Iraklı bir grup hastada HAD-1 ve HBD-1 genlerindeki genetik polimorfizm ile Hepatit C enfeksiyonunun ilerlemesi ve şiddeti arasındaki korelasyonun araştırılması
Investigation of correlation between genetic polymorphism in HAD-1 and HBD-1 genes with progression and severity of Hepatitis C infection in a group of Iraqi patients
- Tez No: 921792
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜGE FIRAT
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hepatit C virüsü (HCV), tek sarmallı bir RNA virüsüdür. Şimdiye kadar sekiz viral genotip ve 67'den fazla HCV alt tipi tanımlanmıştır. HCV ile enfekte olan hastaların %15'inde akut hepatit, %80'inde ise kronik enfeksiyon gelişmektedir. Dünya çapında tahminen 71 milyon kişi HCV ile kronik olarak enfekte olmuştur. Kronik olarak enfekte olan hastaların %20'sinde 25 yıl içinde siroz gelişmekte ve sirotik hastaların %25'inde ise hepatoselüler karsinom görülmektedir. Hastaların <%30'unda semptomatik olan akut HCV enfeksiyonu gelişmektedir. Enfekte bireylerin yaklaşık %30'u 6 ay içinde HCV'yi kendiliğinden temizler. İnsanların en az %60-80'inde anti-HCV antikorlarının varlığı ve HCV RNA'sının en az 6 ay boyunca kanda kalması olarak tanımlanan kronik HCV enfeksiyonu gelişmektedir. Bu kesitsel çalışma laboratuvarca doğrulanmış HCV enfeksiyonu olan 100 erkek hasta ile 80 sağlıklı erkek kan bağışçısından oluşan kontrol grubu olarak iki çalışma grubunu içermektedir. Katılımcıların anti-HCV Ab, total serum bilirubin, ALT, AST, alkalin fosfataz, eritrosit sedimantasyon hızı, tam kan sayım ölçümleri ile IL-6, IL-28, IFN-γ, TNFα, İnsan Beta defensin 1 (HBD-1) ve İnsan Alfa defensin-1 (HAD-1) tayinleri tamamlanmıştır. Hastalar için ayrıca moleküler teknikler uygulanmış ve HCV nükleotid dizileri elde edilmiştir. Verilerin istatistiksel analizlerinde SAS yazılımı kullanılmış, ANOVA, t-testi, Mann-Whitney testi ve ROC eğrileri uygulanmıştır. P < 0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir. Popülasyonun H-W dengesinde olup olmadığını belirlemek için ki-kare testi de kullanılmıştır. Hastalardaki belirteçler arasında korelasyon katsayısı hesaplanmıştır. Sonuçlar, hastalarda IL-28, IL-6, TNF-α, IFN-γ, HBD-1 ve HAD-1 düzeylerinin kontrollere göre anlamlı derecede yüksek olduğunu göstermiştir (P<0,01). Tam kan sayımında; beyaz kan hücreleri (WBC), granülosit, eritrosit (RBC) ve trombosit sayıları hastalarda anlamlı derecede yüksek bulunurken, Hb düzeyleri düşük bulunmuştur. Karaciğer enzimleri ve bilirubin düzeyleri de hastalarda yüksek bulunmuştur. HBD-1 ile HAD-1 arasında pozitif korelasyon (r=0,274, P=0,006), HBD-1 ile TNF-α ve IFN-γ arasında negatif korelasyon (sırasıyla r=-0,340, P=0,001 ve r=-0,229, P=0,022) tespit edilmiştir. Moleküler analizler, HBD-1 ve HAD-1 genlerinde tek nükleotid polimorfizmleri (SNP'ler) olduğunu ve bu SNP'lerin hastalarda anlamlı derecede yüksek frekansa sahip olduğunu göstermiştir. Çalışma, HCV ile enfekte hastalarda HBD-1 ve HAD-1'in önemli ölçüde eksprese edildiğini, sitokinlerle korelasyon gösterdiğini ve HCV patogenezinde rol oynayabileceğini ortaya koymuştur. Bu bulgular, HCV enfeksiyonunun immünopatogenezine ışık tutmaktadır
Özet (Çeviri)
Hepatitis C virus (HCV) is a single-stranded RNA virus. Eight viral genotypes and more than 67 HCV subtypes have been identified to date. Acute hepatitis develops in 15% of patients infected with HCV, and chronic infection in 80%. An estimated 71 million people worldwide are chronically infected with HCV. Cirrhosis develops in 20% of chronically infected patients within 25 years, and hepatocellular carcinoma develops in 25% of cirrhotic patients. Acute HCV infection, which is symptomatic, develops in <30% of patients. Approximately 30% of infected individuals spontaneously clear HCV within 6 months. At least 60–80% of individuals develop chronic HCV infection, defined as the presence of anti-HCV antibodies and the persistence of HCV RNA in the blood for at least 6 months. This cross-sectional study included two study groups as 100 male patients with laboratory-confirmed HCV infection and 80 healthy male blood donors as a control group. Participants' anti-HCV Ab, total serum bilirubin, ALT, AST, alkaline phosphatase, erythrocyte sedimentation rate, complete blood count measurements and IL-6, IL-28, IFN-γ, TNFα, Human Beta defensin 1 (HBD-1) and Human Alpha defensin-1 (HAD-1) determinations were completed. Molecular techniques were also applied for the patients and HCV nucleotide sequences were obtained. SAS software was used in the statistical analysis of the data, ANOVA, t-test, Mann-Whitney test and ROC curves were applied. P < 0.05 was considered statistically significant. Chi-square test was also used to determine whether the population was in H-W balance. Correlation coefficient was calculated between the markers in the patients. The results showed that IL-28, IL-6, TNF-α, IFN-γ, HBD-1 and HAD-1 levels were significantly higher in patients than in controls (P<0.01). In complete blood count; white blood cell (WBC), granulocyte, erythrocyte (RBC) and platelet counts were found to be significantly higher in patients, while Hb levels were found to be low. Liver enzymes and bilirubin levels were also high in patients. A positive correlation was found between HBD-1 and HAD-1 (r=0.274, P=0.006), and a negative correlation was found between HBD-1 and TNF-α and IFN-γ (r=-0.340, P=0.001 and r=-0.229, P=0.022, respectively). Molecular analyses showed that there were single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the HBD-1 and HAD-1 genes and that these SNPs had a significantly higher frequency in patients. The study revealed that HBD-1 and HAD-1 were significantly expressed in HCV-infected patients, correlated with cytokines, and may play a role in HCV pathogenesis. These findings shed light on the immunopathogenesis of HCV infection.
Benzer Tezler
- Correlation between COVID-19 and biochemical laboratory markers: Serum ferritin, procalcitonin, troponine and some enzymes for Iraqi patients
COVİD-19 ve biyokimyasal laboratuvar belirteçleri arasındaki korelasyon: Iraklı hastalar için serum ferritin, prokalsitonin, troponin ve bazı enzimler
KHALID ZAITER KHALAF
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLIHAN GÜNEL
DOÇ. DR. MUHAMMAD HAMMAD ALAJEELY
- Investigation of the relationship between vitamin d and osteoporosis in patients individuals with gout
Gut hastası bireylerde d vitamini ve osteoporoz ilişkisinin araştırılması
JAMAL YOUNIS MUSTAFA ALBIRO
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KARAİPEKLİ
- Kardiyovasküler hastalığı olan Iraklı hastalardaklotho - protein interlökin- 10 ve dislipidemi arasındakiilişkilerin değerlendirilmesi
Evaluation of the associations between klotho-protein, interleukin-10, and dyslipidemia in Iraqi patients with cardiovascular disease
ALI SHAKIR DAKHIL AL-BRAYSEE
Doktora
Türkçe
2025
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU
- Hormonal changes in polycystic ovarian syndrome as related to metabolic syndrome in Iraqi women
Irak kadınlarında polikistik over sendromunda hormonal değişiklikler ve metabolik sendromu ile ilişkisi
VESEN ATİROĞLU
- Tip 2 diyabet hastalarında Omentin-1 ve aldosteron düzeylerinin ölçümü ve biyokimyasal parametrelerle ilişkisi
Measurement of Omentin-1 and aldosterone levels in type 2 diabetes patients and their relationship with biochemical parameters
RUSUL MOHAMMED NAFEA AL-ZUBAIDI
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyokimyaKütahya Dumlupınar ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN BÜLBÜL
DR. ÖĞR. ÜYESİ AMER HASAN ABDULLAH