Subkortikal enfarkt ve lökoensefalopati ile giden serebral arteriyopati (cadasıl/carasıl) hastalığı ile ilişkili notch3 ve htra1 gen mutasyonlarının araştırılması
Investigation of the notch3 and htra1 gene mutations in cerebral arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy (cadasil/ carasil)
- Tez No: 493288
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEHRA OYA UYGUNER, DR. GÜVEN TOKSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
CADASIL, subkortikal enfarkt ve lökoensefalopati ile giden otozomal dominant (OD) serebral arteriyopati, beyindeki küçük damarların vasküler bir faktör olmaksızın tıkanması sonucu, ak maddenin bozulması ile ortaya çıkan sistemik bir mikroanjiyopati hastalığıdır. Otozomal resesif (OR) formu ise çok daha nadir görülen CARASIL'dir. CADASIL, 19p13.12'de lokalize 33 ekzonlu NOTCH3'deki mutasyonlarla ilişkili olup ekzon 2-6 ve 11'de frekansının yüksek olduğu bildirilmektedir. CARASIL ise 10q25'de lokalize 9 ekzonlu HTRA1'deki mutasyonlarla ilişkilidir. Amacımız, CADASIL/CARASIL klinik tanılı olgularda NOTCH3 ile HTRA1 genlerinin incelenmesi, mutasyon sıklıklarımızın belirlenmesi ve moleküler tanı stratejimizin oluşturulmasıdır. Sonuçlarımızın ailelere etkin genetik danışmanlık verilmesine ve tedavi stratejilerine katkı sağlaması beklenmektedir. Projede algoritmik bir yaklaşımla 64 olguda NOTCH3 hedef ekzon bölgeleri 2-6 ve 11, Sanger dizileme (SD) ile, NOTCH3 tüm gen yeni nesil dizileme (YND) temelli özgün panel-gen testi ile, panelin kapsamadığı bölgeler ve HTRA1 geni SD ile incelendi. NOTCH3 hedef bögelerindeki mutasyon sıklıkları laboratuvarımızda yapılan önceki test sonuçlarıyla birlikte retrospektif olarak değerlendirildiğinde mutasyon oranımız % 20.8 idi. Panel-gen testinin ekzon 19 ve 22'de gösterilen farklı mutasyonlarla tanıya katkısı % 5.5 olarak belirlendi. Panelin kapsamı dışındaki bölgelerde herhangi bir mutasyon saptanmaması, bu bölgelerin tanı gücünün düşük olduğunu gösterdi. Panel-gen uygulamasının büyük kohortlarda birlikte çalışma olanağı sunarak sık ve nadir mutasyonların gösterilmesini sağlaması iş yükü/zaman açısından avantajlı görüldü. HTRA1 geninde tek bir olguda mutasyon saptandı. Bu durumun klinik kriterlerin heterojenliği ilişkili olabileceği ya da hastalığın toplumumuzda da nadir olduğunu düşündürdü. NOTCH3 ve HTRA1 genlerinde mutasyon saptanmayan örneklerin fenotiple ilişkili yeni genlerin araştırılmasına yönelik projelere önemli bir kaynak teşkil etmesi beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
CADASIL, cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarction and leukoencephalopathy, is a systemic microangiopathic disease of the brain caused by impaired circulation of the small vessels. Mutations in NOTCH3 on 19p13.12 are responsible for the phenotype. Of its 33 exons, exons 2-6 and 11 are hot spot regions. Autosomal recessive (AR) form of the disease, CARASIL, is associated with mutations in HTRA1- a nine exon gene on 10q25, and is less common. Our aim is to screen for NOTCH3 and HTRA1 genes in clinically diagnosed CADASIL / CARASIL patients, to determine the mutation frequencies and to improve molecular diagnostic strategy. We anticipate that our results will provide effective genetic counseling, and contribute to treatment strategies. In this project, NOTCH3 target regions (exons 2-6 and 11) were Sanger sequenced in 64 cases, as well as applying targeted next generation sequencing (NGS) panel for NOTCH3. Analyses of missed regions of NOTCH3 and HTRA1 were performed by Sanger sequencing. Mutation frequency of NOTCH3 target regions, evaluated with the previous test results was 20.8%. NGS panel contributed an additional 5.5% with mutations identified in exons 19 and 22. We observed that NGS decreases work load and time spent in large cohort analysis while easily identifying frequent and rare mutations. Only one patient had HTRA1 gene mutation which points to the high clinical heterogeneity of the disease, and its rarity in Turkey. We expect that cases with no mutations in NOTCH3 and HTRA1 genes will be an important resource for the identification of novel genes.
Benzer Tezler
- Akut iskemik inmede S100B proteinin klinik enfarkt volümü ve lokalizasyonu üzerine etkisi
The effect of S100B protein in determining clinic situation infarct volume and localization on infarckt in acute ischemic stroke
TUĞBA YÖRÜK
- İskemik inme sonrası gelişen huzursuz bacaklar sendromu ve lezyon lokalizasyonuyla ilişkisi
Poststroke restless legs syndrome and assosication with lesion location
GÜLŞAH ZORGÖR DİNDAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
NörolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiNöroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYSUN SOYSAL
- Genç iskemik inme hastalarında inme lokalizasyonu ile inme etiyolojisi arasındaki ilişki
The relationship between stroke localization and stroke etiology in young ischemic stroke patients
YASEMİN AKINCI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Nörolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaNöroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAKİ GÖKSAN
- Geç epilepsilerde etyolojinin aydınlatılmasında bilgisayarlı beyin tomografisinin yeri ve değeri
Başlık çevirisi yok
A. FİGEN TUNALI
- Sıçanlarda deneysel alzheimer hastalığı modelinde nöral doku greftleri ile hacimsel öğrenme ve bellek fonksiyonlarının düzelmesi
Improvement of spatial learnbing and memory impairments by fetal neural tissue grafts in experimental rat model of alzheimer's disease
SONGÜL MELTEM CAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1994
Nöroşirürjiİstanbul ÜniversitesiNöroşirürji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN BARLAS