Geri Dön

Helicobacter pylori tedavisinin mikrobiyota üzerine etkisi

The effects of Helicobacter pylori treatment on microbiota

  1. Tez No: 420952
  2. Yazar: SERAP SÜZÜK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE MELTEM ÇIRAK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Gastroenteroloji, Mikrobiyoloji, Gastroenterology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Bakteriyoloji Bilim dalı
  13. Sayfa Sayısı: 137

Özet

Bağırsak florasının, insan sağlığı ve çeşitli hastalıkların patogenezi üzerindeki önemi ve etkisi insan mikrobiyom projesinin de gündeme gelmesiyle daha da önem kazanmıştır. Bağırsak mikrobiyotası hem mikroorganizma sayısı hem de türleri bakımından bireysel farklılıklar gösteren dinamik bir sistemdir. Diyet alışkanlıkları, yaşam tarzı, yaş, konağın genetik yatkınlıkları ve antibiyotik kullanımı da barsak florasını etkilemektedir. Bu çalışmanın amacı Helicobacter pylori (HP)'si pozitif olan ve tetrasiklin ile metronidazol antibiyotik tedavisi alan hastalarda, antibiyotik kullanım öncesi ve sonrası bağırsak mikrobiyotasının önemli bakteri türleri olan Bifidobacterium spp, Bacteroides fragilis,Lactobacillus spp, Akkermansia mucinophilia ve Fecalobacterium prausnitzii bakımından kantitatif karşılaştırmasını yapmak ve antibiyotik kullanımının mikrobiyota değişimi üzerine etkisini belirlemektir. Çalışmaya Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji kliniğine başvuran ve HP pozitif tanısı alan 39 hasta dahil edildi. Hastaların 39'u antibiyotik öncesi gaita örneği vermesine rağmen ancak 18 hasta antibiyotik sonrası gaita örneği verdi. Çalışmada hastalardan alınan 200 mg gaita örneği değerlendirmeye alındı. Gaitada fazla miktarda DNA izolasyon inhibitörlerinin varlığından dolayı DNA izolasyon işlemi için, özel gaitadan ekstraksiyon kiti kullanıldı (QIAmp DNA Stool Mini Kit, QIAgen, Almanya). Hedef bölge amplifikasyonu için çalışmada yer alan bakterilerin 16S rRNA bölgesine spesifik primerler kullanıldı. Kantitasyon işleminin optimizasyonu ve primerlerin özgüllüğünün doğrulanması için ilgili bakterilerin ATCC suşları ile değerlendirme yapıldı. Ekstraksiyon örneklerinde bakterilerin hem HP pozitif hem de sağlıklı gönüllülerden alınan gaita örneklerinden yapılan ekstraksiyon işlemi sonrası tüm bakterilerin gerçek zamanlı PZR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yöntemi ile kantitasyon işlemi Rotor-Gene® 6000 cihazında (Qiagen, Almanya) yapıldı. HP tedavisi alan hastalarda antibiyotik kullanım öncesi ve sonrası yapılan kantitasyon sonucunda Bifidobacterium spp (p=0,000), Bacteroides fragilis (p=0,000), Lactobacillus spp (p=0,000), A. mucinophilia (p=0,000) ve F. prausnitzii için istatistiksel olarak anlamlı düşüş gözlendi. Elde edilen veriler doğrultusunda HP tedavisinde kullanılan tetrasiklin ve metronidazolün mikrobiyotada disbiyozise neden olabilecek bir zemin oluşturabileceğini söylemek mümkündür.

Özet (Çeviri)

The importance and effect of the intestinal flora on human health and pathogenesis of various diseases have been gained even more importance with the human microbiome project coming into the agenda.The intestinal microbiota is a dynamic system showing individual differences in both the number and species of microorganisms. Dietary habits , lifestyle, age, genetic predisposition of the host and use of antibiotics also affect the intestinal flora. The aim of this study is to carry out a quantitative comparison as regards the Bifidobacterium spp, Bacteriodes fragilis, Lactobacillus spp, Akkermansia mucinophilia and Fecalobacterium prausnitzii, which are the important bacterial species of the intestinal microbiota before and after antibiotic therapy with tetracycline and metronidazole in patients who are positive for Helicobacter pylori (HP) and to determine the effects of antibiotic use on the microbiota. 39 patients who applied to the Gastroenterology Clinic of Gazi University Medical Faculty and were diagnosed as HP-positive were included in this study. While 39 of the patients did not give stool sample before antibiotic therapy, 18 patients gave stool sample after antibiotic therapy. The stool samples of 200 mg in weight were collected from the patients who were included in the evaluation. A special extraction kit (QIAmp DNA Stool Mini Kit, QIAgen, GERMANY) was used for DNA isolation procedure because of the presence of DNA isolation inhibitors in large amount in stool. Primers specific for the 16S rRNA region of the bacteria included in the study were used for the amplification of the target region. ATCC strains of the related bacteria were evaluated for optimization of the quantification procedure and verification of the specificity of primers. Following the extraction of bacteria on the stool samples collected from both HP-positive patients and healthy volunteers, all the bacteria were subjected to real-time quantification procedure with PCR (Polymerase Chain reaction) method on Rotor-Gene® 20 device (Qiagen, Germany). As a result of the quantification before and after antibiotic use in patients receiving HP treatment, statistically significant decreases were observed in Bifidobacterium spp (p=0,000), Bacteriodes fragilis (p=0,000), Lactobacillus spp (p=0,000), A. mucinophilia (p=0,000) and F. prausnitzii. Based on the data obtained, it can be said that tetracycline and metronidazole used to treat HP can prepare the ground that could result in dysbiosis in microbiota.

Benzer Tezler

  1. Obezite nedeniyle laparoskopik sleeve gastrektomi yapılan hastalarda helicobacter pylori varlığının ve eradikasyonunun metabolik sonuçlara etkisi

    The effect of the presence and eradication of helicobacter pylori on metabolic results in patients undergoing laparoscopic sleeve gastrectomy due to obesity

    AHMET ÇEKİÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Genel CerrahiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERKAN OYMACI

  2. Helikobacter pylori tedavisinin serum sitokin düzeyleri üzerine etkisi

    Effect of the helicobacter pylori teratment on the serum cytokine levels

    HACI EREN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GastroenterolojiZonguldak Karaelmas Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELİM AYDEMİR

  3. Helicobacter pylori enfeksiyonunun serum ve mide sıvısı nitrat, nitrit ve nitrosamin seviyelerine etkisi

    The effect of helicobacter pylori infection gastric fluid and serum nitrate, nitrite and nitrosamine levels,

    ŞEVVAL TIKANAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    GastroenterolojiBülent Ecevit Üniversitesi

    Dahili Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. SELİM AYDEMİR

  4. Karaciğer sirozu tanısı alan hastalarda helicobacter pylori tedavisinin başarı oranının ve tedaviye uyumluluğunun değerlendirilmesi

    Evaluation of the success rate and compatibility with helicobacter pylori treatment in patients diagnosed with liver cirrosis

    GÖKHAN EVREN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    İç HastalıklarıHitit Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜSEYİN KÖSEOĞLU

  5. Helicobacter pylori eradikasyon tedavisinin insülin direnci, beta hücre fonksiyonu, leptin düzeyi ve diğer metabolik parametreler üzerine etkileri

    The effects of helicobacter pylori eradication on insulin resistance, beta cell function, leptin levels and other metabolic parameters

    EMRAH TURUNÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıYeditepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR KÜÇÜKARDALI