Multipl skleroz hastalarında PADI2 gen polimorfik varyantlarının analizi
Analysis of PADI2 gene polymorphic variants in multiple sclerosis patients
- Tez No: 862441
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MALİK EJDER YILDIRIM
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Multiple skleroz (MS) sıklıkla genç erişkinlikte görülen merkezi sinir sisteminin kronik, inflamatuar, demiyelinizan ve nörodejeneratif hastalığıdır. MS etiyolojisi net bir şekilde aydınlatılamamış olsada genetik ve çevresel faktörlerin kompleks etkileşimi sonucu ortaya çıktığı düşünülmektedir. PAD2 temel bir miyelin bileşeni olan miyelin bazik proteini (MBP) sitrüline etmektedir. MBP sitrülinasyonunun, demiyelinizasyona ve immun sistemin tetiklenmesine yol açarak MS patogenezinde rol oynadığı düşünülmektedir. Biz de bu çalışmamızda MS hastalarında PAD2'yi kodlayan PADI2 gen varyantlarını analiz ederek bu varyantların MS ile ilişkisini ortaya koymayı amaçladık. Çalışmamıza MS tanılı 100 hasta ve 100 sağlıklı birey dahil edildi. Hastaların; EDSS skorları, klinik grup bilgileri ile cinsiyet ve yaşları kaydedildi. Hasta ve kontrol grubundan alınan periferik kan örneklerinden DNA izolasyonu yapıldı ve real time-PCR yöntemi ile PADI2 geni rs2076615, rs2057094, rs2235926 polimorfizmleri analiz edildi. Çalışmamız sonucunda, hasta ve kontroller arasında rs2076615 polimorfizminin genotip dağılımı ve allel frekansları açısından farklılıkları istatiksel olarak anlamlı bulunmuştur. (p=0,004, p=0,001). Sonuçlarımıza göre rs2076615 polimorfizmi C alleli ve CC genotipi MS açısından risk oluşturmaktadır. rs2057094 polimorfizminde hasta ve kontrol grubu arasında genotip dağılımı açısından istatiksel farklılık anlamlı saptanmıştır (p=0,001). rs2057094 polimorfizmi CC+CT genotipleri MS için risk oluşturmaktadır. Allel frekansları dağılımında ise anlamlı bir farklılık görülmedi (p>0,05). rs2235926 polimorfizminin ise genotip dağılımları ve allel frekansları MS ile anlamlı bir ilişki göstermedi (p>0,05). Ancak, otozomal dominant (OD) kalıtım modeline göre hasta ve kontrol grupları kıyaslandığında hastalarda TC+CC oranı kontrollere göre anlamlı ölçüde yüksekti (p=0,046). Bu bağlamda, OD kalıtım modeli temelinde rs2235926 polimorfizmi TC ve CC genotiplerine sahip kişilerin MS açısından bir risk taşıdığı söylenebilir. Sonuçlarımıza göre PADI2 geni rs2235926, rs2057094, rs2076615 polimorfizmleri ile MS arasında anlamlı bir ilişki tespit edildi. Verilerimiz bu varyantların ilgili genin ekspresyonunu pozitif yönde etkileyerek MS için risk faktörü olduğunu düşündürmektedir. Farklı popülasyonlarda yapılacak daha kapsamlı çalışmalar PADI2 gen varyantlarının MS ile ilişkisinin doğrulanması ve bu varyantların PAD2 protein düzeyine etkisi ve olası gen terapisi açısından faydalı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Multiple sclerosis (MS) is a chronic, inflammatory, demyelinating and neurodegenerative disease of the central nervous system that is often seen in young adulthood. Although the etiology of MS has not been clearly elucidated, it is thought to occur as a result of the complex interaction of genetic and environmental factors. PAD2 citrullinates myelin basic protein (MBP), an essential component of myelin. MBP citrullination is thought to play a role in the pathogenesis of MS by causing demyelination and triggering the immune system. In this study, we aimed to analyzethe PADI2 gene variantsthatencode PAD2 in MS patients and to reveal the relationship of these variants with MS. 100 patients diagnosed with MS and 100 healthy individuals were included in our study. EDSS scores, clinical group information, gender and age of the patients were recorded. DNA was isolated from peripheral blood samples taken from the patient and control groups, and rs2076615, rs2057094, rs2235926 polymorphisms of PADI2 gene were analyzed by real time-PCR method. As a result of our study, the differences between patients and controls in terms of genotype distribution and allele frequencies for rs2076615 polymorphism were found to be statistically significant (p=0,004, p=0,001). According to our results, rs2076615 polymorphism C allele and CC genotype have a risk for MS. A significant difference was detected in the rs2057094 polymorphism between the patient and control groups in terms of genotype distribution (p=0,001). rs2057094 polymorphism CC+CT genotypes poses a risk for MS. There was no significant difference in the distribution of allele frequencies (p>0.05). Genotype distributions and allele frequencies of rs2235926 polymorphism did not show a significant relationship with MS (p>0.05). However, when the patient and control groups were compared according to the autosomal dominant (AD) inheritance model, the TC+CC rate in patients was significantly higher than in controls (p = 0.046). In this context, on the basis of AD inheritance model, it can be said that people with the TC and CC genotypes of the rs2235926 polymorphismhave a risk for MS. According to our results, a significant relationship was detected between PADI2 gene rs2235926, rs2057094, rs2076615 polymorphisms and MS. Our data suggest that these variants are risk factors for MS by affecting the expression of the relevant gene positively. More comprehensive studies in different populations will be useful to confirm the relationship of PADI2 gene variants with MS and in terms of the effect of these variants on PAD2 protein levels and possible gene therapy.
Benzer Tezler
- Multipl skleroz hastalarında başağrısı şikayeti ve homosistein düzeyleri arasındaki ilişki
Relationship between headache occurence and homocysteine levels in multiple sclerosis
TUBA ANIK
- Multipl Skleroz hastalarında BDNF geni mRNA ekspresyonu ile hsa-miR-10a-5p ve hsa-miR-429-3p ekspresyonları arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between BDNF gene mRNA expression and hsa-miR-10a-5p and hsa-miR-429-3p expression in Multiple Sclerosis patients
ECEM AYŞEGÜL SARIALİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Genetikİstinye ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURADİYE ACAR
- Multipl skleroz hastalarında transorbital sonografi ile ölçülen optik sinir çapının ve optik sinir kılıf çapının klinik, radyolojik ve elektrofizyolojik parametreler ile ilişkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of the relationship between optic nerve diameter and optic nerve sheath diameter measured by transorbital sonography with clinical, radiological, and electrophysiological parameters in multiple sclerosis patients
GÜNGÖR ÇAKMAKCI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
NörolojiKütahya Sağlık Bilimleri ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ÇETİNER
- Multipl skleroz hastalarında aile desteğinin hastalık algısı üzerine etkisi
The effect of family support on illness perception in multiple sclerosis patients
NEDİM EŞKİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Aile Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEN FENERCİOĞLU
- Multipl skleroz hastalarında alt ekstremite pozisyon testinin geçerlilik ve güvenilirlik çalışması
Validity and reliability of lower extremity position test in patients with multiple sclerosis
CELAL BATUHAN GÜNEYSU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Fizyoterapi ve RehabilitasyonPamukkale ÜniversitesiFizik Tedavi ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ ALTUĞ