da biyofilm oluşumu üzerindeki etkinliğinin matematiksel modellemesi
Mathematical modeling of the efficacy of carbon sources on biofilm formation in salmonella typhimurium
HALE ELÇİN LATİFİ
- Mathematical modeling of a small-scale helicopter and MRAC design with time based uncertainty parametrizations
Küçük boyutlu helikopterler için matematik model geliştirme ve zamana bağlı belirsizlik parametrize etme yöntemi ile MRAC tasarımı
MUSTAFA GÜRLER
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Havacılık MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiHavacılık ve Uzay Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ TÜRKER KUTAY
- Mathematical modeling of a bubbling fluidized bed combustor co-fired with cotton residue and lignite
Pamuk artığı ve linyitin kabarcıklı akışkan yataklı yakıcıda birlikte yakılmasının matematiksel modellenmesi
MEHMET SONER YAŞAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
EnerjiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖRKEM KÜLAH
PROF. DR. NEVİN SELÇUK
- Gaziantep ili su tüketiminin matematiksel modellenmesi
Mathematical modeling of water consumption in Gaziantep city
SÜMEYRA AKPINAR
