In silico investigation of the atavistic model of cancer
Kanserin atavistik modelinin in silico araştırılması
- Tez No: 953285
- Danışmanlar: ÖĞR. GÖR. ATHANASIA PAVLOPOULOU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Kanser, hücresel iş birliğini sağlayan genlerin görevlerini yerine getirememelerinden kaynaklanarak çok hücreli sistemlerin işleyişini bozar. Dikkat çekici bir şekilde, kanser atavistik özellikler gösterir; bu, kanser hücrelerinin geleneksel Darwinci evrimden saparak evrimsel yollarında kendine özgü bir rota izlediklerini gösterir. Bu bağlamda, kanser hücreleri kontrolsüz çoğalma, hücre ölüm mekanizmalarından kaçış ve değişmiş metabolizma gibi hücre büyümesi ve hayatta kalma ile ilgili eski biyolojik programları yansıtan özellikler sergileyebilir. Bu çalışmada bazal metazoan Hydra'da oluşan tümörlerle ilişkili proteinleri ve bunların farklı taksonlar boyunca korunmasını analiz ederek kanserin evrimsel kökenini incelemek amaçlanmıştır. Bu çalışmada Hydra tümörlerinde protein kodlayan transkriptlerin evrimsel korunma durumunu araştırmak için biyoinformatik yaklaşımlar kullanılmıştır. Bu analizler, hem tek hücreli hem de çok hücreli yaşam formlarını temsil eden türler arasında gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Hydra tümörleriyle ilişkili proteinlerin taksonomik dağılımını inceleyerek, kanserin evrimsel kökenleri seçilen temsilci türler boyunca takip edilmiştir. Hydra tümörlerinde protein kodlayan genlerin çoğunluğunun tek hücreli kökenli olduğu ve insanda kanserle ilişkili olduğu bulunmuştur. Sonuç: Çalışmada Hydra tümörlerinde ifade edilen genlerin evrimsel süreç boyunca korunumu ortaya çıkarılmıştır. Hydra'nın kanser araştırmalarında model organizma olarak değerlendirilebileceği önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
Purpose: Cancer manifests as a disruption in the regular functioning of multicellular systems, arising from the malfunctioning of genes responsible for cellular cooperation. Notably, cancer exhibits atavistic characteristics, wherein cancer cells diverge from the conventional Darwinian evolution, highlighting a distinctive trajectory in their evolutionary fate. In this context, cancer cells may display traits such as uncontrolled proliferation, evasion of cell death mechanisms and altered metabolism, which could reflect ancient biological programs related to cell growth and survival. The objective of this study was to trace the evolutionary origin of cancer by analyzing tumor-related proteins in the basal metazoan Hydra and their preservation across diverse taxa. To this end, bioinformatic approaches were employed to investigate the conservation status of protein-coding transcripts that are differentially expressed in the tumor-bearing Hydra across species, representing both unicellular and multicellular forms of life. By examining the taxonomic distribution of the Hydra polyp-related proteins, we have traced the ancient evolutionary roots of cancer through the tree of life. The majority of protein-coding genes were found to be of unicellular origin and associated with cancer. We suggest conservation of the atavistic model of cancer in the basal tumor-bearing animals, which can be considered as promising and intriguing candidate model organisms in cancer research.
Benzer Tezler
- Investigation of asymmetric synthesis of chiral amines by biological oxidoreductase enzymes by computational methods
Biyolojik oksidoredüktaz enzimleri ile kiral aminlerin asimetrik sentezinin hesaplamalı kimya yöntemleri ile incelenmesi
MERVE KOPAR
- Ovulasyon indüksiyonu tedavisinde folliküler gelişimin ultrasonografik takibi
Başlık çevirisi yok
MERİH BAYRAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Çimentonun sertleşmesi üzerinde kimyasal komponentlerin etkisi
Başlık çevirisi yok
NACİYE TÜRKEL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CEBE
- Bazı esterlerin kinetik incelenmesi ve termodinamik parametrelerin belirlenmesi
Kinetic study and detesmination of thermodnamic parameters of some esters
İBRAHİM TAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CEBE
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
