Association of the vitamin D metabolizing CYP24A1, CYP27A1,CYP27B1 and vitamin D receptor genetic polymorphisms with multiple sclerosis risk in Turkish population
D vitamini metabolizmasında rol alan CYP24A1, CYP27A1,CYP27B1 ve D vitamini reseptörünün genetik polimorfizmlerinin Türk populasyonunda multipl skleroz riski ile ilişkisi
- Tez No: 783637
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, PROF. DR. ŞEREF DEMİRKAYA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: D vitamini, Multipl skleroz, D vitaminini metabolize eden CYP'ler, VDR, polimorfizm, Genler, Polimorfizm-genetik, Vitamin D, Vitamin D, Multiple sclerosis, Vitamin D metabolizing CYPs, VDR, gene polymorphism, Genes, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
MS travmatik olmayan genç engelliliğin en yaygın nedenidir. Pek çok çalışma MS ile D vitamini araşındaki ilişkiye işaret etmektedir. D vitamininin aktivasyonu CYP'ler tarafından yürütülen bir dizi hidroksilasyon gerektirmektedir. D vitamini etkisini D vitamini reseptörüne (VDR) bağlanarak gösterir. Bu çalışmada D vitamini ile ilişkili mitokondriyal CYP'lerin (CYP27A1, CYP27B1 ve CYP24A1) ve VDR'nin polimorfizmleri incelenmek üzere seçilmiştir. 187 (130 kadın/57 erkek) hasta ve 140 (78 kadın/62 erkek) kontrol örneği ile çalışılmıştır. MS hastalarının ve kontrol katılımcılarının kanlarından izole edilen DNA örnekleri RFLP metodu kullanılarak genotiplenmiştir. Örneklerin istatistik analizi için üç genetik model uygulanmıştır. Bu modeller aditif (yabanıl tip homozigota karşı heterozigot genotip ve yabanıl tip homozigota karşı mutant homozigot genotip), dominant (yabanıl tip homozigota karşı heterozigot+homozigot mutant) ve resesif (yabanıl tip homozigot + heterozigota karşı homozigot mutant) modellerdir. Ayrıca alel frekansları da (yabanıl tip alele karşı mutant alel) analiz edilmiştir. Tüm analizler örneklerin erkek ve kadın alt gruplarına da uygulanmıştır. Analizler ki-kare yöntemi ile yapılmış, genotip ve alel frekansları MS hastaları ve sağlıklı kontroller arasında karşılaştırılmıştır. TaqI (rs731236)'de“A”yabanıl tip ve“G”mutant aleldir. Dominant model analizinde sonuç sınırda anlamlı bulunmuş olup (p=0.051), bu“G”alelinin riski azalttığını düşündürmektedir (OR:0.642). Diğer model ve alt grup analizlerinin hiçbiri istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır. CYP24A1 (rs1570669)'de“A”yabanıl tip ve“G”mutant aleldir. İstatistik analizlerinde, AA'ya karşı AG'nin karşılaştırıldığı aditif model (p<0.001, OR:5.413) ve dominant model (p<0.001, OR:4.429) sonuçları anlamlı olup, hastalığa yatkınlığı arttırdığı belirlenmiştir. Kadın alt grubunda AA'ya karşı AG'nin karşılaştırıldığı aditif model (p<0.001, OR:6.693) ve dominant model (p<0.001, OR:4.685) ile erkek alt grubunda AA'ya karşı AG'nin karşılaştırıldığı aditif model (p<0.001, OR:4.387) ve dominant model (p <0.001, OR:4.277) sonuçları da anlamlı olup, hastalığa yatkınlığı arttırdığı belirlenmiştir. Kadın alt grubunda, resesif model sonuçları da anlamlı bulunmuştur (p=0.041, OR:0.957). Resesif model sonuçları genel örneklemde ve erkek alt grubunda anlamlı bulunmamıştır. AA'ya karşı GG aditif model ve alel frekansı analizleri genel örneklemde ve alt gruplarda anlamlı bulunmamıştır. VDR-ApaI (rs7975232), CYP27A1 (rs6709815) ve CYP27B1 (rs4646536) için hiçbir analiz (aditif, dominant, resesif ve alelfrekans karşılaştırması) istatistiksel olarak anlamlı (p>0.05) bulunmamış olup, bu da MS ile seçilen bu polimorfizm arasında bir ilişki olmadığını düşündürmektedir. Bunların yanında rs4646536'da nadir varyantın (“C”aleli) popülasyon frekansı ilk defa belirlenmiş olup, frekanslar hastalarda %2.41, control örneklerinde %3.31 ve toplam %2.95'tir. Bu çalışma ile Türk popülasyonunda, bazı polimorfizmlerin (rs7975232, rs6709815, rs4646536) MS riski ile ilişkisi ilk defa araştırılmıştır. Umuyoruz ki çalışma sonuçlarımız MS gelişiminin genetik alt yapısının daha iyi anlaşılmasına katkıda bulunacaktır.
Özet (Çeviri)
Multiple Sclerosis (MS) is the most common nontraumatic cause of young disability. There are many studies indicating the relationship between MS and vitamin D. Activation of vitamin D requires a series of hydroxylations that are conducted by cytochrome P450 enzymes (CYPs). Vitamin D shows its effects by binding to vitamin D receptor (VDR). In the present study, vitamin D metabolism related mitochondrial CYPs (CYP27A1, CYP27B1 and CYP24A1) and VDR gene polymorphisms were selected for investigation. 187 (130 female/57 male) MS patients and 140 (78 female/62 male) control subjects were involved in the study. DNA samples extracted from the blood of MS patients and control subjects were genotyped using RFLP. Three genetic models applied which were additive (wild type homozygous genotype vs heterozygous genotype and wild type genotype vs homozygous mutant genotype), dominant (wild type homozygous vs heterozygous+homozygous mutant) and recessive (wild type homozygous+heterozygous vs homozygous mutant). Also, allele frequencies (wild type vs mutant) were analyzed. All analyzes were applied to male and female subgroups of the samples. Analyzes were done with chi-square method and frequencies of genotypes and alleles compared in between MS patients and the healthy control subjects. In TaqI (rs731236),“A”was the wild type and“G”was the mutant allele. In dominant model analysis result is borderline significant (p=0.051) suggesting that“G”allele reduces the risk (OR:0.642). None of the remaining models' and subgroups' analyzes were statistically significant. In CYP24A1 (rs1570669),“A”was the wild type and“G”was mutant allele. In statistical analyzes, AA vs AG additive model (p<0.001, OR:5.413) and dominant model (p<0.001, OR:4.429) results were significant and found to increase the susceptibility to the disease. For female subgroup, AA vs AG additive model (p<0.001, OR:6.693) and dominant model (p<0.001, OR:4.685) and for male subgroup, AA vs AG additive model (p<0.001, OR:4.387) and dominant model (p <0.001, OR:4.277) results were significant and found also to increase susceptibility to the disease. For female subgroup, recessive model result was also statistically significant (p=0.041, OR:0.957). Recessive model analyzes were not significant for general population and the male subgroup. AA vs GG additive model and allele frequency comparisons were not significant for general population and subgroups. For VDR-ApaI (rs7975232), CYP27A1 (rs6709815), and CYP27B1 (rs4646536), none of the analyzes (additive, dominant, recessive models and allele frequency comparisons) were statistically significant (p>0.05) suggesting that there is no correlation between MS and the selected polymorphisms. However, for rs4646536, the population frequency of rare variant (“C”allele) was studied for the first time, and the frequency for patients was 2.41%, for control subjects was 3.31% and for total was 2.95%. By this study association of several polymorphisms (rs7975232, rs6709815, rs4646536) with MS risk were investigated for the first time in Turkish population. We hope our results contribute to understanding of genetic background of MS onset.
Benzer Tezler
- Analyzing the expression patterns of vitamin D metabolizing CYP27B1 and CYP24A1 in brain tissue of vitamin D treated mice with multiple sclerosis (MS)
D vitamini uygulanmış multipl skleroz (MS) hastası farelerin beyin dokularında D vitamini metabolizmasında yer alan CYP27B1 ve CYP24A1 enzimlerinin ifadelerinin analizi
DİLARA ÖZDOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN ADALI
DR. EMRE EVİN
- Şanlıurfa-Harran ovası topraklarının ince kum mineralojisi ve bazı yaygın toprak serilerinin mikromorfolojisi
Başlık çevirisi yok
SABAHATTİN ŞAHAN
- Ameliyat öncesi hastaların ameliyata ilişkin duyguları, düşünceleri ve bilgi istekleri
The Pre-operative patiensts feelings throughts and information requirements concerning their surgical operations
KADRİYE BULDUKOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
HemşirelikCumhuriyet ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MELİHA ATALAY
- Sarayköy (Ankara) araştırma ve uygulama istasyonu alanı ve yakın civarının bitki ekolojisi ve sosyolojisi yönünden araştırılması
A Plan ecological and sociological research of the area of station of research and application of Sarayköy (Ankara) and its near environs
AHMET SERTESER