Geri Dön

Association of the vitamin d metabolizing cyp24a1, cyp27a1, cyp27b1 and vitamin d receptor genetic polymorphisms with multiple sclerosis risk in turkish population

D vitamini metabolizmasında rol alan cyp24a1, cyp27a1, cyp27b1 ve d vitamini reseptörünün genetik polimorfizmlerinin türk populasyonunda multipl skleroz riski ile ilişkisi

PDF İndir

  1. Tez No: 783637
  2. Yazar: GİRAY BULUT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, PROF. DR. ŞEREF DEMİRKAYA
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: D vitamini, Multipl skleroz, D vitaminini metabolize eden CYP'ler, VDR, polimorfizm, Vitamin D, Multiple sclerosis, Vitamin D metabolizing CYPs, VDR, gene polymorphism
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 127

Özet

MS travmatik olmayan genç engelliliğin en yaygın nedenidir. Pek çok çalışma MS ile D vitamini araşındaki ilişkiye işaret etmektedir. D vitamininin aktivasyonu CYP'ler tarafından yürütülen bir dizi hidroksilasyon gerektirmektedir. D vitamini etkisini D vitamini reseptörüne (VDR) bağlanarak gösterir. Bu çalışmada D vitamini ile ilişkili mitokondriyal CYP'lerin (CYP27A1, CYP27B1 ve CYP24A1) ve VDR'nin polimorfizmleri incelenmek üzere seçilmiştir. 187 (130 kadın/57 erkek) hasta ve 140 (78 kadın/62 erkek) kontrol örneği ile çalışılmıştır. MS hastalarının ve kontrol katılımcılarının kanlarından izole edilen DNA örnekleri RFLP metodu kullanılarak genotiplenmiştir. Örneklerin istatistik analizi için üç genetik model uygulanmıştır. Bu modeller aditif (yabanıl tip homozigota karşı heterozigot genotip ve yabanıl tip homozigota karşı mutant homozigot genotip), dominant (yabanıl tip homozigota karşı heterozigot+homozigot mutant) ve resesif (yabanıl tip homozigot + heterozigota karşı homozigot mutant) modellerdir. Ayrıca alel frekansları da (yabanıl tip alele karşı mutant alel) analiz edilmiştir. Tüm analizler örneklerin erkek ve kadın alt gruplarına da uygulanmıştır. Analizler ki-kare yöntemi ile yapılmış, genotip ve alel frekansları MS hastaları ve sağlıklı kontroller arasında karşılaştırılmıştır. TaqI (rs731236)'de“A”yabanıl tip ve“G”mutant aleldir. Dominant model analizinde sonuç sınırda anlamlı bulunmuş olup (p=0.051), bu“G”alelinin riski azalttığını düşündürmektedir (OR:0.642). Diğer model ve alt grup analizlerinin hiçbiri istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır. CYP24A1 (rs1570669)'de“A”yabanıl tip ve“G”mutant aleldir. İstatistik analizlerinde, AA'ya karşı AG'nin karşılaştırıldığı aditif model (p0.05) bulunmamış olup, bu da MS ile seçilen bu polimorfizm arasında bir ilişki olmadığını düşündürmektedir. Bunların yanında rs4646536'da nadir varyantın (“C”aleli) popülasyon frekansı ilk defa belirlenmiş olup, frekanslar hastalarda %2.41, control örneklerinde %3.31 ve toplam %2.95'tir. Bu çalışma ile Türk popülasyonunda, bazı polimorfizmlerin (rs7975232, rs6709815, rs4646536) MS riski ile ilişkisi ilk defa araştırılmıştır. Umuyoruz ki çalışma sonuçlarımız MS gelişiminin genetik alt yapısının daha iyi anlaşılmasına katkıda bulunacaktır.

Özet (Çeviri)

Multiple Sclerosis (MS) is the most common nontraumatic cause of young disability. There are many studies indicating the relationship between MS and vitamin D. Activation of vitamin D requires a series of hydroxylations that are conducted by cytochrome P450 enzymes (CYPs). Vitamin D shows its effects by binding to vitamin D receptor (VDR). In the present study, vitamin D metabolism related mitochondrial CYPs (CYP27A1, CYP27B1 and CYP24A1) and VDR gene polymorphisms were selected for investigation. 187 (130 female/57 male) MS patients and 140 (78 female/62 male) control subjects were involved in the study. DNA samples extracted from the blood of MS patients and control subjects were genotyped using RFLP. Three genetic models applied which were additive (wild type homozygous genotype vs heterozygous genotype and wild type genotype vs homozygous mutant genotype), dominant (wild type homozygous vs heterozygous+homozygous mutant) and recessive (wild type homozygous+heterozygous vs homozygous mutant). Also, allele frequencies (wild type vs mutant) were analyzed. All analyzes were applied to male and female subgroups of the samples. Analyzes were done with chi-square method and frequencies of genotypes and alleles compared in between MS patients and the healthy control subjects. In TaqI (rs731236),“A”was the wild type and“G”was the mutant allele. In dominant model analysis result is borderline significant (p=0.051) suggesting that“G”allele reduces the risk (OR:0.642). None of the remaining models' and subgroups' analyzes were statistically significant. In CYP24A1 (rs1570669),“A”was the wild type and“G”was mutant allele. In statistical analyzes, AA vs AG additive model (p0.05) suggesting that there is no correlation between MS and the selected polymorphisms. However, for rs4646536, the population frequency of rare variant (“C”allele) was studied for the first time, and the frequency for patients was 2.41%, for control subjects was 3.31% and for total was 2.95%. By this study association of several polymorphisms (rs7975232, rs6709815, rs4646536) with MS risk were investigated for the first time in Turkish population. We hope our results contribute to understanding of genetic background of MS onset.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    754315

    Analyzing the expression patterns of vitamin D metabolizing CYP27B1 and CYP24A1 in brain tissue of vitamin D treated mice with multiple sclerosis (MS)

    D vitamini uygulanmış multipl skleroz (MS) hastası farelerin beyin dokularında D vitamini metabolizmasında yer alan CYP27B1 ve CYP24A1 enzimlerinin ifadelerinin analizi

    DİLARA ÖZDOĞAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN ADALI

    DR. EMRE EVİN

  2. Tez No

    416512

    Genetic polymorphism of vitamin D3 metabolising cytochrome p450 (CYPS) enyzmes and risk of ischemic stroke in turkish population

    Vi̇tami̇n D3 metaboli̇zmasinda rol alan cytochrome p450 (CYPS) enzi̇mleri̇ni̇n geneti̇k poli̇morfi̇zi̇mleri̇ i̇le türk populasyonunda i̇skemi̇k i̇nme ri̇ski̇ i̇li̇şki̇si̇ni̇n araştirilmasi

    TUĞÇE ÖNER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN ADALI

    PROF. DR. BİRSEN CAN DEMİRDÖĞEN

  3. Tez No

    427077

    Postmenopozal osteoporoz olmayan kadınlarda vitamin d ve leptin ilişkisi

    The association of vitamin d and leptin results in postmenapausal women who have no osteoporosis

    AFRODİTA ALİTOSKA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Geriatriİstanbul Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TANJU BEĞER

  4. Tez No

    298757

    Yaşlı populasyonda 25-OH-vitamin D3 düzeyi ile arteryal sertlik ve mortalite riski arasındaki ilişki

    The Association of 25-OH-vitamin D3 with Arterial Stiffness and Mortality in a Elderly Population

    BERNA İMGE AYDOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    GeriatriAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİM KUTLAY

  5. Tez No

    686452

    Multipl myelomalı hastalarda NKT hücre sayılarının vitamin D reseptör polimorfizmi ile ilişkisi

    Association of NKT cell numbers with vitamin D receptor polymorphism in patients with multiple myeloma

    GÖKÇEN OZAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    OnkolojiTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Tümör Biyolojisi ve İmmünolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. MUSTAFA DOĞAN

Geri Dön