Geri Dön

Uygulamalı kategori teorinin Biyolojide güncel gelişimi

Current development of applied category theory in biology

  1. Tez No: 957084
  2. Yazar: REMZİ YUNUS EMRE DOĞAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. KORAY YILMAZ, DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU CEREN FİDAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Matematik, Mathematics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kütahya Dumlupınar Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Matematik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Bu tezde, kategori teorisinin temel kavramları ve bu kavramların biyolojik sistemlerin modellenmesinde kullanımı incelenmiştir. Çalışmanın ana amacı, kategori teorisinin sunduğu soyutlama gücünü kullanarak, biyolojik süreçlerin ve genetik ilişkilerin daha bütüncül ve anlamlı bir şekilde temsil edilmesini sağlamaktır. Bu kapsamda, öncelikle kategori, obje ve morfizm gibi temel yapılar tanıtılmış; ardından, olog kavramı ve biyolojik sistemlerdeki uygulamaları detaylı olarak ele alınmıştır. Tezde, özellikle böcek genetiği örneği üzerinden, ologların biyolojik verilerin kategorik olarak modellenmesinde nasıl kullanılabileceği gösterilmiştir. Ayrıca, evrensel objeler başlığı altında çarpım, eşçarpım, geriçekme ve ileriitme gibi yapılar incelenmiş ve bu yapıların biyolojik modellemedeki karşılıkları tartışılmıştır. Yöntem olarak, hem teorik açıklamalar hem de uygulamalı örnekler bir arada sunulmuş; kategori teorisinin biyolojik modellemede sunduğu avantajlar vurgulanmıştır. Elde edilen bulgular, kategori teorisinin ve ologların, biyolojik sistemlerin karmaşıklığını anlamada ve modellemede güçlü bir araç olduğunu göstermektedir. Bu çalışma, kategori teorisinin biyolojik modellemede kullanılmasına dair literatürdeki boşluğu doldurmakta ve bu alanda yeni bir bakış açısı sunmaktadır.

Özet (Çeviri)

In this thesis, the fundamental concepts of category theory and their application to the modeling of biological systems are examined. The main objective of the study is to utilize the abstraction power of category theory to provide a more holistic and meaningful representation of biological processes and genetic relationships. In this context, basic structures such as categories, objects, and morphisms are introduced, followed by a detailed discussion of the concept of ologs and their applications in biological systems. The thesis demonstrates, particularly through the example of insect genetics, how ologs can be used to categorically model biological data. Furthermore, under the topic of universal objects, structures such as product, coproduct, pullback, and pushout are analyzed, and their counterparts in biological modeling are discussed. Both theoretical explanations and practical examples are presented as part of the methodology, emphasizing the advantages offered by category theory in biological modeling. The findings show that category theory and ologs are powerful tools for understanding and modeling the complexity of biological systems. This study fills a gap in the literature regarding the use of category theory in biological modeling and offers a new perspective in this field.

Benzer Tezler

  1. Design for positive breast self-examination experience: an investigation into mobile health apps

    Kendi kendine meme muayenesinde pozitif deneyim için tasarım: mobil sağlık uygulamalarına yönelik bir araştırma

    AYLİN KARADENİZ KÜÇÜK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Endüstri Ürünleri TasarımıOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Endüstriyel Tasarım Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHAR ŞENER PEDGLEY

  2. 2-fold structures and homotopy theory

    2 katlı yapılar ve homotopi teorisi

    RED HADERI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Matematikİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Matematik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGÜN ÜNLÜ

  3. Beklenti-değer temelli öğretimde yazma becerileri ve motivasyon ilişkisi

    The relation between wri̇ti̇ng ski̇lls and motivation in teachi̇ng based upon the expectancy-value

    TUĞBA BARUTCU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Eğitim ve ÖğretimGazi Üniversitesi

    Türkçe Eğitimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATMA AÇIK

  4. Sosyal yapılandırmacılık bağlamında okulun kimlik inşası: Bir Temellendirilmiş kuram çalışması

    School's identity construction in the context of social constructivism: A Grounded theory study

    SU ERTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Eğitim ve ÖğretimGazi Üniversitesi

    Eğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN KOŞAR

  5. Epileptik psiko-sendromlu yetişkinlerde bilişsel süreçler, afektif süreçler ve sosyal çevreyle ilişkilerin yönetici işlev becerilerine göre incelenmesi

    The examination of cognitive functions, affective processes and social contact concerning executive functions in adults with epileptic psycho-syndrome

    ALEV KIZIL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    NörolojiHaliç Üniversitesi

    Psikoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET BAYHAN ÜGE