Geri Dön

Sütlerde bulunan metisiline dirençli Staphylococcus aureus'un PCR yöntemi ile tespit edilmesi ve SCCmec tiplendirilmesi

Determination of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in milk by PCR method and SCCmec typing

PDF İndir

  1. Tez No: 304435
  2. Yazar: GHASSAN ISSA AHMAD NASSASRA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HARUN AKSU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Besin Hijyeni ve Teknolojisi, Food Hygiene and Technology
  6. Anahtar Kelimeler: Süt, PCR, S. aureus, MRSA, SCCmec, Metisilin, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Staphylococcus aureus, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Milk, PCR, S. aureus, MRSA, SCCmec, Methicillin, Polymerase chain reaction, Staphylococcus aureus, Drug resistance, Drug resistance-microbial
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Staphylococcus aureus, mastitisin en önemli nedenlerinden biridir ve insanlarda nozokomiyal ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara neden olmaktadırlar. Özellikle metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) enfeksiyonları temas veya hayvansal kökenli gıdaların tüketimiyle bulaşabilmektedir. S. aureus'ta metisiline direnç, mecA geni tarafından kodlanmakta ve stafilokoksik kaset kromozomu mec (SCCmec) adı verilen hareketli genetik eleman üzerinde bulunmaktadır.Bu çalışma ile kültürel ve moleküler biyolojik teknikler kullanılarak direkt sütten veya sütten izole edilen MRSA suşlarından mecA geninin tespit edilmesi ve SCCmec tiplendirilmesi amaçlanmıştır. İstanbul bölgesinden 406 çiğ süt örneği farklı dönemlerde toplanmıştır. Örnekler iki gruba bölünmüş, birinci gruptakilerde kültürel yöntemlerin ardından, ikinci gruba girenlerde ise direkt sütten PCR yöntemi ile mecA tespiti ve SCCmec tiplendirilmesi yapılmıştır.406 süt örneğinden 119 (% 29,31) S. aureus suşu izole edilirken bunlardan sadece birinin (% 0,84) MRSA olduğu, PCR ile yapılan moleküler çalışmalar sonucunda ise 406 örneğin 11 (% 2,70)'inde direkt genotipik olarak mecA geni tespit edildiği saptanmıştır. İzolat kaynaklı tek suşun Tip IV olduğu belirlenirken, sütten tespit edilen 11 mecA geninden iki (% 18,18) adedi Tip II, yedi (% 63,63) adedi Tip IV, iki (% 18,18) adedi ise Tip V olarak belirlenmiştir. S. aureus izolatı kaynaklı tek mecA geninin (Tip IV) toplum kökenli MRSA olduğu, süt kaynaklı 11 mecA geninden iki (% 18,18) adedinin hastane kökenli MRSA (Tip-II), 9 (% 81,82) adedinin ise toplum kökenli MRSA olduğu değerlendirilmiştir.Bu sonuçlar doğrultusunda, genotipik yöntemlerin fenotipik yöntemlere nazaran daha yüksek oranda MRSA tespitini sağladığı, direkt gıda maddesinden genotipik yöntemle mecA geni tespit etmek suretiyle daha güvenilir sonuçların elde edileceği değerlendirilmiş, bu konuda çalışmaların yaygınlaştırılmasının, daha güvenilir gıdaların tüketimi ve halk sağlığının korunması açısından büyük önem taşıdığı sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Staphylococcus aureus is one of the causal agents of mastitis and can cause nosocomial and community-acquired infections. Especially, methicillin-resistant S. aureus (MRSA) have become recognized that eating and handling of contaminated food is a potential vehicle for transmission. The MRSA strains carry staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec), a mobile genetic element harboring mecA gene that encodes methicillin resistance in staphylococci.In this study, it was aimed to obtain MRSA species from milk by using both conventional and molecular technics. Also, it was aimed to determine mecA gene and typing of the mentioned gene. According to this purpose, 406 raw milk samples were collected from Istanbul and divided into 2 groups. In the first group, conventional microbiological analysis and molecular analysis were applied while in the second group were applied the molecular analysis directly from milk. For determining mecA gene from milk both conventional and molecular methods by PCR were used and finally SCCmec typing was performed.S. aureus were isolated from 119 (29.31%) of 406 samples analyzed. Only one (0.84%) of 119 strain was detected as MRSA. This strain was belong to Type IV. On the other hand, PCR results directly from milk showed that mecA gen was found in 11 (2.7%) of 406 samples. Typing of the genes were Type II (%18.18 / 2 samples of 11), Type IV (%63.63 / 7 samples of 11), and Type V (%18.18 / 2 samples of 11). In addition, only one mecA gene (Type IV) positive MRSA was determined as community-acquired. However, 2 (18.18%) type were determined as healthcare-associated and 9 (81.82%) type were determined as community-acquired MRSA directly from milk.According to the results, genotyping methods by using PCR provide more precise detection of MRSA than the fenotyping methods. Also, more reliable results were obtained to detect mecA from food. In conclusion, studies on this topic should be expanded for food safety and public health.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    722627

    Tüketim amacıyla piyasada bulunan çiğ ve pastörize sütlerde enterotoksijenik staphylococcus aureus ve enterotoksinlerinin araştırılması

    Investigation of enterotoxigenic staphylococcus aureus and enterotoxins in RAW an pasteurized milk available in the market for consumption

    RECEP GEÇKİNLİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEYYAL AK

  2. Tez No

    193828

    Çiğ sütlerde termofilik campylobacter türlerinin varlığı

    Occurrence of thermophilic campylobacter spp. in raw milk

    ERDEM ÖRMECİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAnkara Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. HAYDAR ÖZDEMİR

  3. Tez No

    357190

    Diyarbakır ilinden elde edilen sütlerde bazı biyokimyasal parametrelerin mevsimsel ve aylık değişimlerinin belirlenmesi

    Determination of seasonal and monthly changes of some biochemical parameters in milk obtained from Diyarbakir province

    DİLEK GAYRETLİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Gıda MühendisliğiTunceli Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALPER GÜVEN

  4. Tez No

    1014165

    Sade ve katkılı UHT sütlerde hidroksimetilfurfural (HMF) düzeylerinin araştırılması

    Investigation of hydroxymethylfurfural (HMF) levels in plain and supplemented uht milks

    HAYRİYE DÜLGER ÇETİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    Veterinerlik Gıda Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN ALEMDAR

  5. Tez No

    158347

    Ankara piyasasınsda satılan sütlerde bazı antibiyotik kalıntıları

    Some antibiotic residues in milk samples which marketing in Ankara

    FÜSUN KARAÇAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SEZAİ KAYA

Geri Dön