Synthesis and biological activity studies of some novel indole ring-linked thiazolidone hybrid molecules
Yeni bazı indol ve tiyazolidine halkalarını birlikte taşıyan moleküllerin sentezi ve biyolojik aktivite
- Tez No: 883867
- Danışmanlar: Prof. Dr. HÜLYA AKGÜN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Kimya, Pharmacy and Pharmacology, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Indol, Tiyazolidin-4-on, Antimikrobial, Antikancer, sitotoksisite, Tubülin, Tubülin Polmerizasyonu İnhibisyonu, Vinblastin, Indole, Thizaolidin-4-one, Antimicrobial, Anticancer, cytotoxicity, Tubulin, Tubulin Polymerization Inhibitors, Vinblastine
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Farmasötik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 207
Özet
Abba, A. Yeni Bazı İndol ve Tiyazolidine Halkalarını Birlikte Taşıyan Moleküllerin Sentezi ve Biyolojik Aktivite Çalışmaları, Yeditepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Doktore Tezi, Farmasötik Kimya Programı, İstanbul, 2024. Bu çalışmanın amacı yeni indol-tiyazolidin-4-on hibrit bileşiklerinin sentezi, yapı aydınlatılması, biyolojik aktivite çalışmalarının yapılması ve in-silico ADME özelliklerinin belirlenmesidir. Bu çalışmada, (2E/Z,5E/Z)-5-(substitüe) benziliden-2-{[2-(3H-indol-3-il)etil]imino}-3-fenil-1,3-tiyazolidin-4-on türevleri 3 basamakta sentezlendi. Birinci basamakta, 1-(2-(indol-3-il) etil)-3-feniltiyoüre (I) fenilizotiyosiyanat'ın toluen içinde çözülüp triptamin ilave edilerek oda ısısında 2 saat ısıtılması ile elde edildi. İkinci basamakta bileşik I ve susuz sodium asetat ethanol içinde çözüldü, soğutuldu ve üzerine kloroasetil klorür ilave edilerek 12 saat ısıtılarak bileşik (2E/Z)-2-{[2-(3H-indol-3-yl)ethil]imino}-3-fenil-1,3-tiyazolidin-4-on (II) sentezlendi. Son basamakta ise bileşik (II) etanol içinde çözündükten sonra pipiridin ilave edilerek ortam bazik yapıldı ve bu karışımın üstüne uygun aromatic aldehitler ilave edilerek 30 dakika ısıtılarak 24 adet yeni (2E/Z,5E/Z)-5-(substitüe) benziliden-2-{[2-(3H-indol-3-yl)etil]imino}-3-fenil-1,3-tiyazolidin-4-on (III) türevi bileşik hazırlandı. Bileşiklerin yapı tayinlerinde IR, 1H NMR, 13C NMR and LC/Q-TOF teknikleri kullanıldı. Sentezlenen bileşiklerin (1-24) anti-microbial activiteleri disk diffüzyon metodu kullanılarak Enterococcus hirae ATCC 10541, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Staphylococcus aureus ATCC 6538, Escherichia coli ATCC 10536, Acinetobacter baumannii ATCC 19606, Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442, and Candida albicans ATCC 10231 suşları üzerinde denendi. Bileşikler test edilen mikroorganizmalar üzerinde orta derecede etkili bulundu. Bileşiklerden 4, 8, 10, 11, 12, 14, 19, 21 ve 24'ün Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli üzerindeki inhibisyon zonu 18 mm olarak ölçüldü. Aynı bileşikler C. albicans (anti-fungal) karşı ise 15mm lik bir zon oluşturdu. Bileşiklerin ait MIC değerleri ise agar dilusyon metodu kullanılarak aynı mikroorganizmalara karşı ölçüldüğünde bu değerin 25 μg/mL olduğu saptandı. Sentezlenen bileşiklerin (1-24) sitotoksik etkileri göğüs kanseri hücreleri (MCF-7), sağlıklı meme epitel hücreler (MCF12A), insan göbek damarı endotel hücreleri (HUVEC), adenokarsinomik insan alveolar basal epitel hücreleri (A549) ve insan prostat kanser hücre hatlarında (PC3) denendi. Test edilen bileşikler farmakofor gruplarına göre yüksek ve orta derecede sitotoksik aktivite gösterdiler. Bileşik 8, 10, 15, 21 ve 23 en aktif ve seçici bileşikler olarak saptandı. Bu bileşikler daha sonra tubulin polimerization inhibisyon aktiviteleri ölçülmek için seçildi ve bileşikler tubulin polimerizasyonuna ilk 20 dakika içinde vinblastine-benzeri bir inhibisyon gösterdiler. Bileşiklerin hidrojen bağ yapma kapasiteleri, partisyon katsayısı (n-octanol /su (log Po/w) kapasiteleri, sudaki çözünürlükleri, (log S), farmakokinetik ve deri geçirgenliği (log Kp) absorpsiyon, dağılım, metabolizma ve eliminasyon (ADME) özellikleri SwissADME modulü kullanılarak belirlendi. Aşağıda sentezlenen bileşiklerin genel formülü verilmiştir. R: H, 4-nitro, 4-kloro, 3-metil, 3-metoksi, 2-etil, 2-metil, 4-hidroksi, 3-fluoro, 3-etoksiy-4-hidroksi, 2-metoksi, 2,4-dimetoksi, 4-bromo, 4-fluoro, 3-hidroksi-4-metoksi, 2,3-dimetil, 2-bromo, 3-bromo-4-hidroksi , 2,5-dimetill, 3,5-dibromo-4-hydroxy, 3,4-dimetill, 2,4,5-trimetoksi, 3,5-dikloro, ve 2,5-dikloro.
Özet (Çeviri)
Abba, A. Synthesis and Biological Activity Studies of Some Novel Indole Ring Linked Thiazolidone Hybrid Molecules Yeditepe University Institute of Health Science, PhD Thesis on Pharmaceutical Chemistry Programme, İstanbul, 2024. The purposes of this study were the synthesis, characterization, biological activities and in silico ADME studies of novel indole-thiazolidin-4-one hybrid compounds. In this study, (2E/Z,5E/Z)-5-(substituted) benzylidene-2-{[2-(3H-indol-3-yl)ethyl]imino}-3-phenyl-1,3-thiazolidin-4-one derivatives were synthesized through 3 steps protocol. In the first step, 1-(2-(indole-3-yl) ethyl)-3-phenylthiourea (I) was synthesized by dissolving phenylisothiocyanate in toluene and combined with tryptamine at room temperature for 2 hours. In the second step, compound I was dissolved in ethanol and followed by the addition of anhydrous sodium acetate, the mixture was kept in cold medium in order to introduce chloroacetyl chloride and refluxed for 12 hours to produce (2E/Z)-2-{[2-(3H-indol-3-yl)ethyl]imino}-3-phenyl-1,3-thiazolidin-4-one (II). Finally, product (II) was dissolved in ethanol and followed by the addition piperidine as base and the desired derivative of aromatic aldehydes and refluxed 30 minutes in order to obtaine twenty four novel derivatives of the final form of product (III) (2E/Z,5E/Z)-5-(substituted) benzylidene-2-{[2-(3H-indol-3-yl)ethyl]imino}-3-phenyl-1,3-thiazolidin-4-one. Structure identification of the synthesized compounds was done by spectral methods such as IR, 1H NMR, 13C NMR and LC/Q-TOF Spectrum methods. The anti-microbial activity of compounds 1-24 was assessed using the disc diffusion method. Compounds were subjected to testing against Enterococcus hirae ATCC 10541, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Staphylococcus aureus ATCC 6538, Escherichia coli ATCC 10536, Acinetobacter baumannii ATCC 19606, Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442, and Candida albicans ATCC 10231. The synthesized compounds showed moderate activity in general against the tested microorganism. The highest anti-bacterial activity against Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli compounds 4, 8, 10, 11, 12, 14, 19, 21 and 24 gave the highest inhibition zone of 18 mm. While the highest anti-fungal activity against C. albicans was observed through compounds 4, 8, 10, 11, 12, 14, 19, 21, 24 as the best in terms of the inhibition zone by having a diameter of 15 mm. Also, agar dilution method for MICs determination of antimicrobial activity of these compounds was tested against Enterococcus hirae ATCC 10541, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Staphylococcus aureus ATCC 6538, Escherichia coli ATCC 11229, Acinetobacter baumannii ATCC 19606, Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442 and Candida albicans ATCC 10231 microorganisms. The minimum inhibitory concentration of the compounds 4, 8, 10, 11,12, 14, 19, 21 and 24 against Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and C. albicans were 25 μg/mL. On the other hand, the synthesized compounds (1-24) demonstrated their cytotoxic effects on breast cancer cell line (MCF-7), non-tumorigenic mammary epithelial cells (MCF12A), Human Umbilical Vein Endothelial Cell (HUVEC), adenocarcinomic human alveolar basal epithelial cells (A549) and human prostate cancer cell line (PC3). The tested compounds showed excellent to moderate cytotoxic activity according to their pharmacophore moiety. The compounds 8, 10, 15, 21 and 23 showed the highest activities in terms of minimum inhibitory effect and selectivity. For that, they were selected for their tubulin polymerization inhibitory activity, where they showed vinblastine-like activity in inhibiting the tubulin polymerization for 20 minutes. Within the scope of in-silico studies, the values of the synthesized compounds were tested for their ability in hydrogen bonding formation, the partition coefficient between n-octanol and water (log Po/w), Water Solubility (log S), pharmacokinetics and skin permeability (log Kp) regarding absorption, distribution, metabolism and elimination properties (ADME) were calculated using the SwissADME module. The below structure shows the general formula of synthesized compounds. R: H, 4-nitro, 4-chloro, 3-methyl, 3-methoxy, 2-ethyl, 2-methyl, 4-hydroxy, 3-fluoro, 3-ethoxy-4-hydroxy, 2-methoxy, 2,4-dimethoxy, 4-bromo, 4-fluoro, 3-hydroxy-4-methoxy, 2,3-dimethyl, 2-bromo, 3-bromo-4-hydroxy , 2,5-dimethyl, 3,5-dibromo-4-hydroxy, 3,4-dimethyl, 2,4,5-trimethoxy, 3,5-dichloro, and 2,5-dichloro.
Benzer Tezler
- Heterosiklik yapıdaki bazı bileşiklerin sentezi, yapı aydınlatılması ve biyolojik etki çalışmaları
Synthesis, structural analysis and studies of biological activity of some heterocyclic compounds
SELEN GÜRKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ERDEM BÜYÜKBİNGÖL
- Metil-sübstitüe metoksi konduritollerin sentezi
Synthesis of methyl-substituted methoxy conduritols
DİLEK KAPLAN
- Çinko katkılı antibakteriyel özellikte hidroksiapatit üretimi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of zinc-doped antibacterial hydroxyapatite
SÜLEYMAN ÇINAR ÇAĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Makine MühendisliğiMersin ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖNDER ALBAYRAK
- Klon ve normal sığır embriyo plasentalarında insülin benzeri büyüme faktör-ı (IGF-I), vasküler endotelyal büyüme faktör (VEGF) ve nöronal hücre adhezyon molekül (NCAM) ekspresyonun immunositokimyasal ve moleküler tekniklerle incelenmesi
Evaluation of expression of insulin-like growth factor-i (IGF-I), vascular endothelial growth factor (VEGF) and neuronal cell adhesion molecule (NCAM) by immunocytochemical and molecular techniques in cloned and normal bovine placentas
FATİH KARAKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyoteknolojiKocaeli ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKKI DALÇIK
PROF. DR. SEZEN ARAT
- Hint yağından azelaik asid sentezi ve bu asid'in dioktil- ve dinonil- esterlerinin lipaz ile invitro otrtamda etkileşimi
Synthesis of azelaic acid from castor oil and in vitro interaction of dioctyl and dinonyl esthers of this acid with lipase
GÜLEN TÜRKER