Kronik lenfositik lösemide kromozomal aberasyonlar ve p53 yolağındaki gen ekspresyonları arasındaki ilişki
Relationship between chromosomal aberrations and gene expressions in the P53 pathway in chronic lymphocytic leukemia
- Tez No: 482759
- Danışmanlar: PROF. DR. KIVANÇ ÇEFLE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 218
Özet
Kronik lenfositik lösemi, çeşitli lenfoid dokularda, kemik iliği ve kanda küçük, bölünmeyen B lenfositlerin birikimiyle tanımlanan Batı dünyasındaki en yaygın lösemidir. Çalışmanın amacı, KLL'de p53 yolağında yer alan 22 genin ekspresyonlarındaki artış ve azalışı araştırmaktır. Ayrıca, KLL hastalarında rutin olarak yapılan FISH tekniğiyle tespit edilen 13q, 17p delesyonu ve trizomi 12(+) ile bu genlerin ekspresyonu arasındaki ilişki RT² Profiler PCR Array tekniği ile incelenmiştir. 30 KLL hastasında ve 15 sağlıklı gönüllüde yapılan Qiagen RT² Profiler PCR Array Data Analiz sonuçlarına göre KLL'de ATM, ATR, BAX, CASP9, CDK4, CDKN1A, CDKN2A, CHEK1, CHEK2, E2F1, GADD45A, MDM2, MDM4, PCNA, RB1, P53 BCL2 genlerinin yukarı regülasyonu, APAF1, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3 genlerinin ise aşağı regülasyonu gözlenmiştir. APAF1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3, BCL2 genlerinde diferansiyel ekspresyonu saptanmış ve hastalıkla ilişkili bulunmuştur. FISH yöntemiyle iyi [13q(-) ve kromozom anomalisi olmayanlar] ve kötü prognozlu [17p(-) ve trizomi 12(+)] olarak ayrılan hastalar ile tedavi alan ve almayan hastalarda, 22 gende istatistiksel olarak anlamlı farklılık bulunmamıştır. ROC Analizinde APAF1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3, BCL2 genlerin ekspresyonları cut-off değerine göre istatistiksel olarak anlamlı bulunmuş olup, hastalık tanısında önemli değere sahiptirler. Lojistik regresyon analizinde, modele alınan 9 genden PTX3 ve CDNK2A genleri anlamlı olarak modelde yer almıştır. PTX3 geninde sınır değerinin üzerindeki ekspresyon artmış KLL riski ile ilişkilidir (OR: 22,113; %95 CI 1,13-432,583). CDKN2A geninde ise sınır değerinin üzerindeki ekspresyon azalmış KLL riski ile ilişkili olarak değerlendirilmiştir (OR: 0,01; %95 CI: 0,001-0,164).
Özet (Çeviri)
Chronic lymphocytic leukemia is the most common leukemia in the Western world, characterized by the accumulation of small, non-dividing B lymphocytes in various lymphoid tissues, bone marrow and blood. The aim of the study is to investigate alterations in the expression of 22 genes in the p53 pathway in CLL. The relation between chromosomal deletions detected with FISH in chromosomes 13q, 17p and trisomy 12(+) and the expression of these genes were evaluated by RT² Profiler PCR Array technique. The results of Qiagen RT² Profiler PCR Array Data Analysis showed that of the 22 genes, ATM, ATR, BAX, CASP9, CDK4, CDKN1A, CDKN2A, CHEK1, CHEK2, E2F1, GADD45A, MDM2, MDM4, PCNA, RB1, P53, BCL2 were upregulated, while, APAF-1, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3 genes were downregulated. Differential expressions of 9 genes (APAF1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3, BCL2) were observed and found to be related to the disease. There was no statistically significant difference between patients with good [patients with 13q(-) and patients with a normal karyotype] and bad [17p(-) and trisomy 12(+)] prognosis and those with or without treatment. As a result of ROC analysis, APAF1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, E2F3, MCL1, PTEN, PTX3, BCL2 genes were found to be statistically significant (p
Benzer Tezler
- İzole 13q delesyonu saptanan KLL olgularında NOTCH1 ve SF3B1 genlerinde mutasyon analizi
Mutations analyzing of NOTCH1 and SF3B1 genes in cases with KLL detected isole 13q deletion
GÜLÇİN GÜNDEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS
- Kronik lenfositik lösemide aurora-A kinaz ekspresyonu
Aurora-A kinase expression in chronic lymphocytic leukemia
DENİZ ÇETİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
HematolojiAdnan Menderes Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEFKİ GÜRHAN KADIKÖYLÜ
- İzole 13q delesyonu bulunan KLL vakalarında Retinoblastoma geni delesyonunun incelenmesi
Examination of the Retinoblastoma gene deletion in CLL cases with isolated 13q deletion
NUR SENA İNCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS
- Kronik lenfositik lösemide 13q14.3 delesyonunun sitogenetik analiz ve FISH yöntemi ile; mirna-15A ve mirna-16-1'in real time pcr ile incelenmesi
Investigation of 13q14.3 deletion by cytogenetic analysis and fish technique and mirna-15A and mirna-16-1 BY real time PCR in cll
MELİKE YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SENİHA HACİHANİFİOĞLU
- Multidrug resistance in chronic lymphocytic levkemia
Kronik lenfositik lösemide çoklu ilaç dirençliliği
SENEM ŞİMŞEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2000
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
DOÇ. DR. FİKRET ARPACI