Geri Dön

Designing a simulatable environment for genetic circuitbased receivers in molecular communications

Moleküler iletişimde genetik devre tabanlı alıcılar için simüle edilebilir ortam tasarlama

  1. Tez No: 883822
  2. Yazar: MERVE GÖRKEM DURMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TUNA TUĞCU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 74

Özet

Doğadan ilham alarak, Moleküler İletişim (MC), geçtiğimiz on yılda, molekülleri bilgi taşıyıcıları olarak kullanan bir alan olarak ortaya çıkmıştır. Bu yaklaşım, geleneksel elektromanyetik yöntemlere göre gelişmiş biyouyumluluk sunmaktadır. MC'nin disiplinlerarası doğası ve bu alanda yapılan kapsamlı araştırmalar, özellikle tıbbi uygulamalar için potansiyelini vurgulamaktadır. Ancak, MC'nin doğuştan gelen stokastik yapısından kaynaklanan intersembol girişimi (ISI) ve düşük veri hızları gibi zorluklar devam etmektedir. Teorik çalışmalar yaygın olmasına rağmen, bu kavramları pratik uygulamalara taşımak önemli bir meydan okuma olmaya devam etmekte, teori ile gerçek dünya uygulamaları arasındaki boşluğu vurgulamaktadır. Disiplinlerarası bir yaklaşım benimseyen bu çalışma, gerçekçi bir ağ ortamı oluşturarak alandaki pratik zorlukları ele almak için sentetik biyoloji ve moleküler iletişimi entegre etmeyi araştırmaktadır. Bu tezde ISI problemini azaltmak için Pre-equalizer yöntemi kullanılmaktadır. Bu yaklaşım, sinyalin kuyruk etkisini dengelemek için etkileşen iki molekül türünden yararlanır. Parameter Finder adlı yeni bir program ile ince ayar yapılmakta, MOL-Eye diyagramı da moleküler iletişim sistemlerinin hassasiyetini ve etkinliğini artırmak için entegre edilmektedir. Bulgular, sistem modeli ile pre-equalizer yaklaşımının entegrasyonunun, pre-equalizer yönteminin biyolojik uygulamasında simülasyon parametrelerinin ince ayarını yapmak için Parameter Finder aracının kullanımıyla birlikte büyük fayda sağladığını göstermektedir. Ayrıca, MOL-Eye diyagramı, optimal parametrelerin seçimini geliştirmek için etkili bir araç olarak kanıtlanmış, moleküler sinyallerin performansının sağlam bir değerlendirmesini sağlamaktadır.

Özet (Çeviri)

Inspired by nature, Molecular Communications (MC) has emerged over the past decade as a field that utilizes molecules as information carriers. This approach offers enhanced biocompatibility compared to traditional electromagnetic methods. The interdisciplinary nature of MC and the extensive research conducted in this area underscore its potential, particularly for medical applications. Yet, challenges such as intersymbol interference (ISI) and lower data rates, stemming from the inherent stochastic nature of MC, persist. While theoretical studies abound, bridging these concepts to practical applications remains a significant challenge, emphasizing the gap between theory and real-world implementation. Adopting an interdisciplinary approach, this thesis explores the integration of synthetic biology and molecular communications to address practical challenges in the field generating a realistic network environment. To combat the challenge of ISI, the pre-equalizer method is employed. This approach uses two interacting molecule types to mitigate the signal's heavy-tail effect. The approach is fine-tuned by a novel framework Parameter Finder to adjust the parameters of the communication scenario and MOL-Eye diagram is also integrated to enhance the precision of the molecular communication system. The findings reveal that integrating the system model with the pre-equalizer approach, alongside the use of the Parameter Finder tool, is highly beneficial for fine-tuning simulation parameters in the biological implementation of the pre-equalizer method. Additionally, the MOL-Eye diagram proves to be an effective tool for enhancing the selection of optimal parameters, providing a robust assessment of the performance of molecular signals.

Benzer Tezler

  1. Bilgisayar ağı güvenliği için hibrit öznitelik azaltma ile makine öğrenmesine dayalı bir saldırı tespit sistemi tasarımı

    Designing a machine learning based intrusion detection system with hybrid feature reduction for network security

    MUHAMMED SAFA BIÇAKCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolGazi Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİNAN TOKLU

  2. Bir beceri öğretiminin mesleklerarası eğitim yaklaşımı ile tasarlanması: Sağlık profesyonelleri birbirlerinden öğrenebilir mi?

    Designing a skill teaching with an interprofessional education approach: Can HEALTH professionals learn from EACH other?

    AYSEL BAŞER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Eğitim ve ÖğretimEge Üniversitesi

    Tıp Eğitimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HATİCE ŞAHİN

  3. Artificial neural network-based design tool for the horizontal stabilizer of a helicopter

    Bir helikopter yatay dengeleyicisi için yapay sinir ağı tabanlı tasarım aracı

    EREN DUZCU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Makine MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BORA YILDIRIM

  4. Tarla pülverizatörü için teleskopik kanat tasarımı

    Designing a telescopic boom for field sprayers

    HASAN BERK ÖZYURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Biyosistem Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLKER HÜSEYİN ÇELEN

  5. Temel el hareketlerini kontrol etmek için gerçek zamanlı bir sistem tasarımı

    Designing a real-time system to control basic hand movements

    CEMRE KARAYILMAZ CİRİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyomühendislikSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TURGAY AYDOĞAN