Oküler nadir hastalık modellemesine yönelik hasta iPKH temelli kornea organoidlerinin geliştirilmesi; Aniridia
Development of patient iPSC-derived cornea organoids as ocular rare disease model; Aniridia
- Tez No: 937455
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SİNAN GÜVEN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Göz Hastalıkları, Biology, Genetics, Eye Diseases
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 144
Özet
Aniridia, öncelikle PAX6 mutasyonlarından kaynaklanan nadir bir doğuştan gelen göz hastalığıdır ve Aniridiye Bağlı Keratopati (AAK) olarak bilinen ilerleyici kornea dejenerasyonuna yol açar. AAK, limbik kök hücre yetmezliği (LSCD) nedeniyle korneanın damarlanması, opaklaşması ve keratinizasyonu ile sonuçlanır. Günümüzde AAK'yi incelemek için sınırlı sayıda in vitro model bulunmaktadır, bu da hastalığın patogenezinin ve tedavisinin araştırılmasını zorlaştırmaktadır. Bu çalışma, hasta kaynaklı indüklenmiş pluripotent kök hücreler (iPSC'ler) kullanarak 3 boyutlu (3D) bir kornea organoid modeli geliştirmeyi amaçlamaktadır. Bu modelin AAK fenotiplerini yansıtacağını ve in vitro terapötik testler için bir platform sağlayacağını hipotez olarak öne sürüyoruz. Hasta kaynaklı iPSC'ler kornea organoidlerine farklılaştırılmış ve immünboyama, gen ekspresyon profillemesi ve histolojik analizler kullanılarak karakterize edilmiştir. Ayrıca, moleküler düzensizlikleri belirlemek amacıyla ileri omik yaklaşımlar olan transkriptomik ve metabolomik analizler de uygulanmıştır. Elde edilen organoid bazlı kornea modeli, AAK için ilaç yeniden kullanılması (drug repurposing) çalışmalarına yönelik bir test platformu olarak kullanılmıştır. Bu tez çalışması, nadir bir hastalığa yönelik olarak hasta kaynaklı iPSC'lerin bir in vitro organoid modelinde kullanım stratejisini ortaya koymakta ve ilaç yeniden konumlandırma açısından modelin potansiyelini doğrulamaktadır. Üretilen kornea organoidleri, kornea dokusunun gelişimini taklit ederek ilgili hastalık mekanizmalarının daha derinlemesine anlaşılmasını sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Aniridia is a rare congenital eye disorder primarily caused by PAX6 mutations, leading to progressive corneal degeneration known as Aniridia-Associated Keratopathy (AAK). AAK results from limbal stem cell deficiency (LSCD), causing vascularization, opacification, and keratinization of the cornea. Currently, there are limited in vitro models to study AAK, hindering research on its pathogenesis and treatment. This study aims to develop a three-dimensional (3D) corneal organoid model of AAK using patient-derived induced pluripotent stem cells (iPSCs). We hypothesize that this model will replicate AAK phenotypes and enable in vitro therapeutic testing. Patient-derived iPSCs were differentiated into corneal organoids and characterized using immunostaining, gene expression profiling, and histological analysis. Advanced omics approaches, including transcriptomics and metabolomics, were also employed to identify molecular dysregulations. Generated organoid based cornea model was utilized as test platform for drug repurposing towards AAK. This thesis work shows a strategy on utilization of patient derived iPSCs to achieve an in vitro organoid model of a rare disease and validate its potential as test bed for drug reproposing. Generated cornea organoids recapitulate development of cornea tissue formation and facilitate a deeper understanding of associated disease mechanisms.
Benzer Tezler
- Kornea distrofilerinde keratoplasti sonuçları
Results of keratoplasty in corneal dystrophies
TAMER TAKMAZ
- Klinik ve genetik olarak özgün bir miyopati: Okülofaringodistal miyopati (47 Türk hastanın değerlendirilmesi)
Oculopharyngodistal myopathy is a distinct entity - clinical and (Genetic features of 47 patients)
HACER DURMUŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Nörolojiİstanbul ÜniversitesiNöroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PİRAYE OFLAZER
- Determination of the role of pyridostigmine treatment in myasthenia gravis disease at molecular level by infrared spectroscopy
Başlık çevirisi yok
CEREN ÇELİK
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyofizikAltınbaş ÜniversitesiBiyomedikal Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERİDE SEVERCAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYÇA DOĞAN
- Investigation of novel genes in autosomal dominant Behçet syndrome
Otozomal dominant Behçet sendromunda özgün genlerin araştırılması
GAMZE TURAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Williams sendromlu hastalarda klinik ve genetik bulguların değerlendirilmesi
Evaluation of clinical and genetic findings in patients with Williams syndrome
AYÇA GÖKÇE COŞKUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA KILIÇ