Candida auris izolatlarının tanımlanmasında yeni bir kromojenik besiyerinin retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of a new chromogenic medium for the identification of Candida auris isolates
- Tez No: 933551
- Danışmanlar: PROF. DR. BEYZA ENER
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Candida auris, CC plus besiyeri (CHROMagar), MALDI-TOF-MS, Candida auris, CC plus medium (CHROMagar), MALDI-TOF-MS
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Antifungallere oldukça dirençli olan Candida auris, görülme sıklığın giderek artan fungal bir patojendir. Tanımlamada, konvasiyonel yöntemler yetersiz kaldığından proteomik veya genomik yaklaşıma ihtiyaç duyulmakta, ancak bu yaklaşımlar her merkezde kullanılmamaktadır. Bu çalışmada ekonomik bir alternatif olan CHROMagarTM Candida Plus besiyerinin (CC-Plus; CHROMagar, Paris Fransa) değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmamızda, C. auris klinik suşları kullanılmıştır.. Canlandırılan suşlar“Matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry”(MALDI-TOF-MS) ile tanımlanmış ve“Main Spectra Profile”(MSP) dayalı olarak Compass Explorer yazılımında dendrogram çizilmiştir. CC-Plus besiyerine (CHROMagar) ekim yapılmış ve antifungal duyarlılıklarına bakılmıştır. Bu çalışmada, Mayıs 2023-Ekim 2024 arasında 23 hastaya ait 95 C. auris klinik suşu kullanılmıştır. Tüm suşlar, CC-Plus besiyerinde 48 saatte değerlendirilebilir koloniler oluşturmuştur. Suşların %53,7'si“belirgin mavi halosu olan kremsi mavi renkli büyük koloniler (Koloni A)”oluştururken, %46,3'ü“silik mavi halosu olan kremsi pembe renkli küçük koloniler (Koloni B)”oluşturmuştur.“B”tipi koloni oluşturanların hepsi Genel Cerrahi Yoğun Bakımında yatan hastalardan izole edilmiş, %88,6'sı MALDI-TOF-MS ile oluşturulan dendrogramda ayrı bir grup oluşturmuş ve anlamlı olarak düşük (%2,3) amfoterisin B direnci göstermişlerdir. Karışık süspansiyonlarda C. parapsilosis hariç diğer türler rahatlıkla ayrılabilmiştir. Tüm suşlar değerlendirildiğinde çok büyük kısmı (%91,6) flukonazole, yarıya yakını (%46,3) amfoterisin B'ye dirençli olup ekinokandin direnci (%4,2) yüksek bulunmamıştır. Ayrıca çalışmada üç suşta (%3,2) panfungal direnç görülmüştür. Sonuç olarak bu çalışmada C. parapsilosis hariç CC plus besiyerinin (CHROMagar) tanımlamada yeterli oluğu; farklı koloni morfolojilerine sahip suşların epidemik, proteomik ve antifungal duyarlılık paternine göre gruplar iii oluşturduğu; flukonazol direncinin yüksek, ekinokandin direncinin düşük ve amfoterisin B direncinin değişken olduğu ve panfungal dirençli suşun merkezimizde görüldüğü bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
Candida auris, which is highly resistant to antifungal drugs, is a fungal pathogen with increasing incidence. Since conventional methods are inadequate for identification, proteomic or genomic approaches are needed, but these approaches are not available in all centers. In this study, we aimed to evaluate CHROMagarTM Candida Plus medium (CC-Plus; CHROMagar, Paris, France) as an economical alternative. Clinical strains of C. auris were used in our study. The recovered strains were identified by matrix-assisted laser desorption ionisation-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) and a dendrogram was drawn in Compass Explorer software based on the main spectra profile (MSP). CC-Plus medium (CHROMagar) was inoculated and antifungal susceptibility was determined. This study used 95 clinical strains of C. auris from 23 patients between May 2023 and October 2024. All strains formed evaluable colonies on CC-Plus medium after 48 hours. While 53.7% of the strains formed“large creamy blue colonies with a distinct blue halo (colony A)”, 46.3% formed“small creamy pink colonies with a faint blue halo (colony B)”. All 'B' type colonies were isolated from patients admitted to the General Surgical Intensive Care Unit, 88.6% formed a separate group in the MALDI-TOF-MS dendrogram and showed significantly low (2.3%) amphotericin B resistance. In mixed suspensions, all strains except C. parapsilosis were easily separated. When all strains were evaluated, the majority (91.6%) were resistant to fluconazole, almost half (46.3%) were resistant to amphotericin B and echinocandin resistance (4.2%) was not high. In addition, pan-fungal resistance was observed in three strains (3.2%). In conclusion, in this study, CC plus medium (CHROMagar) was sufficient for identification except for C. parapsilosis; strains with different v colony morphologies formed groups according to epidemiological, proteomic and antifungal susceptibility patterns; fluconazole resistance was high, echinocandin resistance was low and amphotericin B resistance was variable and panfungal resistant strains were observed in our center.
Benzer Tezler
- Kan kültürlerinden hastane kaynaklı izole edilenCandida auris'in farklı yöntemlerle tanımlanması veantifungal duyarlılıklarının değerlendirilmesi
Identification of Candida auris isolated from blood cultures from hospital origin with different methods and evaluatoon of their antifungal susceptibility
FATİH GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN
- Candida izolatlarında kan kültürü şişesinden hızlı antifungal yöntemi güvenilir mi?
Is the rapid antifungal testing from blood culture bottles reliable for candida isolates?
DAMLA KÖKLÜ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. DENİZ TURAN
- Çeşitli klinik örneklerden üretilen candida auris izolatlarının antifungal duyarlılıklarının ve virülans faktörlerinin araştırılması
Investigation of antifungal susceptibility and virulence factors of candida auris isolates recovered from various clinical samples
ASLI ÇELİKKOL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN KARAARSLAN
- Akdeniz Üniversitesi Hastanesinde izlenen Candida auris'in etken olduğu kandidemi olgularında epidemiyolojik özelliklerin ve Candida auris izolatlarının antifungal duyarlılıklarının saptanması
Epidemiological characteristics and antifungal susceptibility of Candida auris isolates in Candidemia cases at Akdeniz University Hospital
PINAR TUFANOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM KOYUNCU ÖZYURT
- Gaziantep Üniversitesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında klinik örneklerden izole edilen Candida auris izolatlarının identifikasyon yöntemlerinin, antifungal duyarlılıklarının ve virülans faktörlerinin incelenmesi
Investigation of identification methods, antifungal susceptibility and virulence factors of Candida auris isolates isolated from clinical samples in Gaziantep University Microbiology Laboratory
ESRA NUR SİZER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASEMİN ZER