Proteomik ile haşhaşta morfin yolak analizi
Morphine pathway analysis in poppy with proteomics
- Tez No: 820367
- Danışmanlar: PROF. DR. MİNE TÜRKTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 118
Özet
Haşhaş (Papaver somniferum L.), birçok kullanım alanına sahip tıbbi ve endüstriyel bir bitki türüdür. En büyük önemi, kendisine özel ürettiği çok güçlü farmakolojik özelliklere sahip benzilizokinolin alkaloidlerden (BIA) kaynaklanmaktadır. Sekonder metabolitlerin yapısal olarak farklı bir grubunu oluşturan benzilizokinolin alkaloidleri (BIA), narkotik analjezik olarak kullanılan morfin ve kodein, anti-kanser ve anti-viral etki gösteren noskapin gibi birçok önemli alkaloidi içermektedir. Bu nedenle de haşhaş, ilaç endüstrisinde kullanılan doğal ürün kaynaklarından birisidir ve üzerine yapılacak çalışmalar büyük önem teşkil etmektedir. Günümüze kadar haşhaş bitkisi ile yapılan çalışmalar, belli bir aşama kaydetmiş olmasına rağmen haşhaşın farklı organlarındaki protein profillerinin, BIA metabolik yolakları üzerine etkisi hakkında literatürde bir veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, Toprak Mahsulleri Ofisi tarafından geliştirilen yüksek morfin ve noskapin içeriğine sahip çeşitler ile kontrol çeşidi kullanılmış olup bitkinin gövdesinden ve kapsülünden protein izolasyonları yapılmıştır. Yapılan izolasyonlar sonucunda LC-MS/MS yöntemi ile elde edilen protein profillerinin, gen ontolojileri ve yolak analizleri incelenmiş ardından biyoinformatik araçlar ile protein-protein etkileşimlerine bakılmıştır. Çalışmanın sonucunda BIA yolaklarında rol oynayan ortak ve farklı proteinler belirlenirken çeşitler arasındaki morfin ve noskapin içerik farklılıklarının farklı organlarda protein düzeyinde ne gibi değişiklikler meydana getirdiği ortaya çıkarılmıştır.
Özet (Çeviri)
Poppy (Papaver somniferum L.) is a medicinal and industrial plant species with many uses. Its greatest importance is due to the benzylisoquinoline alkaloids (BIA) with very strong pharmacological properties which is produced specifically by poppy. Benzylisoquinoline alkaloids (BIA), which form a structurally different group of secondary metabolites, contain many important alkaloids such as morphine and codeine, which are used as narcotic analgesics, and noscapine, which have anti-cancer and anti-viral effects. For this reason, poppy is one of the natural product sources used in the pharmaceutical industry and studies on it are of great importance. Although studies with poppy plant have made a certain progress to date, there is no data in the literature about the effect of protein profiles in different organs of poppy on BIA metabolic pathways. In this study, cultivars with high morphine and noscapine content developed by Turkish Grain Board and control cultivar were used, and protein isolations were made from the stem and capsule of the plant. As a result of the isolations, gene ontologies and pathway analyzes of protein profiles obtained by LC-MS/MS method were examined and then protein-protein interactions were examined using bioinformatics tools. As a result of the study, while determining the common and different proteins that play a role in the BIA pathways, it was revealed what changes in the protein level in different organs were caused by the differences in morphine and noscapine content between the cultivars.
Benzer Tezler
- Oral liken planus ve oral lökoplaki hastalarında protein profillerinin karşılaştırmalı proteomik ile belirlenmesi
Identification of protein profiles in oral lichen planus and oral leukoplakia patients by comparative proteomics
ALİCAN KURAN
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2025
Diş HekimliğiKocaeli ÜniversitesiAğız, Diş ve Çene Radyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENVER ALPER SİNANOĞLU
- Kırka bor madeninden izole edilen Bacillus aquimaris'e benzer bir izolatın bor'a bağlı proteomik analizi
Proteomic analysis of highly boron tolerant bacterium isolated from Kirka boron mine and is similar to Bacillus aquimaris
BİLGE UÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyokimyaMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL
- Çocuklarda total tükürük proteinlerinin proteomik analizi ve değerlendirilmesi
Proteomic analysis and evalution of whole salivary proteins in children
MELTEM BAKKAL
- Alzheimer hastalığında serum proteomik analizleri ile yeni biyobelirteçlerin araştırılması
Discovery of new biomarkers through serum proteomics in alzheimers disease
YAVUZ AYHAN
Doktora
Türkçe
2023
NörolojiHacettepe ÜniversitesiNörolojik ve Psikiyatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYGÜN ERTUĞRUL
- Faj K'nın yapısal karakterizasyonu ile proteomik yaklaşım geliştirilmesi
Developing a proteomic approach through structural characterization of phage K
BEHLİS ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜLİN ÖZBEK