Oosit yaşlanmasının genetik mekanizması
Geneti̇c mechani̇sm of oocyte agi̇ng
- Tez No: 426980
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLNUR TAKE KAPLANOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Histoloji ve Embriyoloji, Histology and Embryology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Oositler enerji ihtiyaçlarını, mitokondriyonlarda gerçekleşen oksidatif fosforilasyonla sağlarlar. Mitokondriyal DNA'nın (mtDNA), mitokondriyon iç zarının iç kısmında, reaktif oksijen türleri (ROS)'ların üretildiği yerde bulunması nedeniyle, oksidatif hasara uğrar. Mitokondriyonlarda üretilen ROS nükleer DNA (nDNA)'daki hasarı indükleyerek yaşlanmaya katkıda bulunur. Oluşan DNA hasarında okside bazların tamirinde, mitokondriyal ve nükleer DNA'nın kullandığı başlıca tamir mekanizması baz ekzisyon tamiri (BER)'dir. mtDNA'nın DNA tek zincir kırık tamir mekanizması kullandığına dair veriler vardır. Bu bilgiler ışığında çalışmamızda yaşın oosit mitokondriyonu üzerine etkisinin çeşitli moleküler genetik ve immunofloresan yöntemlerle belirlenmesi amaçlandı. Çalışmada, genç (n=5) ,(3-4 ay) ve yaşlı (n=5), (9-12 ay) FVB dişi farelere ovulasyon indüksiyonu yapılarak artan sayıda oositler toplantı. Her bir oositte, mtDNA tamir yolaklarında yer alan mitokondriyal transkripsiyon faktör A (TFAM) , Nei-like DNA glikozilaz1(NEIL1), tirozil DNA fosfodiestereaz 1 (TDP1) ve poly ADP riboz 1 (PARP1) genlerinin ifadelenmeleri kantitatif gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PCR) yöntemi ile analiz edildi. Gen ekspresyon analizlerini doğrulamak amacıyla ise genç ve yaşlı fare oositlerinde PARP1 ve TDP1 protein ekspresyonları immünofloresan yöntemi kullanılarak belirlendi. mtDNA paketleme protein olan ve oksidatif hasarlı mtDNA'ya hasarsız mtDNA'ya oranla daha fazla bağlanan TFAM gen ekspresyonunun, yaşlı fare oositlerinde genç fare oositlerine oranla anlamlı derecede arttığı saptandı. BER'de yer alan ve hasarlı bazlar üzerine etkili çift fonksiyonlu bir DNA glikozilaz olan NEIL1 gen ekspresyonu, yaşlı fare oositlerinde genç farelere oranla azalmış olarak saptandı. DNA tek zincir kırıklarında sensör görevi gören bir protein olan PARP1 ve DNA tamir enzimi olan ve DNA tek zincir kırık tamirinde görev alan TDP1 gen ekspresyonları değerlendirildiğinde ise her iki gene ait ekspresyonların yaşlı fare oositlerinde genç farelere kıyasla, anlamlı derecede yüksek olduğu gözlendi. İmmünofloresan boyamalarda da yaşlı fare oositlerinde genç farelere kıyasla PARP1 ve TDP1 protein ifadelenmesinde parallel artış belirlendi. Sonuç olarak yaşlı oositlerde TFAM'in yüksek ve NEIL1'in düşük ifadelenmesi, yaşla birlikte oksidatif DNA hasarının birikmesinden dolayı DNA tamirindeki azalmanın göstergesi olarak kabul edilirken, PARP1 ve TDP1 gen ve protein expresyonlarındaki yaşa bağlı paralel artış, oositlerde yaşla birlikte DNA tek zincir hasarının arttığı ve bu kırıklara dengeleyici bir tamir yanıtının olduğu kanısını doğurdu.
Özet (Çeviri)
Oocytes rely on energy produced by mitochondria via oxidative phosphorylation. Mitochondrial DNA (mtDNA) locates on the inner side of the mitochondrial inner membrane, where most reactive oxygen species (ROS) are generated, rendering it susceptible to oxidative damage. Mitochondria contributes to the aging process, ROS produced in the mitochondria induce damage on mtDNA. Base excision repair (BER) is one of the main pathways for the repair of oxidized modifications both in nuclear and mtDNA. There is some evidence that mtDNA use single strand break repair.The aim of the study is to determine the effect of aging on mitochondria of the oocytes by using several molecular genetic and immunofluorescence tecniques. We performed ovulation induction to young (n=5), (3 to 4 months) and old (n=5), (9 to 12 months) FVB female mice and collected the oocytes. We analyzed the expression of mithocondrial transcription factor A (TFAM) , Nei-like DNA glycosylases (NEIL1), tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1) and poly ADP-Riboe polymerase (PARP1) genes that are involved in mtDNA repair pathways, by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR in individual oocytes). To confirm the findings of gene expression studies we also analyzed the protein expression of PARP1 and TDP1, in young and old mouse oocytes by using immunofluorescence staining. We found that the expression of TFAM, a packaging protein that binds to oxidatively-damaged mtDNA with greater avidity than to undamaged mtDNA, was significantly increased in old oocytes compared to young ones. NEIL1 is invoved in BER and codes for bifunctional glycosylases that act on damaged bases. We found that the expression of NEIL1 was reduced in older oocytes. PARP1 is a nuclear protein that serves as a sensor of ssDNA breaks and TDP1 is a DNA repair enzyme, which participates in the repair of mtDNA. We found that the expressions of TDP1 and PARP1 were significantly higher in old oocytes compared to young ones. We observed a parallel increase in the protein expression of PARP1 and TDP1, in old mouse oocytes by using immunofluorescence staining. İn conclusion, the higher expression of TFAM and lower expression of NEIL1 in older oocytes, suggests that there may be an age-related decline in DNA repair in aging oocytes resulting in accumulating ROS. The parallel increase of gene and protein expression of PARP1 and TDP1 with the age, suggest that single-strand damage is also increased in oocytes with age and there may be a compensatory response to repair these breaks.
Benzer Tezler
- Detection of the effects of circadian rhythm disruption due to chronic constant light on oocyte aging through MTOR signaling pathway
Sirkadiyen ritmin ışık ile bozulmasının MTOR sinyal yolağı üzerinden oosit yaşlanmasına olan etkisinin belirlenmesi
GİZEM BORA OCAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Histoloji ve EmbriyolojiYeditepe ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYLİN YABA UÇAR
- Erken veya ekilibrasyon sonrası soyularak intrasitoplazmik sperm enjeksiyonu yapılan oositlerde fertilizasyon, multinükleasyon, embriyo kalitesi ve gebelik oranlarının karşılaştırılması
Comparison of fertilization, multinucleation, embryo quality and pregnancy rates derived from the oocytes denuded at early or post-equilibration for intracytoplasmic sperm injection
ZEHRA BEYZA DÜZGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Histoloji ve EmbriyolojiMaltepe ÜniversitesiKlinik Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET CINCIK
- Metal/n-tipi GaAs schottky diyotlarında havada oksitlenme ve yaşlanmanın akım-gerilim (I-V) ve kapasite, konduktans-gerilim, frekans (C,V-G,f) karakteristiklerine etkisi
The Effects of oxidation in air and ageing on current-voltage (I-V) and capacitance, conductance-voltage, frequency (C,V-G,f) characteristics of metal n-type GaAs schottky diodes
AHMET FARUK ÖZDEMİR
Doktora
Türkçe
2002
Fizik ve Fizik MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KÖKCE
- Overyan yaşlanma sürecinde over dokusundan elde edilen stromal kök hücrelerin ovaryum dokusuna terapötik etkisi
Therapeutic effect of stromal STEM cells obtained FROM ovarian tissue on ovarian tissue during the ovarian aging process
GÜL YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Histoloji ve EmbriyolojiPamukkale ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MURAT SERKANT ÜNAL
- State of charge estimation of lithium-ion batteries using machine learning approach
Makine öğrenmesi yaklaşımı kullanılarak lityum iyon pillerin şarj durumu tahmini
OSMAN ALPER ALTUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektrik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE AYAZ